RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607561.1

RNU6-87P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 87, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-87P, Length 108 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-87P-201ENST00000607561 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
RNU6-87P-201ENST00000607561 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.4■□□□□ 0.54
RNU6-87P-201ENST00000607561 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
RNU6-87P-201ENST00000607561 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
RNU6-87P-201ENST00000607561 PLPPR3Q6T4P5 718 aa14.95□□□□□ -0.02
RNU6-87P-201ENST00000607561 FOXD1Q16676 465 aa14.76□□□□□ -0.05
RNU6-87P-201ENST00000607561 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.31□□□□□ -0.12
RNU6-87P-201ENST00000607561 ADRA2BP18089 450 aa14.29□□□□□ -0.12
RNU6-87P-201ENST00000607561 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
RNU6-87P-201ENST00000607561 MSH5O43196 834 aa13.5□□□□□ -0.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa13.22□□□□□ -0.29
RNU6-87P-201ENST00000607561 KCNA4P22459 653 aa13.03□□□□□ -0.32
RNU6-87P-201ENST00000607561 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
RNU6-87P-201ENST00000607561 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
RNU6-87P-201ENST00000607561 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
RNU6-87P-201ENST00000607561 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa12.81□□□□□ -0.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 NPM3O75607 178 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 DMRT2Q9Y5R5 561 aa12.69□□□□□ -0.38
RNU6-87P-201ENST00000607561 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
RNU6-87P-201ENST00000607561 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
RNU6-87P-201ENST00000607561 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
RNU6-87P-201ENST00000607561 DNAJC5BQ9UF47 199 aa12.32□□□□□ -0.44
RNU6-87P-201ENST00000607561 POTEDQ86YR6 584 aa12.18□□□□□ -0.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 EHMT2Q96KQ7 1210 aa12.14□□□□□ -0.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 DCAF8L1A6NGE4 600 aa12.12□□□□□ -0.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 CSRNP3Q8WYN3 585 aa12.02□□□□□ -0.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZBTB22O15209 634 aa12.01□□□□□ -0.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 SLC4A2P04920 1241 aa12.01□□□□□ -0.49
RNU6-87P-201ENST00000607561 FOXD4L1Q9NU39 408 aa11.93□□□□□ -0.5
RNU6-87P-201ENST00000607561 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.51
RNU6-87P-201ENST00000607561 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
RNU6-87P-201ENST00000607561 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
RNU6-87P-201ENST00000607561 RNF39Q9H2S5 420 aa11.61□□□□□ -0.55
RNU6-87P-201ENST00000607561 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
RNU6-87P-201ENST00000607561 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
RNU6-87P-201ENST00000607561 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
RNU6-87P-201ENST00000607561 ATXN8OSP0DMR3 200 aa11.5□□□□□ -0.57
RNU6-87P-201ENST00000607561 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
RNU6-87P-201ENST00000607561 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
RNU6-87P-201ENST00000607561 APLP2Q06481 763 aa11.36□□□□□ -0.59
RNU6-87P-201ENST00000607561 CAPN15O75808 1086 aa11.28□□□□□ -0.6
RNU6-87P-201ENST00000607561 TRHP20396 242 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
RNU6-87P-201ENST00000607561 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
RNU6-87P-201ENST00000607561 DSG3P32926 999 aa11.11□□□□□ -0.63
RNU6-87P-201ENST00000607561 POLA2Q14181 598 aa11.11□□□□□ -0.63
RNU6-87P-201ENST00000607561 ABCB7O75027 752 aa11.08□□□□□ -0.64
RNU6-87P-201ENST00000607561 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
RNU6-87P-201ENST00000607561 FBLN2P98095 1184 aa10.88□□□□□ -0.67
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
RNU6-87P-201ENST00000607561 FKBP8Q14318 412 aa10.82□□□□□ -0.68
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPDYE4A6NLX3 237 aa10.71□□□□□ -0.69
RNU6-87P-201ENST00000607561 OSCARQ8IYS5 282 aa10.71□□□□□ -0.69
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPDYE2BA6NHP3 402 aa10.62□□□□□ -0.71
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPDYE6P0CI01 402 aa10.62□□□□□ -0.71
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPDYE2Q495Y8 402 aa10.62□□□□□ -0.71
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
RNU6-87P-201ENST00000607561 PROM2Q8N271 834 aa10.57□□□□□ -0.72
RNU6-87P-201ENST00000607561 SSUH2Q9Y2M2 353 aa10.56□□□□□ -0.72
RNU6-87P-201ENST00000607561 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
RNU6-87P-201ENST00000607561 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP10.48□□□□□ -0.73
RNU6-87P-201ENST00000607561 AKT1S1Q96B36 256 aa10.44□□□□□ -0.74
RNU6-87P-201ENST00000607561 FBXO3Q9UK99 471 aa10.37□□□□□ -0.75
RNU6-87P-201ENST00000607561 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
RNU6-87P-201ENST00000607561 STAG3Q9UJ98 1225 aa10.28□□□□□ -0.76
RNU6-87P-201ENST00000607561 VASPP50552 380 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
RNU6-87P-201ENST00000607561 CLEC11AQ9Y240 323 aa10.24□□□□□ -0.77
RNU6-87P-201ENST00000607561 PITPNM1O00562 1244 aa10.23□□□□□ -0.77
RNU6-87P-201ENST00000607561 PRR29P0C7W0 189 aa10.16□□□□□ -0.78
RNU6-87P-201ENST00000607561 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RNU6-87P-201ENST00000607561 MIER1Q8N108 512 aa10.15□□□□□ -0.78
RNU6-87P-201ENST00000607561 PLCD3Q8N3E9 789 aa10.12□□□□□ -0.79
RNU6-87P-201ENST00000607561 CREBZFQ9NS37 354 aa10.09□□□□□ -0.79
RNU6-87P-201ENST00000607561 CHRDL2Q6WN34 429 aa10.07□□□□□ -0.8
RNU6-87P-201ENST00000607561 KLHL34Q8N239 644 aa10.05□□□□□ -0.8
RNU6-87P-201ENST00000607561 PLEKHG5O94827 1062 aa10.03□□□□□ -0.8
RNU6-87P-201ENST00000607561 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP10.03□□□□□ -0.8
RNU6-87P-201ENST00000607561 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
RNU6-87P-201ENST00000607561 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
RNU6-87P-201ENST00000607561 CHADLQ6NUI6 762 aa10.01□□□□□ -0.81
RNU6-87P-201ENST00000607561 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPOCK2Q92563 424 aa9.99□□□□□ -0.81
RNU6-87P-201ENST00000607561 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.98□□□□□ -0.81
RNU6-87P-201ENST00000607561 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RNU6-87P-201ENST00000607561 NUBP1P53384 320 aa9.91□□□□□ -0.82
RNU6-87P-201ENST00000607561 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RNU6-87P-201ENST00000607561 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP9.87□□□□□ -0.83
RNU6-87P-201ENST00000607561 PKD2Q13563 968 aa9.86□□□□□ -0.83
RNU6-87P-201ENST00000607561 RASEFQ8IZ41 740 aa9.84□□□□□ -0.83
RNU6-87P-201ENST00000607561 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
RNU6-87P-201ENST00000607561 DCAF8Q5TAQ9 597 aa9.8□□□□□ -0.84
RNU6-87P-201ENST00000607561 GSE1Q14687 1217 aa9.78□□□□□ -0.84
RNU6-87P-201ENST00000607561 FAM212AQ96EL1 285 aa9.76□□□□□ -0.85
RNU6-87P-201ENST00000607561 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
RNU6-87P-201ENST00000607561 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
RNU6-87P-201ENST00000607561 TRIM41Q8WV44 630 aa9.69□□□□□ -0.86
RNU6-87P-201ENST00000607561 C19orf67A6NJJ6 358 aa9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms