Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NACAE9PAV3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NACAE9PAV3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NACAE9PAV3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms