RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410629.1

RNU6-1025P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1025, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1025P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1025P-201ENST00000410629 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
RNU6-1025P-201ENST00000410629 CHIC1Q5VXU3 224 aa13.87□□□□□ -0.19
RNU6-1025P-201ENST00000410629 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
RNU6-1025P-201ENST00000410629 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
RNU6-1025P-201ENST00000410629 POTEDQ86YR6 584 aa12.09□□□□□ -0.47
RNU6-1025P-201ENST00000410629 FOXD1Q16676 465 aa12.04□□□□□ -0.48
RNU6-1025P-201ENST00000410629 MSH5O43196 834 aa11.37□□□□□ -0.59
RNU6-1025P-201ENST00000410629 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
RNU6-1025P-201ENST00000410629 PPP6R1Q9UPN7 881 aa10.9□□□□□ -0.66
RNU6-1025P-201ENST00000410629 PLPPR3Q6T4P5 718 aa10.88□□□□□ -0.67
RNU6-1025P-201ENST00000410629 ADRA2BP18089 450 aa10.79□□□□□ -0.68
RNU6-1025P-201ENST00000410629 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RNU6-1025P-201ENST00000410629 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RNU6-1025P-201ENST00000410629 DMRT2Q9Y5R5 561 aa10.07□□□□□ -0.8
RNU6-1025P-201ENST00000410629 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
RNU6-1025P-201ENST00000410629 RNF39Q9H2S5 420 aa9.72□□□□□ -0.85
RNU6-1025P-201ENST00000410629 KCNA4P22459 653 aa9.64□□□□□ -0.87
RNU6-1025P-201ENST00000410629 DCAF8L1A6NGE4 600 aa9.62□□□□□ -0.87
RNU6-1025P-201ENST00000410629 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.6□□□□□ -0.87
RNU6-1025P-201ENST00000410629 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RNU6-1025P-201ENST00000410629 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RNU6-1025P-201ENST00000410629 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
RNU6-1025P-201ENST00000410629 POTEHQ6S545 545 aa9.35□□□□□ -0.91
RNU6-1025P-201ENST00000410629 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa9.29□□□□□ -0.92
RNU6-1025P-201ENST00000410629 NPM3O75607 178 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
RNU6-1025P-201ENST00000410629 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RNU6-1025P-201ENST00000410629 DNAJC5BQ9UF47 199 aa9.25□□□□□ -0.93
RNU6-1025P-201ENST00000410629 EHMT2Q96KQ7 1210 aa9.24□□□□□ -0.93
RNU6-1025P-201ENST00000410629 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
RNU6-1025P-201ENST00000410629 CSRNP3Q8WYN3 585 aa9.03□□□□□ -0.96
RNU6-1025P-201ENST00000410629 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.97
RNU6-1025P-201ENST00000410629 DSG3P32926 999 aa8.93□□□□□ -0.98
RNU6-1025P-201ENST00000410629 ZBTB22O15209 634 aa8.87□□□□□ -0.99
RNU6-1025P-201ENST00000410629 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
RNU6-1025P-201ENST00000410629 FOXD4L1Q9NU39 408 aa8.83□□□□□ -1
RNU6-1025P-201ENST00000410629 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
RNU6-1025P-201ENST00000410629 CAPN15O75808 1086 aa8.79□□□□□ -1
RNU6-1025P-201ENST00000410629 SLC4A2P04920 1241 aa8.69□□□□□ -1.02
RNU6-1025P-201ENST00000410629 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RNU6-1025P-201ENST00000410629 ABCB7O75027 752 aa8.57□□□□□ -1.04
RNU6-1025P-201ENST00000410629 ATXN8OSP0DMR3 200 aa8.54□□□□□ -1.04
RNU6-1025P-201ENST00000410629 TRHP20396 242 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RNU6-1025P-201ENST00000410629 CHRDL2Q6WN34 429 aa8.53□□□□□ -1.04
RNU6-1025P-201ENST00000410629 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RNU6-1025P-201ENST00000410629 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
RNU6-1025P-201ENST00000410629 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RNU6-1025P-201ENST00000410629 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RNU6-1025P-201ENST00000410629 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RNU6-1025P-201ENST00000410629 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RNU6-1025P-201ENST00000410629 APLP2Q06481 763 aa8.35□□□□□ -1.07
RNU6-1025P-201ENST00000410629 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RNU6-1025P-201ENST00000410629 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-1025P-201ENST00000410629 POLA2Q14181 598 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-1025P-201ENST00000410629 HAX1O00165 279 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-1025P-201ENST00000410629 AKT1S1Q96B36 256 aa8.17□□□□□ -1.1
RNU6-1025P-201ENST00000410629 EVX2Q03828 476 aa8.16□□□□□ -1.1
RNU6-1025P-201ENST00000410629 FKBP8Q14318 412 aa8.15□□□□□ -1.1
RNU6-1025P-201ENST00000410629 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
RNU6-1025P-201ENST00000410629 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8.1□□□□□ -1.11
RNU6-1025P-201ENST00000410629 PITPNM1O00562 1244 aa8.05□□□□□ -1.12
RNU6-1025P-201ENST00000410629 FBLN2P98095 1184 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-1025P-201ENST00000410629 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
RNU6-1025P-201ENST00000410629 LHX8Q68G74 356 aa7.96□□□□□ -1.14
RNU6-1025P-201ENST00000410629 OSCARQ8IYS5 282 aa7.96□□□□□ -1.14
RNU6-1025P-201ENST00000410629 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
RNU6-1025P-201ENST00000410629 SPDYE4A6NLX3 237 aa7.92□□□□□ -1.14
RNU6-1025P-201ENST00000410629 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
RNU6-1025P-201ENST00000410629 GABBR2O75899 941 aa7.87□□□□□ -1.15
RNU6-1025P-201ENST00000410629 PLSCR2Q9NRY7 297 aa7.87□□□□□ -1.15
RNU6-1025P-201ENST00000410629 C19orf67A6NJJ6 358 aa7.85□□□□□ -1.15
RNU6-1025P-201ENST00000410629 PROM2Q8N271 834 aa7.85□□□□□ -1.15
RNU6-1025P-201ENST00000410629 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
RNU6-1025P-201ENST00000410629 FBXO3Q9UK99 471 aa7.84□□□□□ -1.15
RNU6-1025P-201ENST00000410629 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
RNU6-1025P-201ENST00000410629 POTEIP0CG38 1075 aa7.77□□□□□ -1.17
RNU6-1025P-201ENST00000410629 SPDYE2BA6NHP3 402 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU6-1025P-201ENST00000410629 SPDYE6P0CI01 402 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU6-1025P-201ENST00000410629 SPDYE2Q495Y8 402 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU6-1025P-201ENST00000410629 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
RNU6-1025P-201ENST00000410629 VASPP50552 380 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RNU6-1025P-201ENST00000410629 CLEC11AQ9Y240 323 aa7.68□□□□□ -1.18
RNU6-1025P-201ENST00000410629 SSUH2Q9Y2M2 353 aa7.68□□□□□ -1.18
RNU6-1025P-201ENST00000410629 CHADLQ6NUI6 762 aa7.65□□□□□ -1.18
RNU6-1025P-201ENST00000410629 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RNU6-1025P-201ENST00000410629 STAG3Q9UJ98 1225 aa7.61□□□□□ -1.19
RNU6-1025P-201ENST00000410629 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP7.6□□□□□ -1.19
RNU6-1025P-201ENST00000410629 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RNU6-1025P-201ENST00000410629 OTUD5Q96G74 571 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-1025P-201ENST00000410629 POTEMA6NI47 508 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1025P-201ENST00000410629 CD44P16070 742 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1025P-201ENST00000410629 SLC24A1O60721 1099 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-1025P-201ENST00000410629 POTEB2H3BUK9 544 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-1025P-201ENST00000410629 KLHL34Q8N239 644 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-1025P-201ENST00000410629 PLCD3Q8N3E9 789 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-1025P-201ENST00000410629 POTEGQ6S5H5 508 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-1025P-201ENST00000410629 MIER1Q8N108 512 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-1025P-201ENST00000410629 SPOCK2Q92563 424 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-1025P-201ENST00000410629 PRR29P0C7W0 189 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-1025P-201ENST00000410629 CLCN6P51797 869 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-1025P-201ENST00000410629 DCBLD2Q96PD2 775 aa7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms