RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424733.1

TTC3-AS1-201, TTC3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC3-AS1, Length 1,097 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-AS1-201ENST00000424733 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
TTC3-AS1-201ENST00000424733 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.47■■□□□ 1.99
TTC3-AS1-201ENST00000424733 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
TTC3-AS1-201ENST00000424733 FOXD1Q16676 465 aa22.93■■□□□ 1.26
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.97■■□□□ 1.11
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.52■■□□□ 1.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ADRA2BP18089 450 aa21.44■■□□□ 1.02
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
TTC3-AS1-201ENST00000424733 MSH5O43196 834 aa21.39■■□□□ 1.01
TTC3-AS1-201ENST00000424733 POTEDQ86YR6 584 aa20.78■□□□□ 0.92
TTC3-AS1-201ENST00000424733 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
TTC3-AS1-201ENST00000424733 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
TTC3-AS1-201ENST00000424733 DMRT2Q9Y5R5 561 aa19.51■□□□□ 0.71
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa19.28■□□□□ 0.68
TTC3-AS1-201ENST00000424733 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa18.88■□□□□ 0.61
TTC3-AS1-201ENST00000424733 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
TTC3-AS1-201ENST00000424733 DCAF8L1A6NGE4 600 aa18.7■□□□□ 0.58
TTC3-AS1-201ENST00000424733 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
TTC3-AS1-201ENST00000424733 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
TTC3-AS1-201ENST00000424733 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
TTC3-AS1-201ENST00000424733 NPM3O75607 178 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
TTC3-AS1-201ENST00000424733 RNF39Q9H2S5 420 aa18.28■□□□□ 0.52
TTC3-AS1-201ENST00000424733 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.13■□□□□ 0.49
TTC3-AS1-201ENST00000424733 KCNA4P22459 653 aa18.04■□□□□ 0.48
TTC3-AS1-201ENST00000424733 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
TTC3-AS1-201ENST00000424733 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP17.93■□□□□ 0.46
TTC3-AS1-201ENST00000424733 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
TTC3-AS1-201ENST00000424733 SLC4A2P04920 1241 aa17.48■□□□□ 0.39
TTC3-AS1-201ENST00000424733 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
TTC3-AS1-201ENST00000424733 CAPN15O75808 1086 aa17.25■□□□□ 0.35
TTC3-AS1-201ENST00000424733 DSG3P32926 999 aa17.15■□□□□ 0.34
TTC3-AS1-201ENST00000424733 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
TTC3-AS1-201ENST00000424733 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
TTC3-AS1-201ENST00000424733 APLP2Q06481 763 aa17.03■□□□□ 0.32
TTC3-AS1-201ENST00000424733 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
TTC3-AS1-201ENST00000424733 TRHP20396 242 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
TTC3-AS1-201ENST00000424733 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ABCB7O75027 752 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC3-AS1-201ENST00000424733 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.78■□□□□ 0.28
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ZBTB22O15209 634 aa16.61■□□□□ 0.25
TTC3-AS1-201ENST00000424733 POLA2Q14181 598 aa16.56■□□□□ 0.24
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
TTC3-AS1-201ENST00000424733 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
TTC3-AS1-201ENST00000424733 POTEHQ6S545 545 aa16.29■□□□□ 0.2
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ATXN8OSP0DMR3 200 aa16.24■□□□□ 0.19
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
TTC3-AS1-201ENST00000424733 OSCARQ8IYS5 282 aa16.05■□□□□ 0.16
TTC3-AS1-201ENST00000424733 AKT1S1Q96B36 256 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC3-AS1-201ENST00000424733 CHRDL2Q6WN34 429 aa15.97■□□□□ 0.15
TTC3-AS1-201ENST00000424733 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.89■□□□□ 0.13
TTC3-AS1-201ENST00000424733 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
TTC3-AS1-201ENST00000424733 FBLN2P98095 1184 aa15.84■□□□□ 0.13
TTC3-AS1-201ENST00000424733 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
TTC3-AS1-201ENST00000424733 SPDYE2BA6NHP3 402 aa15.73■□□□□ 0.11
TTC3-AS1-201ENST00000424733 SPDYE6P0CI01 402 aa15.73■□□□□ 0.11
TTC3-AS1-201ENST00000424733 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.73■□□□□ 0.11
TTC3-AS1-201ENST00000424733 EHMT2Q96KQ7 1210 aa15.73■□□□□ 0.11
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PITPNM1O00562 1244 aa15.69■□□□□ 0.1
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PIP4P2Q8N4L2 257 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
TTC3-AS1-201ENST00000424733 SSUH2Q9Y2M2 353 aa15.55■□□□□ 0.08
TTC3-AS1-201ENST00000424733 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP15.52■□□□□ 0.08
TTC3-AS1-201ENST00000424733 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
TTC3-AS1-201ENST00000424733 CLEC11AQ9Y240 323 aa15.41■□□□□ 0.06
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP15.34■□□□□ 0.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 HAX1O00165 279 aa15.29■□□□□ 0.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PRR29P0C7W0 189 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-AS1-201ENST00000424733 EVX2Q03828 476 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC3-AS1-201ENST00000424733 CHADLQ6NUI6 762 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC3-AS1-201ENST00000424733 SPDYE4A6NLX3 237 aa15.06■□□□□ 0
TTC3-AS1-201ENST00000424733 C19orf67A6NJJ6 358 aa15.03■□□□□ -0
TTC3-AS1-201ENST00000424733 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC3-AS1-201ENST00000424733 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TTC3-AS1-201ENST00000424733 CREBZFQ9NS37 354 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 GABBR2O75899 941 aa14.79□□□□□ -0.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PROM2Q8N271 834 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC3-AS1-201ENST00000424733 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC3-AS1-201ENST00000424733 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TTC3-AS1-201ENST00000424733 CLCN6P51797 869 aa14.53□□□□□ -0.08
TTC3-AS1-201ENST00000424733 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
TTC3-AS1-201ENST00000424733 POTEIP0CG38 1075 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PHF12Q96QT6 1004 aa14.42□□□□□ -0.1
TTC3-AS1-201ENST00000424733 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
TTC3-AS1-201ENST00000424733 FKBP8Q14318 412 aa14.4□□□□□ -0.1
TTC3-AS1-201ENST00000424733 DCBLD2Q96PD2 775 aa14.38□□□□□ -0.11
TTC3-AS1-201ENST00000424733 LHX8Q68G74 356 aa14.35□□□□□ -0.11
TTC3-AS1-201ENST00000424733 MIER1Q8N108 512 aa14.35□□□□□ -0.11
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PLEKHG5O94827 1062 aa14.29□□□□□ -0.12
TTC3-AS1-201ENST00000424733 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
TTC3-AS1-201ENST00000424733 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.25□□□□□ -0.13
TTC3-AS1-201ENST00000424733 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.23□□□□□ -0.13
TTC3-AS1-201ENST00000424733 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms