RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHIC1Q5VXU3 224 aa10.13□□□□□ -0.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FOXD1Q16676 465 aa8.66□□□□□ -1.02
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POTEDQ86YR6 584 aa8.18□□□□□ -1.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPP6R1Q9UPN7 881 aa8.04□□□□□ -1.12
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MSH5O43196 834 aa8.03□□□□□ -1.12
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADRA2BP18089 450 aa7.97□□□□□ -1.13
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLPPR3Q6T4P5 718 aa7.96□□□□□ -1.14
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DMRT2Q9Y5R5 561 aa7.29□□□□□ -1.24
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa7.01□□□□□ -1.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DCAF8L1A6NGE4 600 aa6.94□□□□□ -1.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNF39Q9H2S5 420 aa6.92□□□□□ -1.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa6.86□□□□□ -1.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNAJC5BQ9UF47 199 aa6.69□□□□□ -1.34
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NPM3O75607 178 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP6.57□□□□□ -1.36
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DSG3P32926 999 aa6.44□□□□□ -1.38
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC4A2P04920 1241 aa6.41□□□□□ -1.38
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNA4P22459 653 aa6.41□□□□□ -1.38
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CAPN15O75808 1086 aa6.38□□□□□ -1.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POTEHQ6S545 545 aa6.35□□□□□ -1.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABCB7O75027 752 aa6.28□□□□□ -1.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRHP20396 242 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 APLP2Q06481 763 aa6.11□□□□□ -1.43
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POLA2Q14181 598 aa6.07□□□□□ -1.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHRDL2Q6WN34 429 aa6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZBTB22O15209 634 aa5.96□□□□□ -1.46
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FOXD4L1Q9NU39 408 aa5.95□□□□□ -1.46
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OSCARQ8IYS5 282 aa5.93□□□□□ -1.46
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AKT1S1Q96B36 256 aa5.91□□□□□ -1.46
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PIP4P2Q8N4L2 257 aa5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PITPNM1O00562 1244 aa5.86□□□□□ -1.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP5.82□□□□□ -1.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EVX2Q03828 476 aa5.82□□□□□ -1.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HAX1O00165 279 aa5.75□□□□□ -1.49
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATXN8OSP0DMR3 200 aa5.74□□□□□ -1.49
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPDYE2BA6NHP3 402 aa5.7□□□□□ -1.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPDYE6P0CI01 402 aa5.7□□□□□ -1.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPDYE2Q495Y8 402 aa5.7□□□□□ -1.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SSUH2Q9Y2M2 353 aa5.69□□□□□ -1.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C19orf67A6NJJ6 358 aa5.65□□□□□ -1.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FBLN2P98095 1184 aa5.65□□□□□ -1.5
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLEC11AQ9Y240 323 aa5.64□□□□□ -1.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHADLQ6NUI6 762 aa5.63□□□□□ -1.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GABBR2O75899 941 aa5.59□□□□□ -1.51
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP5.57□□□□□ -1.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POTEIP0CG38 1075 aa5.56□□□□□ -1.52
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRR29P0C7W0 189 aa5.5□□□□□ -1.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LHX8Q68G74 356 aa5.5□□□□□ -1.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CSRNP3Q8WYN3 585 aa5.5□□□□□ -1.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CD44P16070 742 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CREBZFQ9NS37 354 aa5.44□□□□□ -1.54
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POTEB2H3BUK9 544 aa5.37□□□□□ -1.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZRANB1Q9UGI0 708 aa5.37□□□□□ -1.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PHF12Q96QT6 1004 aa5.35□□□□□ -1.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPDYE4A6NLX3 237 aa5.33□□□□□ -1.56
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OTUD5Q96G74 571 aa5.33□□□□□ -1.56
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EHMT2Q96KQ7 1210 aa5.33□□□□□ -1.56
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DCBLD2Q96PD2 775 aa5.32□□□□□ -1.56
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLCN6P51797 869 aa5.31□□□□□ -1.56
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POTEJP0CG39 1038 aa5.29□□□□□ -1.56
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STAG3Q9UJ98 1225 aa5.28□□□□□ -1.56
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MS4A3Q96HJ5 214 aa5.26□□□□□ -1.57
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PROM2Q8N271 834 aa5.25□□□□□ -1.57
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLSCR2Q9NRY7 297 aa5.23□□□□□ -1.57
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms