RNA–Protein interactions for RNA: tW(UCA)Q

tW(UCA)Q, Transcript of Mitochondrial tRNA, annotated as tryptophanyl tRNA (tRNA-Trp), yeastyeast

Gene tW(UCA)Q, Length 74 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(UCA)QtW(UCA)Q MTC1P47018 478 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
tW(UCA)QtW(UCA)Q DRS1P32892 752 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
tW(UCA)QtW(UCA)Q FAP1P53971 965 aa9.56□□□□□ -0.88
tW(UCA)QtW(UCA)Q PRY3P47033 881 aa8.97□□□□□ -0.97
tW(UCA)QtW(UCA)Q PRI1P10363 409 aa8.96□□□□□ -0.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q AAD16Q02895 342 aa8.94□□□□□ -0.98
tW(UCA)QtW(UCA)Q ISW2Q08773 1120 aa8.81□□□□□ -1
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPG1P38249 964 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
tW(UCA)QtW(UCA)Q DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
tW(UCA)QtW(UCA)Q HAA1Q12753 694 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
tW(UCA)QtW(UCA)Q YCK3P39962 524 aa8.43□□□□□ -1.06
tW(UCA)QtW(UCA)Q TSR3Q12094 313 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
tW(UCA)QtW(UCA)Q RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
tW(UCA)QtW(UCA)Q AVT3P36062 692 aa8.24□□□□□ -1.09
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRPL32P25348 183 aa8.15□□□□□ -1.1
tW(UCA)QtW(UCA)Q REB1P21538 810 aa8.04□□□□□ -1.12
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL17AP05740 184 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL17BP46990 184 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
tW(UCA)QtW(UCA)Q BFR2Q06631 534 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
tW(UCA)QtW(UCA)Q YGL015CP33199 130 aa7.89□□□□□ -1.15
tW(UCA)QtW(UCA)Q SPT21P35209 758 aa7.7□□□□□ -1.18
tW(UCA)QtW(UCA)Q CDC27P38042 758 aa7.64□□□□□ -1.19
tW(UCA)QtW(UCA)Q YKR023WP36119 530 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
tW(UCA)QtW(UCA)Q UBP10P53874 792 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
tW(UCA)QtW(UCA)Q TFC8Q12308 588 aa7.5□□□□□ -1.21
tW(UCA)QtW(UCA)Q RIM101P33400 625 aa7.43□□□□□ -1.22
tW(UCA)QtW(UCA)Q MAP2P38174 421 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
tW(UCA)QtW(UCA)Q HOP09932 586 aa7.42□□□□□ -1.22
tW(UCA)QtW(UCA)Q DCD1P06773 312 aa7.35□□□□□ -1.23
tW(UCA)QtW(UCA)Q TIF4632P39936 914 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
tW(UCA)QtW(UCA)Q SCY1P53009 804 aa7.27□□□□□ -1.25
tW(UCA)QtW(UCA)Q BUD31P25337 157 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
tW(UCA)QtW(UCA)Q SLX5P32828 619 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
tW(UCA)QtW(UCA)Q TGL3P40308 642 aa7.24□□□□□ -1.25
tW(UCA)QtW(UCA)Q BCH2P36122 765 aa7.23□□□□□ -1.25
tW(UCA)QtW(UCA)Q TFA1P36100 482 aa7.13□□□□□ -1.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q OXP1P28273 1286 aa7.12□□□□□ -1.27
tW(UCA)QtW(UCA)Q YIL055CP40523 627 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
tW(UCA)QtW(UCA)Q UBP9P39967 754 aa7.07□□□□□ -1.28
tW(UCA)QtW(UCA)Q PTP3P40048 928 aa7.04□□□□□ -1.28
tW(UCA)QtW(UCA)Q EPS1P40557 701 aa7.04□□□□□ -1.28
tW(UCA)QtW(UCA)Q BDF1P35817 686 aa7.02□□□□□ -1.29
tW(UCA)QtW(UCA)Q BBC1P47068 1157 aa6.97□□□□□ -1.29
tW(UCA)QtW(UCA)Q RSM7P47150 247 aa6.97□□□□□ -1.29
tW(UCA)QtW(UCA)Q MST1P07236 462 aa6.93□□□□□ -1.3
tW(UCA)QtW(UCA)Q NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data6.93□□□□□ -1.3not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q AI2P03876 854 aa6.89□□□□□ -1.31
tW(UCA)QtW(UCA)Q SIS1P25294 352 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
tW(UCA)QtW(UCA)Q YOR238WQ08634 303 aa6.88□□□□□ -1.31
tW(UCA)QtW(UCA)Q YAH1Q12184 172 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
tW(UCA)QtW(UCA)Q YAP5P40574 245 aa6.82□□□□□ -1.32
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR271WQ06152 274 aa6.8□□□□□ -1.32
tW(UCA)QtW(UCA)Q ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data6.75□□□□□ -1.33not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q PSD2P53037 1138 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q YBL029C-AQ3E756 94 aa6.73□□□□□ -1.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q SSP1P38871 571 aa6.72□□□□□ -1.33
tW(UCA)QtW(UCA)Q VNX1P42839 908 aa6.7□□□□□ -1.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q SPP1Q03012 353 aa6.65□□□□□ -1.34
tW(UCA)QtW(UCA)Q GTT3P39996 337 aa6.64□□□□□ -1.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRM1P25270 412 aa6.62□□□□□ -1.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q TIF11P38912 153 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q MGA2P40578 1113 aa6.6□□□□□ -1.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q WSC3Q12215 556 aa6.6□□□□□ -1.35
tW(UCA)QtW(UCA)Q YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data6.55□□□□□ -1.36not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q MSB4Q12317 492 aa6.55□□□□□ -1.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q RTG3P38165 486 aa6.54□□□□□ -1.36
tW(UCA)QtW(UCA)Q EAP1P36041 632 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q CST9Q06032 482 aa6.52□□□□□ -1.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q FKH1P40466 484 aa6.51□□□□□ -1.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q VPS29P38759 282 aa6.5□□□□□ -1.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q ULI1P43604 169 aa6.5□□□□□ -1.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q PIB1Q06651 286 aa6.5□□□□□ -1.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q AIR2Q12476 344 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q YJL171CP46992 396 aa6.49□□□□□ -1.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q IOC2Q12072 812 aa6.48□□□□□ -1.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q DBP1P24784 617 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q LDB19Q12502 818 aa6.47□□□□□ -1.37
tW(UCA)QtW(UCA)Q SAM3Q08986 587 aa6.44□□□□□ -1.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q VMA1P17255 1071 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q YOL036WQ08206 761 aa6.43□□□□□ -1.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q STS1P38637 319 aa6.42□□□□□ -1.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q ABP1P15891 592 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q SET4P42948 560 aa6.4□□□□□ -1.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q BMT6Q12291 365 aa6.4□□□□□ -1.38
tW(UCA)QtW(UCA)Q YFR006WP43590 535 aa6.39□□□□□ -1.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q TRP5P00931 707 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q SEC61P32915 480 aa6.38□□□□□ -1.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q YNL035CP53962 389 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q RTG1P32607 177 aa6.36□□□□□ -1.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q RCR1P38212 213 aa6.36□□□□□ -1.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q NCR1Q12200 1170 aa6.35□□□□□ -1.39
tW(UCA)QtW(UCA)Q JIP4Q03361 876 aa6.33□□□□□ -1.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q TFG1P41895 735 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q GYP5Q12344 894 aa6.31□□□□□ -1.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q HTA1P04911 132 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q HTA2P04912 132 aa6.28□□□□□ -1.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q DAN4P47179 1161 aa6.27□□□□□ -1.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q MAK11P20484 414 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q PTC4P38089 393 aa6.26□□□□□ -1.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q YEL023CP39992 682 aa6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 557.1 ms