RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611854.4

C8orf59-207, Transcript of chromosome 8 open reading frame 59, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C8orf59, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf59-207ENST00000611854 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
C8orf59-207ENST00000611854 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.92■■■□□ 2.86
C8orf59-207ENST00000611854 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
C8orf59-207ENST00000611854 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
C8orf59-207ENST00000611854 FOXD1Q16676 465 aa27.52■■■□□ 2
C8orf59-207ENST00000611854 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.28■■□□□ 1.8
C8orf59-207ENST00000611854 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.82■■□□□ 1.72
C8orf59-207ENST00000611854 ADRA2BP18089 450 aa25.74■■□□□ 1.71
C8orf59-207ENST00000611854 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
C8orf59-207ENST00000611854 MSH5O43196 834 aa25.63■■□□□ 1.69
C8orf59-207ENST00000611854 POTEDQ86YR6 584 aa25■■□□□ 1.59
C8orf59-207ENST00000611854 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
C8orf59-207ENST00000611854 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.39■■□□□ 1.33
C8orf59-207ENST00000611854 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
C8orf59-207ENST00000611854 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.1■■□□□ 1.29
C8orf59-207ENST00000611854 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.59■■□□□ 1.21
C8orf59-207ENST00000611854 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
C8orf59-207ENST00000611854 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.46■■□□□ 1.19
C8orf59-207ENST00000611854 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
C8orf59-207ENST00000611854 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
C8orf59-207ENST00000611854 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
C8orf59-207ENST00000611854 NPM3O75607 178 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
C8orf59-207ENST00000611854 RNF39Q9H2S5 420 aa21.93■■□□□ 1.1
C8orf59-207ENST00000611854 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.65■■□□□ 1.06
C8orf59-207ENST00000611854 KCNA4P22459 653 aa21.61■■□□□ 1.05
C8orf59-207ENST00000611854 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
C8orf59-207ENST00000611854 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
C8orf59-207ENST00000611854 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
C8orf59-207ENST00000611854 SLC4A2P04920 1241 aa20.96■□□□□ 0.95
C8orf59-207ENST00000611854 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
C8orf59-207ENST00000611854 CAPN15O75808 1086 aa20.7■□□□□ 0.9
C8orf59-207ENST00000611854 DSG3P32926 999 aa20.57■□□□□ 0.88
C8orf59-207ENST00000611854 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
C8orf59-207ENST00000611854 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
C8orf59-207ENST00000611854 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
C8orf59-207ENST00000611854 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
C8orf59-207ENST00000611854 APLP2Q06481 763 aa20.34■□□□□ 0.85
C8orf59-207ENST00000611854 ABCB7O75027 752 aa20.3■□□□□ 0.84
C8orf59-207ENST00000611854 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
C8orf59-207ENST00000611854 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
C8orf59-207ENST00000611854 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
C8orf59-207ENST00000611854 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.08■□□□□ 0.81
C8orf59-207ENST00000611854 ZBTB22O15209 634 aa19.92■□□□□ 0.78
C8orf59-207ENST00000611854 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
C8orf59-207ENST00000611854 POLA2Q14181 598 aa19.85■□□□□ 0.77
C8orf59-207ENST00000611854 POTEHQ6S545 545 aa19.57■□□□□ 0.72
C8orf59-207ENST00000611854 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
C8orf59-207ENST00000611854 ATXN8OSP0DMR3 200 aa19.38■□□□□ 0.69
C8orf59-207ENST00000611854 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
C8orf59-207ENST00000611854 OSCARQ8IYS5 282 aa19.27■□□□□ 0.68
C8orf59-207ENST00000611854 CHRDL2Q6WN34 429 aa19.16■□□□□ 0.66
C8orf59-207ENST00000611854 AKT1S1Q96B36 256 aa19.13■□□□□ 0.65
C8orf59-207ENST00000611854 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
C8orf59-207ENST00000611854 CSRNP3Q8WYN3 585 aa19■□□□□ 0.63
C8orf59-207ENST00000611854 FBLN2P98095 1184 aa18.95■□□□□ 0.62
C8orf59-207ENST00000611854 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
C8orf59-207ENST00000611854 PITPNM1O00562 1244 aa18.83■□□□□ 0.6
C8orf59-207ENST00000611854 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.83■□□□□ 0.6
C8orf59-207ENST00000611854 SPDYE2BA6NHP3 402 aa18.8■□□□□ 0.6
C8orf59-207ENST00000611854 SPDYE6P0CI01 402 aa18.8■□□□□ 0.6
C8orf59-207ENST00000611854 SPDYE2Q495Y8 402 aa18.8■□□□□ 0.6
C8orf59-207ENST00000611854 PIP4P2Q8N4L2 257 aa18.74■□□□□ 0.59
C8orf59-207ENST00000611854 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP18.61■□□□□ 0.57
C8orf59-207ENST00000611854 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
C8orf59-207ENST00000611854 SSUH2Q9Y2M2 353 aa18.61■□□□□ 0.57
C8orf59-207ENST00000611854 CLEC11AQ9Y240 323 aa18.49■□□□□ 0.55
C8orf59-207ENST00000611854 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
C8orf59-207ENST00000611854 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.38■□□□□ 0.53
C8orf59-207ENST00000611854 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
C8orf59-207ENST00000611854 HAX1O00165 279 aa18.35■□□□□ 0.53
C8orf59-207ENST00000611854 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
C8orf59-207ENST00000611854 EVX2Q03828 476 aa18.23■□□□□ 0.51
C8orf59-207ENST00000611854 CHADLQ6NUI6 762 aa18.18■□□□□ 0.5
C8orf59-207ENST00000611854 PRR29P0C7W0 189 aa18.14■□□□□ 0.49
C8orf59-207ENST00000611854 C19orf67A6NJJ6 358 aa18.02■□□□□ 0.48
C8orf59-207ENST00000611854 SPDYE4A6NLX3 237 aa18.02■□□□□ 0.48
C8orf59-207ENST00000611854 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
C8orf59-207ENST00000611854 CREBZFQ9NS37 354 aa17.77■□□□□ 0.44
C8orf59-207ENST00000611854 STAG3Q9UJ98 1225 aa17.77■□□□□ 0.44
C8orf59-207ENST00000611854 GABBR2O75899 941 aa17.74■□□□□ 0.43
C8orf59-207ENST00000611854 CD44P16070 742 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
C8orf59-207ENST00000611854 PROM2Q8N271 834 aa17.59■□□□□ 0.41
C8orf59-207ENST00000611854 ZRANB1Q9UGI0 708 aa17.5■□□□□ 0.39
C8orf59-207ENST00000611854 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
C8orf59-207ENST00000611854 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
C8orf59-207ENST00000611854 POTEIP0CG38 1075 aa17.42■□□□□ 0.38
C8orf59-207ENST00000611854 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP17.35■□□□□ 0.37
C8orf59-207ENST00000611854 PHF12Q96QT6 1004 aa17.33■□□□□ 0.36
C8orf59-207ENST00000611854 CLCN6P51797 869 aa17.32■□□□□ 0.36
C8orf59-207ENST00000611854 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
C8orf59-207ENST00000611854 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
C8orf59-207ENST00000611854 DCBLD2Q96PD2 775 aa17.24■□□□□ 0.35
C8orf59-207ENST00000611854 LHX8Q68G74 356 aa17.23■□□□□ 0.35
C8orf59-207ENST00000611854 FKBP8Q14318 412 aa17.22■□□□□ 0.35
C8orf59-207ENST00000611854 MIER1Q8N108 512 aa17.16■□□□□ 0.34
C8orf59-207ENST00000611854 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
C8orf59-207ENST00000611854 MS4A3Q96HJ5 214 aa17.08■□□□□ 0.32
C8orf59-207ENST00000611854 PLEKHG5O94827 1062 aa17.05■□□□□ 0.32
C8orf59-207ENST00000611854 CCDC61Q9Y6R9 512 aa17.04■□□□□ 0.32
C8orf59-207ENST00000611854 RASEFQ8IZ41 740 aa17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 137.7 ms