Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TVP23AA6NH52 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TVP23AA6NH52 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TVP23AA6NH52 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TVP23AA6NH52 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TVP23AA6NH52 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TVP23AA6NH52 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TVP23AA6NH52 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TVP23AA6NH52 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TVP23AA6NH52 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TVP23AA6NH52 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TVP23AA6NH52 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TVP23AA6NH52 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TVP23AA6NH52 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TVP23AA6NH52 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TVP23AA6NH52 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TVP23AA6NH52 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TVP23AA6NH52 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TVP23AA6NH52 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TVP23AA6NH52 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TVP23AA6NH52 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TVP23AA6NH52 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TVP23AA6NH52 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TVP23AA6NH52 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TVP23AA6NH52 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TVP23AA6NH52 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TVP23AA6NH52 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TVP23AA6NH52 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TVP23AA6NH52 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TVP23AA6NH52 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms