Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC38.41■■■■□ 3.74
ATP10AO60312 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
ATP10AO60312 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
ATP10AO60312 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
ATP10AO60312 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
ATP10AO60312 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
ATP10AO60312 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
ATP10AO60312 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
ATP10AO60312 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ATP10AO60312 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
ATP10AO60312 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ATP10AO60312 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ATP10AO60312 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ATP10AO60312 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ATP10AO60312 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ATP10AO60312 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ATP10AO60312 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ATP10AO60312 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ATP10AO60312 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ATP10AO60312 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ATP10AO60312 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ATP10AO60312 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ATP10AO60312 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
ATP10AO60312 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
ATP10AO60312 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
ATP10AO60312 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
ATP10AO60312 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
ATP10AO60312 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ATP10AO60312 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ATP10AO60312 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ATP10AO60312 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ATP10AO60312 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
ATP10AO60312 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ATP10AO60312 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ATP10AO60312 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ATP10AO60312 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
ATP10AO60312 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
ATP10AO60312 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
ATP10AO60312 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ATP10AO60312 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ATP10AO60312 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ATP10AO60312 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
ATP10AO60312 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
ATP10AO60312 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ATP10AO60312 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ATP10AO60312 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ATP10AO60312 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC38.21■■■■□ 3.71
ATP10AO60312 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ATP10AO60312 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ATP10AO60312 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ATP10AO60312 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
ATP10AO60312 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
ATP10AO60312 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
ATP10AO60312 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
ATP10AO60312 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
ATP10AO60312 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ATP10AO60312 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ATP10AO60312 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ATP10AO60312 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ATP10AO60312 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
ATP10AO60312 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
ATP10AO60312 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
ATP10AO60312 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
ATP10AO60312 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
ATP10AO60312 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
ATP10AO60312 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
ATP10AO60312 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
ATP10AO60312 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
ATP10AO60312 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
ATP10AO60312 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
ATP10AO60312 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
ATP10AO60312 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
ATP10AO60312 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ATP10AO60312 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ATP10AO60312 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
ATP10AO60312 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
ATP10AO60312 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
ATP10AO60312 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
ATP10AO60312 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
ATP10AO60312 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
ATP10AO60312 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
ATP10AO60312 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
ATP10AO60312 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
ATP10AO60312 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
ATP10AO60312 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
ATP10AO60312 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
ATP10AO60312 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
ATP10AO60312 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
ATP10AO60312 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
ATP10AO60312 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
ATP10AO60312 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
ATP10AO60312 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
ATP10AO60312 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
ATP10AO60312 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
ATP10AO60312 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.69
ATP10AO60312 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
ATP10AO60312 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
ATP10AO60312 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
ATP10AO60312 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
ATP10AO60312 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms