Protein–RNA interactions for Protein: O15480

MAGEB3, Melanoma-associated antigen B3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEB3O15480 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEB3O15480 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEB3O15480 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEB3O15480 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEB3O15480 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEB3O15480 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEB3O15480 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEB3O15480 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEB3O15480 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEB3O15480 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEB3O15480 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEB3O15480 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEB3O15480 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEB3O15480 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEB3O15480 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEB3O15480 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEB3O15480 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEB3O15480 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEB3O15480 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEB3O15480 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEB3O15480 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEB3O15480 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEB3O15480 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEB3O15480 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEB3O15480 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEB3O15480 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEB3O15480 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEB3O15480 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEB3O15480 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEB3O15480 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEB3O15480 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEB3O15480 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEB3O15480 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEB3O15480 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEB3O15480 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEB3O15480 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEB3O15480 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEB3O15480 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEB3O15480 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEB3O15480 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEB3O15480 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAGEB3O15480 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAGEB3O15480 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAGEB3O15480 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAGEB3O15480 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAGEB3O15480 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAGEB3O15480 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAGEB3O15480 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAGEB3O15480 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAGEB3O15480 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAGEB3O15480 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAGEB3O15480 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAGEB3O15480 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAGEB3O15480 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAGEB3O15480 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAGEB3O15480 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAGEB3O15480 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAGEB3O15480 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAGEB3O15480 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAGEB3O15480 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAGEB3O15480 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAGEB3O15480 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAGEB3O15480 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAGEB3O15480 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAGEB3O15480 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAGEB3O15480 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAGEB3O15480 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAGEB3O15480 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAGEB3O15480 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEB3O15480 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEB3O15480 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAGEB3O15480 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAGEB3O15480 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAGEB3O15480 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAGEB3O15480 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAGEB3O15480 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAGEB3O15480 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAGEB3O15480 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAGEB3O15480 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms