RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602322.1

PCF11-AS1-201, PCF11 antisense RNA 1, humanhuman

BASIC

Gene PCF11-AS1, Length 1,516 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCF11-AS1-201ENST00000602322 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
PCF11-AS1-201ENST00000602322 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.76■■■□□ 2.19
PCF11-AS1-201ENST00000602322 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
PCF11-AS1-201ENST00000602322 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
PCF11-AS1-201ENST00000602322 FOXD1Q16676 465 aa24.07■■□□□ 1.44
PCF11-AS1-201ENST00000602322 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.02■■□□□ 1.28
PCF11-AS1-201ENST00000602322 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PCF11-AS1-201ENST00000602322 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.54■■□□□ 1.2
PCF11-AS1-201ENST00000602322 ADRA2BP18089 450 aa22.52■■□□□ 1.2
PCF11-AS1-201ENST00000602322 MSH5O43196 834 aa22.48■■□□□ 1.19
PCF11-AS1-201ENST00000602322 POTEDQ86YR6 584 aa21.9■■□□□ 1.1
PCF11-AS1-201ENST00000602322 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
PCF11-AS1-201ENST00000602322 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PCF11-AS1-201ENST00000602322 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.46■□□□□ 0.87
PCF11-AS1-201ENST00000602322 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.21■□□□□ 0.83
PCF11-AS1-201ENST00000602322 DCAF8L1A6NGE4 600 aa19.8■□□□□ 0.76
PCF11-AS1-201ENST00000602322 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa19.78■□□□□ 0.76
PCF11-AS1-201ENST00000602322 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
PCF11-AS1-201ENST00000602322 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
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PCF11-AS1-201ENST00000602322 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
PCF11-AS1-201ENST00000602322 RNF39Q9H2S5 420 aa19.18■□□□□ 0.66
PCF11-AS1-201ENST00000602322 NPM3O75607 178 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
PCF11-AS1-201ENST00000602322 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
PCF11-AS1-201ENST00000602322 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.89■□□□□ 0.61
PCF11-AS1-201ENST00000602322 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.89■□□□□ 0.61
PCF11-AS1-201ENST00000602322 KCNA4P22459 653 aa18.87■□□□□ 0.61
PCF11-AS1-201ENST00000602322 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
PCF11-AS1-201ENST00000602322 SLC4A2P04920 1241 aa18.27■□□□□ 0.51
PCF11-AS1-201ENST00000602322 CAPN15O75808 1086 aa18.21■□□□□ 0.51
PCF11-AS1-201ENST00000602322 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
PCF11-AS1-201ENST00000602322 DSG3P32926 999 aa17.99■□□□□ 0.47
PCF11-AS1-201ENST00000602322 TRHP20396 242 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PCF11-AS1-201ENST00000602322 APLP2Q06481 763 aa17.91■□□□□ 0.46
PCF11-AS1-201ENST00000602322 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
PCF11-AS1-201ENST00000602322 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
PCF11-AS1-201ENST00000602322 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.45
PCF11-AS1-201ENST00000602322 ABCB7O75027 752 aa17.82■□□□□ 0.44
PCF11-AS1-201ENST00000602322 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
PCF11-AS1-201ENST00000602322 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
PCF11-AS1-201ENST00000602322 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
PCF11-AS1-201ENST00000602322 FOXD4L1Q9NU39 408 aa17.57■□□□□ 0.4
PCF11-AS1-201ENST00000602322 POLA2Q14181 598 aa17.41■□□□□ 0.38
PCF11-AS1-201ENST00000602322 ZBTB22O15209 634 aa17.33■□□□□ 0.37
PCF11-AS1-201ENST00000602322 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.37
PCF11-AS1-201ENST00000602322 POTEHQ6S545 545 aa17.19■□□□□ 0.34
PCF11-AS1-201ENST00000602322 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
PCF11-AS1-201ENST00000602322 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.02■□□□□ 0.32
PCF11-AS1-201ENST00000602322 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
PCF11-AS1-201ENST00000602322 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.96■□□□□ 0.3
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PCF11-AS1-201ENST00000602322 CHRDL2Q6WN34 429 aa16.8■□□□□ 0.28
PCF11-AS1-201ENST00000602322 AKT1S1Q96B36 256 aa16.77■□□□□ 0.28
PCF11-AS1-201ENST00000602322 FBLN2P98095 1184 aa16.66■□□□□ 0.26
PCF11-AS1-201ENST00000602322 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
PCF11-AS1-201ENST00000602322 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
PCF11-AS1-201ENST00000602322 PITPNM1O00562 1244 aa16.5■□□□□ 0.23
PCF11-AS1-201ENST00000602322 SPDYE2BA6NHP3 402 aa16.48■□□□□ 0.23
PCF11-AS1-201ENST00000602322 SPDYE6P0CI01 402 aa16.48■□□□□ 0.23
PCF11-AS1-201ENST00000602322 SPDYE2Q495Y8 402 aa16.48■□□□□ 0.23
PCF11-AS1-201ENST00000602322 PIP4P2Q8N4L2 257 aa16.42■□□□□ 0.22
PCF11-AS1-201ENST00000602322 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PCF11-AS1-201ENST00000602322 CLEC11AQ9Y240 323 aa16.29■□□□□ 0.2
PCF11-AS1-201ENST00000602322 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP16.27■□□□□ 0.2
PCF11-AS1-201ENST00000602322 SSUH2Q9Y2M2 353 aa16.25■□□□□ 0.19
PCF11-AS1-201ENST00000602322 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
PCF11-AS1-201ENST00000602322 HAX1O00165 279 aa16.16■□□□□ 0.18
PCF11-AS1-201ENST00000602322 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.13■□□□□ 0.17
PCF11-AS1-201ENST00000602322 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PCF11-AS1-201ENST00000602322 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PCF11-AS1-201ENST00000602322 PRR29P0C7W0 189 aa15.96■□□□□ 0.15
PCF11-AS1-201ENST00000602322 CHADLQ6NUI6 762 aa15.95■□□□□ 0.14
PCF11-AS1-201ENST00000602322 EVX2Q03828 476 aa15.93■□□□□ 0.14
PCF11-AS1-201ENST00000602322 SPDYE4A6NLX3 237 aa15.79■□□□□ 0.12
PCF11-AS1-201ENST00000602322 C19orf67A6NJJ6 358 aa15.76■□□□□ 0.11
PCF11-AS1-201ENST00000602322 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
PCF11-AS1-201ENST00000602322 STAG3Q9UJ98 1225 aa15.62■□□□□ 0.09
PCF11-AS1-201ENST00000602322 CD44P16070 742 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
PCF11-AS1-201ENST00000602322 GABBR2O75899 941 aa15.56■□□□□ 0.08
PCF11-AS1-201ENST00000602322 CREBZFQ9NS37 354 aa15.53■□□□□ 0.08
PCF11-AS1-201ENST00000602322 ZRANB1Q9UGI0 708 aa15.38■□□□□ 0.05
PCF11-AS1-201ENST00000602322 FKBP8Q14318 412 aa15.31■□□□□ 0.04
PCF11-AS1-201ENST00000602322 PROM2Q8N271 834 aa15.28■□□□□ 0.04
PCF11-AS1-201ENST00000602322 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
PCF11-AS1-201ENST00000602322 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.27■□□□□ 0.03
PCF11-AS1-201ENST00000602322 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
PCF11-AS1-201ENST00000602322 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
PCF11-AS1-201ENST00000602322 POTEIP0CG38 1075 aa15.21■□□□□ 0.03
PCF11-AS1-201ENST00000602322 CLCN6P51797 869 aa15.2■□□□□ 0.02
PCF11-AS1-201ENST00000602322 DCBLD2Q96PD2 775 aa15.19■□□□□ 0.02
PCF11-AS1-201ENST00000602322 PHF12Q96QT6 1004 aa15.19■□□□□ 0.02
PCF11-AS1-201ENST00000602322 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
PCF11-AS1-201ENST00000602322 LHX8Q68G74 356 aa15.14■□□□□ 0.01
PCF11-AS1-201ENST00000602322 MIER1Q8N108 512 aa15.09■□□□□ 0.01
PCF11-AS1-201ENST00000602322 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
PCF11-AS1-201ENST00000602322 PLEKHG5O94827 1062 aa15.06■□□□□ 0
PCF11-AS1-201ENST00000602322 PLCD3Q8N3E9 789 aa15□□□□□ -0.01
PCF11-AS1-201ENST00000602322 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.97□□□□□ -0.01
PCF11-AS1-201ENST00000602322 RASEFQ8IZ41 740 aa14.89□□□□□ -0.03
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