Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VWA3AA6NCI4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VWA3AA6NCI4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VWA3AA6NCI4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VWA3AA6NCI4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VWA3AA6NCI4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VWA3AA6NCI4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
VWA3AA6NCI4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VWA3AA6NCI4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
VWA3AA6NCI4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
VWA3AA6NCI4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VWA3AA6NCI4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VWA3AA6NCI4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VWA3AA6NCI4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VWA3AA6NCI4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VWA3AA6NCI4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VWA3AA6NCI4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VWA3AA6NCI4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VWA3AA6NCI4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VWA3AA6NCI4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VWA3AA6NCI4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VWA3AA6NCI4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VWA3AA6NCI4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VWA3AA6NCI4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VWA3AA6NCI4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VWA3AA6NCI4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VWA3AA6NCI4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VWA3AA6NCI4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VWA3AA6NCI4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VWA3AA6NCI4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VWA3AA6NCI4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VWA3AA6NCI4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VWA3AA6NCI4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VWA3AA6NCI4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VWA3AA6NCI4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VWA3AA6NCI4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VWA3AA6NCI4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VWA3AA6NCI4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VWA3AA6NCI4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VWA3AA6NCI4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VWA3AA6NCI4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VWA3AA6NCI4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VWA3AA6NCI4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VWA3AA6NCI4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VWA3AA6NCI4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VWA3AA6NCI4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VWA3AA6NCI4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VWA3AA6NCI4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VWA3AA6NCI4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VWA3AA6NCI4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VWA3AA6NCI4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VWA3AA6NCI4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VWA3AA6NCI4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VWA3AA6NCI4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VWA3AA6NCI4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VWA3AA6NCI4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VWA3AA6NCI4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VWA3AA6NCI4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VWA3AA6NCI4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VWA3AA6NCI4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VWA3AA6NCI4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VWA3AA6NCI4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms