Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRN3E7EW58 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRN3E7EW58 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRN3E7EW58 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRN3E7EW58 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRN3E7EW58 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRN3E7EW58 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRN3E7EW58 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRN3E7EW58 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRN3E7EW58 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRN3E7EW58 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRN3E7EW58 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRN3E7EW58 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRN3E7EW58 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN3E7EW58 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN3E7EW58 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN3E7EW58 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN3E7EW58 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN3E7EW58 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRN3E7EW58 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRN3E7EW58 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN3E7EW58 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN3E7EW58 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN3E7EW58 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN3E7EW58 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN3E7EW58 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN3E7EW58 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN3E7EW58 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN3E7EW58 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN3E7EW58 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN3E7EW58 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN3E7EW58 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRN3E7EW58 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRN3E7EW58 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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