RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520429.5

CCNC-210, Transcript of cyclin C, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNC, Length 2,473 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNC-210ENST00000520429 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.89■■■□□ 2.38
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CCNC-210ENST00000520429 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.43■■□□□ 1.5
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CCNC-210ENST00000520429 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.9■■□□□ 1.42
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CCNC-210ENST00000520429 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.35■■□□□ 1.33
CCNC-210ENST00000520429 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.3■■□□□ 1.32
CCNC-210ENST00000520429 WIZO95785 1651 aa23.16■■□□□ 1.3
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CCNC-210ENST00000520429 HRCP23327 699 aa22.76■■□□□ 1.23
CCNC-210ENST00000520429 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.76■■□□□ 1.23
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CCNC-210ENST00000520429 SMARCA2P51531 1590 aa22.62■■□□□ 1.21
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CCNC-210ENST00000520429 SOGA1O94964 1423 aa22.33■■□□□ 1.16
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CCNC-210ENST00000520429 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.28■■□□□ 1.16
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CCNC-210ENST00000520429 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.1■■□□□ 1.13
CCNC-210ENST00000520429 SYNJ1O43426 1573 aa22.1■■□□□ 1.13
CCNC-210ENST00000520429 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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CCNC-210ENST00000520429 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNC-210ENST00000520429 EEA1Q15075 1411 aa21.95■■□□□ 1.11
CCNC-210ENST00000520429 NCAPD3P42695 1498 aa21.87■■□□□ 1.09
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CCNC-210ENST00000520429 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.77■■□□□ 1.07
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CCNC-210ENST00000520429 CFTRP13569 1480 aa21.65■■□□□ 1.06
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CCNC-210ENST00000520429 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.51■■□□□ 1.03
CCNC-210ENST00000520429 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.51■■□□□ 1.03
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CCNC-210ENST00000520429 KIF27Q86VH2 1401 aa21.44■■□□□ 1.02
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CCNC-210ENST00000520429 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.41■■□□□ 1.02
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CCNC-210ENST00000520429 PRDM2Q13029 1718 aa21.38■■□□□ 1.01
CCNC-210ENST00000520429 CUX2O14529 1486 aa21.35■■□□□ 1.01
CCNC-210ENST00000520429 APLP2Q06481 763 aa21.35■■□□□ 1.01
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CCNC-210ENST00000520429 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
CCNC-210ENST00000520429 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
CCNC-210ENST00000520429 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.93■□□□□ 0.94
CCNC-210ENST00000520429 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
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CCNC-210ENST00000520429 TIAM1Q13009 1591 aa20.91■□□□□ 0.94
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