RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-548P-201ENST00000517083 DNAJC5BQ9UF47 199 aa6.5□□□□□ -1.37
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RNU6-548P-201ENST00000517083 TRIM41Q8WV44 630 aa6□□□□□ -1.45
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RNU6-548P-201ENST00000517083 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHIC1Q5VXU3 224 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-548P-201ENST00000517083 POTEDQ86YR6 584 aa5.62□□□□□ -1.51
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RNU6-548P-201ENST00000517083 CECR2Q9BXF3 1484 aa5.53□□□□□ -1.52
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RNU6-548P-201ENST00000517083 LMTK3Q96Q04 1460 aa5.45□□□□□ -1.54
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RNU6-548P-201ENST00000517083 FBXO41Q8TF61 875 aa5.32□□□□□ -1.56
RNU6-548P-201ENST00000517083 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa5.3□□□□□ -1.56
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RNU6-548P-201ENST00000517083 DISP3Q9P2K9 1392 aa5.25□□□□□ -1.57
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RNU6-548P-201ENST00000517083 CYB5RLQ6IPT4 315 aa5.17□□□□□ -1.58
RNU6-548P-201ENST00000517083 BICRAQ9NZM4 1560 aa5.12□□□□□ -1.59
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RNU6-548P-201ENST00000517083 ERCC6L2Q5T890 1561 aa5.07□□□□□ -1.6
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RNU6-548P-201ENST00000517083 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa4.49□□□□□ -1.69
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RNU6-548P-201ENST00000517083 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
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RNU6-548P-201ENST00000517083 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-548P-201ENST00000517083 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-548P-201ENST00000517083 LTBP4Q8N2S1 1624 aa4.46□□□□□ -1.69
RNU6-548P-201ENST00000517083 KIF13AQ9H1H9 1805 aa4.46□□□□□ -1.69
RNU6-548P-201ENST00000517083 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP4.46□□□□□ -1.7
RNU6-548P-201ENST00000517083 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RNU6-548P-201ENST00000517083 DMRT2Q9Y5R5 561 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-548P-201ENST00000517083 PTPRTO14522 1441 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-548P-201ENST00000517083 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
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