RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.34■■□□□ 1.65
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 NISCHQ9Y2I1 1504 aa24.19■■□□□ 1.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.73■■□□□ 1.39
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.48■■□□□ 1.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 APLP2Q06481 763 aa23.32■■□□□ 1.32
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.91■■□□□ 1.26
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.77■■□□□ 1.23
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRIM41Q8WV44 630 aa22.52■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MYT1Q01538 1121 aa22.36■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NEFLP07196 543 aa22.34■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 HRCP23327 699 aa21.82■■□□□ 1.08
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ITGAEP38570 1179 aa21.58■■□□□ 1.04
TTC28-AS1-207ENST00000428584 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.54■■□□□ 1.04
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.49■■□□□ 1.03
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.46■■□□□ 1.03
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.46■■□□□ 1.03
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.13■□□□□ 0.97
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRIM52Q96A61 297 aa20.99■□□□□ 0.95
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NEUROD1Q13562 356 aa20.93■□□□□ 0.94
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ANP32CO43423 234 aa20.92■□□□□ 0.94
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.91■□□□□ 0.94
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BCANQ96GW7 911 aa20.88■□□□□ 0.93
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ABCC9O60706 1549 aa20.8■□□□□ 0.92
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.74■□□□□ 0.91
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FBLN2P98095 1184 aa20.52■□□□□ 0.87
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.43■□□□□ 0.86
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 BCL11AQ9H165 835 aa20.34■□□□□ 0.85
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa20.3■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TONSLQ96HA7 1378 aa20.3■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 ARID3CA6NKF2 412 aa20.26■□□□□ 0.83
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SCRIBQ14160 1630 aa20.13■□□□□ 0.81
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.05■□□□□ 0.8
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.04■□□□□ 0.8
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TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa20■□□□□ 0.79
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CHGAP10645 457 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP19.96■□□□□ 0.79
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NBR1Q14596 966 aa19.94■□□□□ 0.78
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MRS2Q9HD23 443 aa19.92■□□□□ 0.78
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CHIC2Q9UKJ5 165 aa19.89■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TSPY4P0CV99 314 aa19.86■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TSPY10P0CW01 314 aa19.86■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa19.84■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MIER1Q8N108 512 aa19.84■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP19.83■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MTUS2Q5JR59 1369 aa19.83■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DDRGK1Q96HY6 314 aa19.81■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MYH16Q9H6N6 1097 aa19.8■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CLIP1P30622 1438 aa19.8■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP19.78■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa19.77■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ARXQ96QS3 562 aa19.76■□□□□ 0.75
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