RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517072.1

RNU6-334P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 334, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-334P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-334P-201ENST00000517072 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
RNU6-334P-201ENST00000517072 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.98■■□□□ 1.59
RNU6-334P-201ENST00000517072 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
RNU6-334P-201ENST00000517072 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.45■□□□□ 0.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 FOXD1Q16676 465 aa19.82■□□□□ 0.76
RNU6-334P-201ENST00000517072 ADRA2BP18089 450 aa19.25■□□□□ 0.67
RNU6-334P-201ENST00000517072 PPP6R1Q9UPN7 881 aa19.24■□□□□ 0.67
RNU6-334P-201ENST00000517072 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
RNU6-334P-201ENST00000517072 MSH5O43196 834 aa18.28■□□□□ 0.52
RNU6-334P-201ENST00000517072 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa18■□□□□ 0.47
RNU6-334P-201ENST00000517072 KCNA4P22459 653 aa17.85■□□□□ 0.45
RNU6-334P-201ENST00000517072 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
RNU6-334P-201ENST00000517072 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
RNU6-334P-201ENST00000517072 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa17.48■□□□□ 0.39
RNU6-334P-201ENST00000517072 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
RNU6-334P-201ENST00000517072 NPM3O75607 178 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
RNU6-334P-201ENST00000517072 DMRT2Q9Y5R5 561 aa17.17■□□□□ 0.34
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
RNU6-334P-201ENST00000517072 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
RNU6-334P-201ENST00000517072 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
RNU6-334P-201ENST00000517072 DNAJC5BQ9UF47 199 aa16.92■□□□□ 0.3
RNU6-334P-201ENST00000517072 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.86■□□□□ 0.29
RNU6-334P-201ENST00000517072 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.56■□□□□ 0.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.42■□□□□ 0.22
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZBTB22O15209 634 aa16.41■□□□□ 0.22
RNU6-334P-201ENST00000517072 DCAF8L1A6NGE4 600 aa16.37■□□□□ 0.21
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC4A2P04920 1241 aa16.29■□□□□ 0.2
RNU6-334P-201ENST00000517072 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP16.12■□□□□ 0.17
RNU6-334P-201ENST00000517072 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
RNU6-334P-201ENST00000517072 POTEDQ86YR6 584 aa16.08■□□□□ 0.16
RNU6-334P-201ENST00000517072 ATXN8OSP0DMR3 200 aa15.88■□□□□ 0.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
RNU6-334P-201ENST00000517072 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 APLP2Q06481 763 aa15.67■□□□□ 0.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 RNF39Q9H2S5 420 aa15.64■□□□□ 0.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
RNU6-334P-201ENST00000517072 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
RNU6-334P-201ENST00000517072 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
RNU6-334P-201ENST00000517072 CAPN15O75808 1086 aa15.27■□□□□ 0.04
RNU6-334P-201ENST00000517072 TRHP20396 242 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
RNU6-334P-201ENST00000517072 POLA2Q14181 598 aa15.07■□□□□ 0
RNU6-334P-201ENST00000517072 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
RNU6-334P-201ENST00000517072 FBLN2P98095 1184 aa14.97□□□□□ -0.01
RNU6-334P-201ENST00000517072 FKBP8Q14318 412 aa14.97□□□□□ -0.01
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RNU6-334P-201ENST00000517072 ABCB7O75027 752 aa14.96□□□□□ -0.01
RNU6-334P-201ENST00000517072 DSG3P32926 999 aa14.96□□□□□ -0.01
RNU6-334P-201ENST00000517072 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
RNU6-334P-201ENST00000517072 SPDYE4A6NLX3 237 aa14.73□□□□□ -0.05
RNU6-334P-201ENST00000517072 OSCARQ8IYS5 282 aa14.55□□□□□ -0.08
RNU6-334P-201ENST00000517072 PROM2Q8N271 834 aa14.55□□□□□ -0.08
RNU6-334P-201ENST00000517072 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.54□□□□□ -0.08
RNU6-334P-201ENST00000517072 SPDYE6P0CI01 402 aa14.54□□□□□ -0.08
RNU6-334P-201ENST00000517072 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.54□□□□□ -0.08
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 FBXO3Q9UK99 471 aa14.47□□□□□ -0.09
RNU6-334P-201ENST00000517072 SSUH2Q9Y2M2 353 aa14.43□□□□□ -0.1
RNU6-334P-201ENST00000517072 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP14.28□□□□□ -0.12
RNU6-334P-201ENST00000517072 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
RNU6-334P-201ENST00000517072 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
RNU6-334P-201ENST00000517072 AKT1S1Q96B36 256 aa14.18□□□□□ -0.14
RNU6-334P-201ENST00000517072 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.18□□□□□ -0.14
RNU6-334P-201ENST00000517072 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
RNU6-334P-201ENST00000517072 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
RNU6-334P-201ENST00000517072 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
RNU6-334P-201ENST00000517072 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
RNU6-334P-201ENST00000517072 PLCD3Q8N3E9 789 aa13.96□□□□□ -0.17
RNU6-334P-201ENST00000517072 PLEKHG5O94827 1062 aa13.93□□□□□ -0.18
RNU6-334P-201ENST00000517072 MIER1Q8N108 512 aa13.93□□□□□ -0.18
RNU6-334P-201ENST00000517072 CLEC11AQ9Y240 323 aa13.9□□□□□ -0.18
RNU6-334P-201ENST00000517072 KLHL34Q8N239 644 aa13.88□□□□□ -0.19
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRR29P0C7W0 189 aa13.84□□□□□ -0.19
RNU6-334P-201ENST00000517072 PITPNM1O00562 1244 aa13.83□□□□□ -0.2
RNU6-334P-201ENST00000517072 SPOCK2Q92563 424 aa13.83□□□□□ -0.2
RNU6-334P-201ENST00000517072 CREBZFQ9NS37 354 aa13.7□□□□□ -0.22
RNU6-334P-201ENST00000517072 PKD2Q13563 968 aa13.62□□□□□ -0.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
RNU6-334P-201ENST00000517072 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP13.56□□□□□ -0.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 CHRDL2Q6WN34 429 aa13.56□□□□□ -0.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP13.54□□□□□ -0.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 NUBP1P53384 320 aa13.54□□□□□ -0.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
RNU6-334P-201ENST00000517072 GSE1Q14687 1217 aa13.52□□□□□ -0.25
RNU6-334P-201ENST00000517072 TRIM41Q8WV44 630 aa13.52□□□□□ -0.25
RNU6-334P-201ENST00000517072 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
RNU6-334P-201ENST00000517072 CHADLQ6NUI6 762 aa13.49□□□□□ -0.25
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM212AQ96EL1 285 aa13.48□□□□□ -0.25
RNU6-334P-201ENST00000517072 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
RNU6-334P-201ENST00000517072 DCAF8Q5TAQ9 597 aa13.43□□□□□ -0.26
RNU6-334P-201ENST00000517072 PIP4P2Q8N4L2 257 aa13.43□□□□□ -0.26
RNU6-334P-201ENST00000517072 DCAF8L2P0C7V8 631 aa13.4□□□□□ -0.26
RNU6-334P-201ENST00000517072 RASEFQ8IZ41 740 aa13.4□□□□□ -0.26
RNU6-334P-201ENST00000517072 RGL2O15211 777 aa13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 143 ms