RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
RABGGTB-207ENST00000470201 CHIC1Q5VXU3 224 aa19.37■□□□□ 0.69
RABGGTB-207ENST00000470201 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
RABGGTB-207ENST00000470201 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
RABGGTB-207ENST00000470201 FOXD1Q16676 465 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGGTB-207ENST00000470201 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP6R1Q9UPN7 881 aa15.13■□□□□ 0.01
RABGGTB-207ENST00000470201 ADRA2BP18089 450 aa15.09■□□□□ 0.01
RABGGTB-207ENST00000470201 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
RABGGTB-207ENST00000470201 MSH5O43196 834 aa15.02■□□□□ -0
RABGGTB-207ENST00000470201 POTEDQ86YR6 584 aa14.45□□□□□ -0.1
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNA4P22459 653 aa14.06□□□□□ -0.16
RABGGTB-207ENST00000470201 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
RABGGTB-207ENST00000470201 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa13.78□□□□□ -0.2
RABGGTB-207ENST00000470201 DMRT2Q9Y5R5 561 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGGTB-207ENST00000470201 EHMT2Q96KQ7 1210 aa13.71□□□□□ -0.21
RABGGTB-207ENST00000470201 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
RABGGTB-207ENST00000470201 NPM3O75607 178 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
RABGGTB-207ENST00000470201 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa13.35□□□□□ -0.27
RABGGTB-207ENST00000470201 CSRNP3Q8WYN3 585 aa13.31□□□□□ -0.28
RABGGTB-207ENST00000470201 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
RABGGTB-207ENST00000470201 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
RABGGTB-207ENST00000470201 DCAF8L1A6NGE4 600 aa13.17□□□□□ -0.3
RABGGTB-207ENST00000470201 DNAJC5BQ9UF47 199 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGGTB-207ENST00000470201 ZBTB22O15209 634 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGGTB-207ENST00000470201 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGGTB-207ENST00000470201 FOXD4L1Q9NU39 408 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGGTB-207ENST00000470201 RNF39Q9H2S5 420 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGGTB-207ENST00000470201 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP12.65□□□□□ -0.383e-7■■□□□ 13.1
RABGGTB-207ENST00000470201 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC4A2P04920 1241 aa12.49□□□□□ -0.41
RABGGTB-207ENST00000470201 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
RABGGTB-207ENST00000470201 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
RABGGTB-207ENST00000470201 ATXN8OSP0DMR3 200 aa12.34□□□□□ -0.43
RABGGTB-207ENST00000470201 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
RABGGTB-207ENST00000470201 CAPN15O75808 1086 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGGTB-207ENST00000470201 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
RABGGTB-207ENST00000470201 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
RABGGTB-207ENST00000470201 APLP2Q06481 763 aa12.07□□□□□ -0.48
RABGGTB-207ENST00000470201 DSG3P32926 999 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGGTB-207ENST00000470201 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
RABGGTB-207ENST00000470201 TRHP20396 242 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
RABGGTB-207ENST00000470201 FKBP8Q14318 412 aa12□□□□□ -0.49
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGGTB-207ENST00000470201 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGGTB-207ENST00000470201 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
RABGGTB-207ENST00000470201 ABCB7O75027 752 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGGTB-207ENST00000470201 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGGTB-207ENST00000470201 POLA2Q14181 598 aa11.69□□□□□ -0.54
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC24A1O60721 1099 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-207ENST00000470201 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
RABGGTB-207ENST00000470201 SPDYE4A6NLX3 237 aa11.49□□□□□ -0.57
RABGGTB-207ENST00000470201 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
RABGGTB-207ENST00000470201 FBLN2P98095 1184 aa11.46□□□□□ -0.57
RABGGTB-207ENST00000470201 FBXO3Q9UK99 471 aa11.46□□□□□ -0.57
RABGGTB-207ENST00000470201 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
RABGGTB-207ENST00000470201 PROM2Q8N271 834 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGGTB-207ENST00000470201 POTEHQ6S545 545 aa11.36□□□□□ -0.59
RABGGTB-207ENST00000470201 OSCARQ8IYS5 282 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-207ENST00000470201 VASPP50552 380 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
RABGGTB-207ENST00000470201 AKT1S1Q96B36 256 aa11.25□□□□□ -0.61
RABGGTB-207ENST00000470201 CHRDL2Q6WN34 429 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-207ENST00000470201 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
RABGGTB-207ENST00000470201 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
RABGGTB-207ENST00000470201 SPDYE2BA6NHP3 402 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTB-207ENST00000470201 SPDYE6P0CI01 402 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTB-207ENST00000470201 SPDYE2Q495Y8 402 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTB-207ENST00000470201 PITPNM1O00562 1244 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
RABGGTB-207ENST00000470201 SSUH2Q9Y2M2 353 aa11□□□□□ -0.65
RABGGTB-207ENST00000470201 PLCB2Q00722 1185 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGGTB-207ENST00000470201 STAG3Q9UJ98 1225 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGGTB-207ENST00000470201 PKD2Q13563 968 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGGTB-207ENST00000470201 PIP4P2Q8N4L2 257 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-207ENST00000470201 DCAF8L2P0C7V8 631 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-207ENST00000470201 SPOCK2Q92563 424 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-207ENST00000470201 KLHL34Q8N239 644 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGGTB-207ENST00000470201 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP10.91□□□□□ -0.66
RABGGTB-207ENST00000470201 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP10.9□□□□□ -0.66
RABGGTB-207ENST00000470201 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
RABGGTB-207ENST00000470201 CLEC11AQ9Y240 323 aa10.89□□□□□ -0.67
RABGGTB-207ENST00000470201 PLCD3Q8N3E9 789 aa10.88□□□□□ -0.67
RABGGTB-207ENST00000470201 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
RABGGTB-207ENST00000470201 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
RABGGTB-207ENST00000470201 MIER1Q8N108 512 aa10.81□□□□□ -0.68
RABGGTB-207ENST00000470201 PLEKHG5O94827 1062 aa10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-207ENST00000470201 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-207ENST00000470201 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
RABGGTB-207ENST00000470201 HAX1O00165 279 aa10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-207ENST00000470201 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-207ENST00000470201 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
RABGGTB-207ENST00000470201 PRR29P0C7W0 189 aa10.72□□□□□ -0.69
RABGGTB-207ENST00000470201 RGL2O15211 777 aa10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-207ENST00000470201 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
RABGGTB-207ENST00000470201 VSIG10Q8N0Z9 540 aa10.68□□□□□ -0.7
RABGGTB-207ENST00000470201 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP10.67□□□□□ -0.7
RABGGTB-207ENST00000470201 CHADLQ6NUI6 762 aa10.66□□□□□ -0.7
RABGGTB-207ENST00000470201 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms