Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRD1A4D1F6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRD1A4D1F6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRD1A4D1F6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRD1A4D1F6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRD1A4D1F6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRD1A4D1F6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRD1A4D1F6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRD1A4D1F6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRD1A4D1F6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRD1A4D1F6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRD1A4D1F6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRD1A4D1F6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRD1A4D1F6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRD1A4D1F6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRD1A4D1F6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRD1A4D1F6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRD1A4D1F6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRD1A4D1F6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRD1A4D1F6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRD1A4D1F6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRD1A4D1F6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRD1A4D1F6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRD1A4D1F6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRD1A4D1F6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRD1A4D1F6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRD1A4D1F6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRD1A4D1F6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRD1A4D1F6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRD1A4D1F6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRD1A4D1F6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRD1A4D1F6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRD1A4D1F6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRD1A4D1F6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRD1A4D1F6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRD1A4D1F6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRD1A4D1F6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRD1A4D1F6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRD1A4D1F6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRD1A4D1F6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRD1A4D1F6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRD1A4D1F6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRD1A4D1F6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms