RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415033.2

CPB2-AS1-201, CPB2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CPB2-AS1, Length 747 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPB2-AS1-201ENST00000415033 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
CPB2-AS1-201ENST00000415033 CHIC1Q5VXU3 224 aa29■■■□□ 2.23
CPB2-AS1-201ENST00000415033 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
CPB2-AS1-201ENST00000415033 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CPB2-AS1-201ENST00000415033 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.68■■□□□ 1.38
CPB2-AS1-201ENST00000415033 FOXD1Q16676 465 aa23.11■■□□□ 1.29
CPB2-AS1-201ENST00000415033 ADRA2BP18089 450 aa22.51■■□□□ 1.19
CPB2-AS1-201ENST00000415033 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.49■■□□□ 1.19
CPB2-AS1-201ENST00000415033 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CPB2-AS1-201ENST00000415033 MSH5O43196 834 aa21.16■□□□□ 0.98
CPB2-AS1-201ENST00000415033 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.93■□□□□ 0.94
CPB2-AS1-201ENST00000415033 KCNA4P22459 653 aa20.79■□□□□ 0.92
CPB2-AS1-201ENST00000415033 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CPB2-AS1-201ENST00000415033 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CPB2-AS1-201ENST00000415033 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CPB2-AS1-201ENST00000415033 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.26■□□□□ 0.83
CPB2-AS1-201ENST00000415033 NPM3O75607 178 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CPB2-AS1-201ENST00000415033 DMRT2Q9Y5R5 561 aa19.92■□□□□ 0.78
CPB2-AS1-201ENST00000415033 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
CPB2-AS1-201ENST00000415033 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
CPB2-AS1-201ENST00000415033 EHMT2Q96KQ7 1210 aa19.67■□□□□ 0.74
CPB2-AS1-201ENST00000415033 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
CPB2-AS1-201ENST00000415033 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.4■□□□□ 0.7
CPB2-AS1-201ENST00000415033 CSRNP3Q8WYN3 585 aa19.26■□□□□ 0.67
CPB2-AS1-201ENST00000415033 DCAF8L1A6NGE4 600 aa19.16■□□□□ 0.66
CPB2-AS1-201ENST00000415033 ZBTB22O15209 634 aa19.12■□□□□ 0.65
CPB2-AS1-201ENST00000415033 FOXD4L1Q9NU39 408 aa19.02■□□□□ 0.64
CPB2-AS1-201ENST00000415033 SLC4A2P04920 1241 aa18.97■□□□□ 0.63
CPB2-AS1-201ENST00000415033 POTEDQ86YR6 584 aa18.8■□□□□ 0.6
CPB2-AS1-201ENST00000415033 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.77■□□□□ 0.6
CPB2-AS1-201ENST00000415033 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
CPB2-AS1-201ENST00000415033 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
CPB2-AS1-201ENST00000415033 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CPB2-AS1-201ENST00000415033 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
CPB2-AS1-201ENST00000415033 ATXN8OSP0DMR3 200 aa18.29■□□□□ 0.52
CPB2-AS1-201ENST00000415033 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CPB2-AS1-201ENST00000415033 RNF39Q9H2S5 420 aa18.16■□□□□ 0.5
CPB2-AS1-201ENST00000415033 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
CPB2-AS1-201ENST00000415033 APLP2Q06481 763 aa18.02■□□□□ 0.48
CPB2-AS1-201ENST00000415033 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
CPB2-AS1-201ENST00000415033 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
CPB2-AS1-201ENST00000415033 TRHP20396 242 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
CPB2-AS1-201ENST00000415033 CAPN15O75808 1086 aa17.82■□□□□ 0.44
CPB2-AS1-201ENST00000415033 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
CPB2-AS1-201ENST00000415033 POLA2Q14181 598 aa17.58■□□□□ 0.4
CPB2-AS1-201ENST00000415033 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
CPB2-AS1-201ENST00000415033 ABCB7O75027 752 aa17.52■□□□□ 0.4
CPB2-AS1-201ENST00000415033 FKBP8Q14318 412 aa17.42■□□□□ 0.38
CPB2-AS1-201ENST00000415033 DSG3P32926 999 aa17.41■□□□□ 0.38
CPB2-AS1-201ENST00000415033 FBLN2P98095 1184 aa17.34■□□□□ 0.37
CPB2-AS1-201ENST00000415033 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
CPB2-AS1-201ENST00000415033 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
CPB2-AS1-201ENST00000415033 SPDYE4A6NLX3 237 aa17.11■□□□□ 0.33
CPB2-AS1-201ENST00000415033 OSCARQ8IYS5 282 aa16.95■□□□□ 0.3
CPB2-AS1-201ENST00000415033 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CPB2-AS1-201ENST00000415033 SPDYE2BA6NHP3 402 aa16.8■□□□□ 0.28
CPB2-AS1-201ENST00000415033 SPDYE6P0CI01 402 aa16.8■□□□□ 0.28
CPB2-AS1-201ENST00000415033 SPDYE2Q495Y8 402 aa16.8■□□□□ 0.28
CPB2-AS1-201ENST00000415033 PROM2Q8N271 834 aa16.77■□□□□ 0.28
CPB2-AS1-201ENST00000415033 SSUH2Q9Y2M2 353 aa16.69■□□□□ 0.26
CPB2-AS1-201ENST00000415033 FBXO3Q9UK99 471 aa16.68■□□□□ 0.26
CPB2-AS1-201ENST00000415033 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.63■□□□□ 0.25
CPB2-AS1-201ENST00000415033 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
CPB2-AS1-201ENST00000415033 VASPP50552 380 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
CPB2-AS1-201ENST00000415033 AKT1S1Q96B36 256 aa16.42■□□□□ 0.22
CPB2-AS1-201ENST00000415033 STAG3Q9UJ98 1225 aa16.37■□□□□ 0.21
CPB2-AS1-201ENST00000415033 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CPB2-AS1-201ENST00000415033 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
CPB2-AS1-201ENST00000415033 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
CPB2-AS1-201ENST00000415033 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
CPB2-AS1-201ENST00000415033 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
CPB2-AS1-201ENST00000415033 CLEC11AQ9Y240 323 aa16.25■□□□□ 0.19
CPB2-AS1-201ENST00000415033 MIER1Q8N108 512 aa16.23■□□□□ 0.19
CPB2-AS1-201ENST00000415033 PLCD3Q8N3E9 789 aa16.23■□□□□ 0.19
CPB2-AS1-201ENST00000415033 KLHL34Q8N239 644 aa16.18■□□□□ 0.18
CPB2-AS1-201ENST00000415033 PRR29P0C7W0 189 aa16.11■□□□□ 0.17
CPB2-AS1-201ENST00000415033 PITPNM1O00562 1244 aa16.09■□□□□ 0.17
CPB2-AS1-201ENST00000415033 PLEKHG5O94827 1062 aa16.09■□□□□ 0.17
CPB2-AS1-201ENST00000415033 SPOCK2Q92563 424 aa16.02■□□□□ 0.16
CPB2-AS1-201ENST00000415033 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CPB2-AS1-201ENST00000415033 CREBZFQ9NS37 354 aa15.94■□□□□ 0.14
CPB2-AS1-201ENST00000415033 PKD2Q13563 968 aa15.82■□□□□ 0.12
CPB2-AS1-201ENST00000415033 CHADLQ6NUI6 762 aa15.81■□□□□ 0.12
CPB2-AS1-201ENST00000415033 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
CPB2-AS1-201ENST00000415033 CHRDL2Q6WN34 429 aa15.78■□□□□ 0.12
CPB2-AS1-201ENST00000415033 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
CPB2-AS1-201ENST00000415033 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
CPB2-AS1-201ENST00000415033 NUBP1P53384 320 aa15.72■□□□□ 0.11
CPB2-AS1-201ENST00000415033 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP15.71■□□□□ 0.11
CPB2-AS1-201ENST00000415033 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
CPB2-AS1-201ENST00000415033 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.68■□□□□ 0.1
CPB2-AS1-201ENST00000415033 DCAF8Q5TAQ9 597 aa15.67■□□□□ 0.1
CPB2-AS1-201ENST00000415033 DCAF8L2P0C7V8 631 aa15.65■□□□□ 0.1
CPB2-AS1-201ENST00000415033 PIP4P2Q8N4L2 257 aa15.65■□□□□ 0.1
CPB2-AS1-201ENST00000415033 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
CPB2-AS1-201ENST00000415033 GSE1Q14687 1217 aa15.63■□□□□ 0.09
CPB2-AS1-201ENST00000415033 RASEFQ8IZ41 740 aa15.61■□□□□ 0.09
CPB2-AS1-201ENST00000415033 FAM212AQ96EL1 285 aa15.6■□□□□ 0.09
CPB2-AS1-201ENST00000415033 RGL2O15211 777 aa15.53■□□□□ 0.08
CPB2-AS1-201ENST00000415033 TRIM41Q8WV44 630 aa15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.3 ms