Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms