RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
RNU6-377P-201ENST00000515965 CHIC1Q5VXU3 224 aa13.37□□□□□ -0.27
RNU6-377P-201ENST00000515965 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
RNU6-377P-201ENST00000515965 PLPPR3Q6T4P5 718 aa10.9□□□□□ -0.66
RNU6-377P-201ENST00000515965 FOXD1Q16676 465 aa10.63□□□□□ -0.71
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPP6R1Q9UPN7 881 aa10.36□□□□□ -0.75
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADRA2BP18089 450 aa10.33□□□□□ -0.76
RNU6-377P-201ENST00000515965 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 MSH5O43196 834 aa9.73□□□□□ -0.85
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.62□□□□□ -0.87
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCNA4P22459 653 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU6-377P-201ENST00000515965 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
RNU6-377P-201ENST00000515965 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa9.33□□□□□ -0.92
RNU6-377P-201ENST00000515965 NPM3O75607 178 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
RNU6-377P-201ENST00000515965 DMRT2Q9Y5R5 561 aa9.18□□□□□ -0.94
RNU6-377P-201ENST00000515965 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
RNU6-377P-201ENST00000515965 DNAJC5BQ9UF47 199 aa9.08□□□□□ -0.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
RNU6-377P-201ENST00000515965 EHMT2Q96KQ7 1210 aa8.96□□□□□ -0.98
RNU6-377P-201ENST00000515965 CSRNP3Q8WYN3 585 aa8.88□□□□□ -0.99
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZBTB22O15209 634 aa8.8□□□□□ -1
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC4A2P04920 1241 aa8.75□□□□□ -1.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 FOXD4L1Q9NU39 408 aa8.74□□□□□ -1.01
RNU6-377P-201ENST00000515965 DCAF8L1A6NGE4 600 aa8.69□□□□□ -1.02
RNU6-377P-201ENST00000515965 POTEDQ86YR6 584 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP8.58□□□□□ -1.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RNU6-377P-201ENST00000515965 ATXN8OSP0DMR3 200 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU6-377P-201ENST00000515965 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
RNU6-377P-201ENST00000515965 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
RNU6-377P-201ENST00000515965 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RNU6-377P-201ENST00000515965 RNF39Q9H2S5 420 aa8.38□□□□□ -1.07
RNU6-377P-201ENST00000515965 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 APLP2Q06481 763 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
RNU6-377P-201ENST00000515965 CAPN15O75808 1086 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRHP20396 242 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RNU6-377P-201ENST00000515965 POLA2Q14181 598 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU6-377P-201ENST00000515965 DSG3P32926 999 aa8.01□□□□□ -1.13
RNU6-377P-201ENST00000515965 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
RNU6-377P-201ENST00000515965 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
RNU6-377P-201ENST00000515965 ABCB7O75027 752 aa7.97□□□□□ -1.13
RNU6-377P-201ENST00000515965 FKBP8Q14318 412 aa7.96□□□□□ -1.14
RNU6-377P-201ENST00000515965 FBLN2P98095 1184 aa7.94□□□□□ -1.14
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPDYE4A6NLX3 237 aa7.84□□□□□ -1.15
RNU6-377P-201ENST00000515965 PROM2Q8N271 834 aa7.79□□□□□ -1.16
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPDYE2BA6NHP3 402 aa7.74□□□□□ -1.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPDYE6P0CI01 402 aa7.74□□□□□ -1.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPDYE2Q495Y8 402 aa7.74□□□□□ -1.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 OSCARQ8IYS5 282 aa7.74□□□□□ -1.17
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
RNU6-377P-201ENST00000515965 SSUH2Q9Y2M2 353 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU6-377P-201ENST00000515965 FBXO3Q9UK99 471 aa7.67□□□□□ -1.18
RNU6-377P-201ENST00000515965 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP7.61□□□□□ -1.19
RNU6-377P-201ENST00000515965 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RNU6-377P-201ENST00000515965 AKT1S1Q96B36 256 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-377P-201ENST00000515965 VASPP50552 380 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RNU6-377P-201ENST00000515965 STAG3Q9UJ98 1225 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-377P-201ENST00000515965 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RNU6-377P-201ENST00000515965 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
RNU6-377P-201ENST00000515965 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
RNU6-377P-201ENST00000515965 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RNU6-377P-201ENST00000515965 MIER1Q8N108 512 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-377P-201ENST00000515965 PLCD3Q8N3E9 789 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-377P-201ENST00000515965 PITPNM1O00562 1244 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-377P-201ENST00000515965 CLEC11AQ9Y240 323 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRR29P0C7W0 189 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-377P-201ENST00000515965 KLHL34Q8N239 644 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPOCK2Q92563 424 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-377P-201ENST00000515965 PLEKHG5O94827 1062 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-377P-201ENST00000515965 CREBZFQ9NS37 354 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RNU6-377P-201ENST00000515965 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU6-377P-201ENST00000515965 PKD2Q13563 968 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-377P-201ENST00000515965 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
RNU6-377P-201ENST00000515965 NUBP1P53384 320 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-377P-201ENST00000515965 CHRDL2Q6WN34 429 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-377P-201ENST00000515965 CHADLQ6NUI6 762 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-377P-201ENST00000515965 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
RNU6-377P-201ENST00000515965 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RNU6-377P-201ENST00000515965 GSE1Q14687 1217 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-377P-201ENST00000515965 PIP4P2Q8N4L2 257 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-377P-201ENST00000515965 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RNU6-377P-201ENST00000515965 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RNU6-377P-201ENST00000515965 DCAF8Q5TAQ9 597 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-377P-201ENST00000515965 RASEFQ8IZ41 740 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRIM41Q8WV44 630 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-377P-201ENST00000515965 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM212AQ96EL1 285 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-377P-201ENST00000515965 RGL2O15211 777 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110.3 ms