Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
STRCP1A6NGW2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
STRCP1A6NGW2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
STRCP1A6NGW2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
STRCP1A6NGW2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
STRCP1A6NGW2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
STRCP1A6NGW2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
STRCP1A6NGW2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
STRCP1A6NGW2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
STRCP1A6NGW2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
STRCP1A6NGW2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
STRCP1A6NGW2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.2■■■■□ 3.39
STRCP1A6NGW2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.38
STRCP1A6NGW2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
STRCP1A6NGW2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
STRCP1A6NGW2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
STRCP1A6NGW2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
STRCP1A6NGW2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
STRCP1A6NGW2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
STRCP1A6NGW2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
STRCP1A6NGW2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
STRCP1A6NGW2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
STRCP1A6NGW2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
STRCP1A6NGW2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
STRCP1A6NGW2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
STRCP1A6NGW2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
STRCP1A6NGW2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
STRCP1A6NGW2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
STRCP1A6NGW2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
STRCP1A6NGW2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
STRCP1A6NGW2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
STRCP1A6NGW2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
STRCP1A6NGW2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
STRCP1A6NGW2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
STRCP1A6NGW2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
STRCP1A6NGW2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
STRCP1A6NGW2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
STRCP1A6NGW2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
STRCP1A6NGW2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
STRCP1A6NGW2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
STRCP1A6NGW2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
STRCP1A6NGW2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
STRCP1A6NGW2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
STRCP1A6NGW2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
STRCP1A6NGW2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
STRCP1A6NGW2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
STRCP1A6NGW2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
STRCP1A6NGW2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
STRCP1A6NGW2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
STRCP1A6NGW2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
STRCP1A6NGW2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
STRCP1A6NGW2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
STRCP1A6NGW2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
STRCP1A6NGW2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
STRCP1A6NGW2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
STRCP1A6NGW2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
STRCP1A6NGW2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
STRCP1A6NGW2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
STRCP1A6NGW2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.02■■■■□ 3.36
STRCP1A6NGW2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
STRCP1A6NGW2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
STRCP1A6NGW2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
STRCP1A6NGW2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
STRCP1A6NGW2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
STRCP1A6NGW2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
STRCP1A6NGW2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
STRCP1A6NGW2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
STRCP1A6NGW2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
STRCP1A6NGW2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
STRCP1A6NGW2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
STRCP1A6NGW2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
STRCP1A6NGW2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms