RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528499.5

APLP2-210, Transcript of amyloid beta precursor like protein 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene APLP2, Length 2,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP2-210ENST00000528499 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.34■■□□□ 1.97
APLP2-210ENST00000528499 TIAM1Q13009 1591 aa27.33■■□□□ 1.97
APLP2-210ENST00000528499 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.33■■□□□ 1.96
APLP2-210ENST00000528499 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
APLP2-210ENST00000528499 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
APLP2-210ENST00000528499 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
APLP2-210ENST00000528499 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.28■■□□□ 1.96
APLP2-210ENST00000528499 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
APLP2-210ENST00000528499 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.27■■□□□ 1.96
APLP2-210ENST00000528499 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.96
APLP2-210ENST00000528499 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.25■■□□□ 1.95
APLP2-210ENST00000528499 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.17■■□□□ 1.94
APLP2-210ENST00000528499 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.16■■□□□ 1.94
APLP2-210ENST00000528499 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.1■■□□□ 1.93
APLP2-210ENST00000528499 MAP3K1Q13233 1512 aa27.09■■□□□ 1.93
APLP2-210ENST00000528499 MAPKBP1O60336 1514 aa27.08■■□□□ 1.93
APLP2-210ENST00000528499 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.06■■□□□ 1.92
APLP2-210ENST00000528499 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.05■■□□□ 1.92
APLP2-210ENST00000528499 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.04■■□□□ 1.92
APLP2-210ENST00000528499 CUL7Q14999 1698 aa27.02■■□□□ 1.92
APLP2-210ENST00000528499 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.02■■□□□ 1.92
APLP2-210ENST00000528499 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.01■■□□□ 1.91
APLP2-210ENST00000528499 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.01■■□□□ 1.91
APLP2-210ENST00000528499 WDR97A6NE52 1622 aa27■■□□□ 1.91
APLP2-210ENST00000528499 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27■■□□□ 1.91
APLP2-210ENST00000528499 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27■■□□□ 1.91
APLP2-210ENST00000528499 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.97■■□□□ 1.91
APLP2-210ENST00000528499 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.96■■□□□ 1.91
APLP2-210ENST00000528499 ARID3CA6NKF2 412 aa26.96■■□□□ 1.91
APLP2-210ENST00000528499 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.96■■□□□ 1.91
APLP2-210ENST00000528499 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.94■■□□□ 1.9
APLP2-210ENST00000528499 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.91■■□□□ 1.9
APLP2-210ENST00000528499 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
APLP2-210ENST00000528499 FMN1Q68DA7 1419 aa26.89■■□□□ 1.9
APLP2-210ENST00000528499 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.88■■□□□ 1.892e-7■■■■■ 28.6
APLP2-210ENST00000528499 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.87■■□□□ 1.89
APLP2-210ENST00000528499 PTPRKQ15262 1439 aa26.85■■□□□ 1.89
APLP2-210ENST00000528499 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.85■■□□□ 1.89
APLP2-210ENST00000528499 KCNH8Q96L42 1107 aa26.84■■□□□ 1.89
APLP2-210ENST00000528499 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
APLP2-210ENST00000528499 SAMD9Q5K651 1589 aa26.8■■□□□ 1.88
APLP2-210ENST00000528499 GRIN2BQ13224 1484 aa26.76■■□□□ 1.87
APLP2-210ENST00000528499 NCOA2Q15596 1464 aa26.75■■□□□ 1.87
APLP2-210ENST00000528499 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.74■■□□□ 1.87
APLP2-210ENST00000528499 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.73■■□□□ 1.87
APLP2-210ENST00000528499 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
APLP2-210ENST00000528499 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
APLP2-210ENST00000528499 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.68■■□□□ 1.86
APLP2-210ENST00000528499 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.67■■□□□ 1.86
APLP2-210ENST00000528499 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.66■■□□□ 1.86
APLP2-210ENST00000528499 PBRM1Q86U86 1689 aa26.64■■□□□ 1.86
APLP2-210ENST00000528499 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
APLP2-210ENST00000528499 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.63■■□□□ 1.851e-12■□□□□ 10.3
APLP2-210ENST00000528499 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
APLP2-210ENST00000528499 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
APLP2-210ENST00000528499 NAIPQ13075 1403 aa26.59■■□□□ 1.85
APLP2-210ENST00000528499 HFM1A2PYH4 1435 aa26.59■■□□□ 1.85
APLP2-210ENST00000528499 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.59■■□□□ 1.85
APLP2-210ENST00000528499 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.58■■□□□ 1.85
APLP2-210ENST00000528499 IQGAP2Q13576 1575 aa26.57■■□□□ 1.84
APLP2-210ENST00000528499 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
APLP2-210ENST00000528499 ADAMTS12P58397 1594 aa26.56■■□□□ 1.84
APLP2-210ENST00000528499 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.55■■□□□ 1.84
APLP2-210ENST00000528499 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.53■■□□□ 1.84
APLP2-210ENST00000528499 TONSLQ96HA7 1378 aa26.53■■□□□ 1.84
APLP2-210ENST00000528499 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
APLP2-210ENST00000528499 UACAQ9BZF9 1416 aa26.5■■□□□ 1.83
APLP2-210ENST00000528499 FOXD1Q16676 465 aa26.49■■□□□ 1.83
APLP2-210ENST00000528499 TRIM52Q96A61 297 aa26.48■■□□□ 1.83
APLP2-210ENST00000528499 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
APLP2-210ENST00000528499 ARHGEF11O15085 1522 aa26.46■■□□□ 1.83
APLP2-210ENST00000528499 KDM6BO15054 1643 aa26.45■■□□□ 1.83
APLP2-210ENST00000528499 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.83
APLP2-210ENST00000528499 HECW1Q76N89 1606 aa26.45■■□□□ 1.82
APLP2-210ENST00000528499 FBLN2P98095 1184 aa26.44■■□□□ 1.82
APLP2-210ENST00000528499 WDR62O43379 1518 aa26.41■■□□□ 1.82
APLP2-210ENST00000528499 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.41■■□□□ 1.82
APLP2-210ENST00000528499 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
APLP2-210ENST00000528499 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
APLP2-210ENST00000528499 IFT140Q96RY7 1462 aa26.37■■□□□ 1.81
APLP2-210ENST00000528499 DISP1Q96F81 1524 aa26.36■■□□□ 1.81
APLP2-210ENST00000528499 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
APLP2-210ENST00000528499 ERCC6Q03468 1493 aa26.32■■□□□ 1.8
APLP2-210ENST00000528499 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
APLP2-210ENST00000528499 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.31■■□□□ 1.8
APLP2-210ENST00000528499 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
APLP2-210ENST00000528499 GRIN2AQ12879 1464 aa26.29■■□□□ 1.8
APLP2-210ENST00000528499 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
APLP2-210ENST00000528499 KIAA0556O60303 1618 aa26.29■■□□□ 1.8
APLP2-210ENST00000528499 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.28■■□□□ 1.8
APLP2-210ENST00000528499 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.28■■□□□ 1.8
APLP2-210ENST00000528499 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
APLP2-210ENST00000528499 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
APLP2-210ENST00000528499 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.24■■□□□ 1.79
APLP2-210ENST00000528499 ANP32CO43423 234 aa26.23■■□□□ 1.79
APLP2-210ENST00000528499 BCANQ96GW7 911 aa26.22■■□□□ 1.79
APLP2-210ENST00000528499 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.21■■□□□ 1.79
APLP2-210ENST00000528499 MIA2Q96PC5 1412 aa26.21■■□□□ 1.79
APLP2-210ENST00000528499 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.2■■□□□ 1.79
APLP2-210ENST00000528499 DAPK1P53355 1430 aa26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 961 ms