Protein–RNA interactions for Protein: A8KAH6

HSPB2, Heat shock 27kDa protein 2, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB2A8KAH6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPB2A8KAH6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HSPB2A8KAH6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSPB2A8KAH6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSPB2A8KAH6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSPB2A8KAH6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HSPB2A8KAH6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSPB2A8KAH6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSPB2A8KAH6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSPB2A8KAH6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSPB2A8KAH6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HSPB2A8KAH6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSPB2A8KAH6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSPB2A8KAH6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPB2A8KAH6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPB2A8KAH6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPB2A8KAH6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPB2A8KAH6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPB2A8KAH6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPB2A8KAH6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPB2A8KAH6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPB2A8KAH6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPB2A8KAH6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPB2A8KAH6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPB2A8KAH6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPB2A8KAH6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPB2A8KAH6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPB2A8KAH6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPB2A8KAH6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPB2A8KAH6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSPB2A8KAH6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms