RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451085.5

LRRN3-204, Transcript of leucine rich repeat neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LRRN3, Length 3,725 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3-204ENST00000451085 NISCHQ9Y2I1 1504 aa10.93□□□□□ -0.66
LRRN3-204ENST00000451085 DCAF8L2P0C7V8 631 aa10.14□□□□□ -0.79
LRRN3-204ENST00000451085 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa9.84□□□□□ -0.83
LRRN3-204ENST00000451085 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
LRRN3-204ENST00000451085 EHMT2Q96KQ7 1210 aa9.21□□□□□ -0.94
LRRN3-204ENST00000451085 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
LRRN3-204ENST00000451085 CHIC1Q5VXU3 224 aa9.13□□□□□ -0.95
LRRN3-204ENST00000451085 TRIM41Q8WV44 630 aa9.13□□□□□ -0.95
LRRN3-204ENST00000451085 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
LRRN3-204ENST00000451085 PCGF6Q9BYE7 350 aa9.09□□□□□ -0.95
LRRN3-204ENST00000451085 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa9.08□□□□□ -0.96
LRRN3-204ENST00000451085 ABCC9O60706 1549 aa9.05□□□□□ -0.96
LRRN3-204ENST00000451085 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa8.98□□□□□ -0.97
LRRN3-204ENST00000451085 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
LRRN3-204ENST00000451085 APLP2Q06481 763 aa8.87□□□□□ -0.99
LRRN3-204ENST00000451085 UBTFP17480 764 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
LRRN3-204ENST00000451085 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP8.85□□□□□ -0.99
LRRN3-204ENST00000451085 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
LRRN3-204ENST00000451085 SCRIBQ14160 1630 aa8.82□□□□□ -1
LRRN3-204ENST00000451085 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
LRRN3-204ENST00000451085 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
LRRN3-204ENST00000451085 HRCP23327 699 aa8.79□□□□□ -1
LRRN3-204ENST00000451085 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa8.79□□□□□ -1
LRRN3-204ENST00000451085 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
LRRN3-204ENST00000451085 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
LRRN3-204ENST00000451085 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
LRRN3-204ENST00000451085 NACADO15069 1562 aa8.67□□□□□ -1.02
LRRN3-204ENST00000451085 MYO15BQ96JP2 1530 aa8.65□□□□□ -1.03
LRRN3-204ENST00000451085 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa8.62□□□□□ -1.03
LRRN3-204ENST00000451085 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
LRRN3-204ENST00000451085 CSRNP3Q8WYN3 585 aa8.58□□□□□ -1.04
LRRN3-204ENST00000451085 CECR2Q9BXF3 1484 aa8.58□□□□□ -1.04
LRRN3-204ENST00000451085 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
LRRN3-204ENST00000451085 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
LRRN3-204ENST00000451085 MROH2BQ7Z745 1585 aa8.48□□□□□ -1.05
LRRN3-204ENST00000451085 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
LRRN3-204ENST00000451085 ITGAEP38570 1179 aa8.47□□□□□ -1.05
LRRN3-204ENST00000451085 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
LRRN3-204ENST00000451085 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
LRRN3-204ENST00000451085 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
LRRN3-204ENST00000451085 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
LRRN3-204ENST00000451085 EEA1Q15075 1411 aa8.37□□□□□ -1.07
LRRN3-204ENST00000451085 CCDC88BA6NC98 1476 aa8.36□□□□□ -1.07
LRRN3-204ENST00000451085 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
LRRN3-204ENST00000451085 WIZO95785 1651 aa8.36□□□□□ -1.07
LRRN3-204ENST00000451085 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LRRN3-204ENST00000451085 CEP162Q5TB80 1403 aa8.33□□□□□ -1.08
LRRN3-204ENST00000451085 P3H3Q8IVL6 736 aa8.33□□□□□ -1.08
LRRN3-204ENST00000451085 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LRRN3-204ENST00000451085 TNIKQ9UKE5 1360 aa8.32□□□□□ -1.08
LRRN3-204ENST00000451085 SOGA1O94964 1423 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRN3-204ENST00000451085 CLIP1P30622 1438 aa8.31□□□□□ -1.08
LRRN3-204ENST00000451085 GOLGA3Q08378 1498 aa8.3□□□□□ -1.08
LRRN3-204ENST00000451085 ABCC8Q09428 1581 aa8.29□□□□□ -1.08
LRRN3-204ENST00000451085 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
LRRN3-204ENST00000451085 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
LRRN3-204ENST00000451085 SMARCA4P51532 1647 aa8.26□□□□□ -1.09
LRRN3-204ENST00000451085 CEP164Q9UPV0 1460 aa8.25□□□□□ -1.09
LRRN3-204ENST00000451085 SMARCA2P51531 1590 aa8.23□□□□□ -1.09
LRRN3-204ENST00000451085 UNC13AQ9UPW8 1703 aa8.23□□□□□ -1.09
LRRN3-204ENST00000451085 NEUROD1Q13562 356 aa8.23□□□□□ -1.09
LRRN3-204ENST00000451085 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa8.23□□□□□ -1.09
LRRN3-204ENST00000451085 KIF27Q86VH2 1401 aa8.23□□□□□ -1.09
LRRN3-204ENST00000451085 FBLN2P98095 1184 aa8.2□□□□□ -1.1
LRRN3-204ENST00000451085 TRIM52Q96A61 297 aa8.18□□□□□ -1.1
LRRN3-204ENST00000451085 ARID3CA6NKF2 412 aa8.18□□□□□ -1.1
LRRN3-204ENST00000451085 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa8.16□□□□□ -1.1
LRRN3-204ENST00000451085 BICRAQ9NZM4 1560 aa8.15□□□□□ -1.11
LRRN3-204ENST00000451085 NEFLP07196 543 aa8.14□□□□□ -1.11
LRRN3-204ENST00000451085 VPS8Q8N3P4 1428 aa8.12□□□□□ -1.11
LRRN3-204ENST00000451085 CUX2O14529 1486 aa8.12□□□□□ -1.11
LRRN3-204ENST00000451085 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa8.12□□□□□ -1.11
LRRN3-204ENST00000451085 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
LRRN3-204ENST00000451085 POLR3GLQ9BT43 218 aa8.11□□□□□ -1.11
LRRN3-204ENST00000451085 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.11□□□□□ -1.11
LRRN3-204ENST00000451085 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
LRRN3-204ENST00000451085 CADPSQ9ULU8 1353 aa8.1□□□□□ -1.11
LRRN3-204ENST00000451085 MTUS2Q5JR59 1369 aa8.1□□□□□ -1.11
LRRN3-204ENST00000451085 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa8.09□□□□□ -1.11
LRRN3-204ENST00000451085 MYT1LQ9UL68 1186 aa8.09□□□□□ -1.11
LRRN3-204ENST00000451085 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
LRRN3-204ENST00000451085 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
LRRN3-204ENST00000451085 NCAPD3P42695 1498 aa8.06□□□□□ -1.12
LRRN3-204ENST00000451085 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.06□□□□□ -1.12
LRRN3-204ENST00000451085 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
LRRN3-204ENST00000451085 ANP32CO43423 234 aa8.05□□□□□ -1.12
LRRN3-204ENST00000451085 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
LRRN3-204ENST00000451085 MIER1Q8N108 512 aa8.04□□□□□ -1.12
LRRN3-204ENST00000451085 CCNB3Q8WWL7 1395 aa8.04□□□□□ -1.12
LRRN3-204ENST00000451085 TONSLQ96HA7 1378 aa8.04□□□□□ -1.12
LRRN3-204ENST00000451085 FHAD1B1AJZ9 1412 aa8.03□□□□□ -1.12
LRRN3-204ENST00000451085 CLSPNQ9HAW4 1339 aa8.02□□□□□ -1.13
LRRN3-204ENST00000451085 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
LRRN3-204ENST00000451085 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
LRRN3-204ENST00000451085 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
LRRN3-204ENST00000451085 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
LRRN3-204ENST00000451085 PDS5BQ9NTI5 1447 aa8□□□□□ -1.13
LRRN3-204ENST00000451085 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa8□□□□□ -1.13
LRRN3-204ENST00000451085 IGF1RP08069 1367 aa7.98□□□□□ -1.13
LRRN3-204ENST00000451085 SYNJ1O43426 1573 aa7.98□□□□□ -1.13
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