RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394725.2

SIAH1-203, Transcript of siah E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIAH1, Length 2,147 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH1-203ENST00000394725 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.46■■■■■ 4.39
SIAH1-203ENST00000394725 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.45■■■■■ 4.39
SIAH1-203ENST00000394725 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.43■■■■■ 4.38
SIAH1-203ENST00000394725 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.42■■■■■ 4.38
SIAH1-203ENST00000394725 TIAM1Q13009 1591 aa42.41■■■■■ 4.38
SIAH1-203ENST00000394725 MAP3K1Q13233 1512 aa42.38■■■■■ 4.38
SIAH1-203ENST00000394725 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
SIAH1-203ENST00000394725 WDR62O43379 1518 aa42.35■■■■■ 4.37
SIAH1-203ENST00000394725 PBRM1Q86U86 1689 aa42.35■■■■■ 4.37
SIAH1-203ENST00000394725 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
SIAH1-203ENST00000394725 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
SIAH1-203ENST00000394725 IFT140Q96RY7 1462 aa42.26■■■■■ 4.36
SIAH1-203ENST00000394725 ERCC6Q03468 1493 aa42.26■■■■■ 4.36
SIAH1-203ENST00000394725 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa42.25■■■■■ 4.35
SIAH1-203ENST00000394725 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.23■■■■■ 4.35
SIAH1-203ENST00000394725 GRIN2BQ13224 1484 aa42.2■■■■■ 4.35
SIAH1-203ENST00000394725 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.2■■■■■ 4.35
SIAH1-203ENST00000394725 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.2■■■■■ 4.35
SIAH1-203ENST00000394725 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.2■■■■■ 4.35
SIAH1-203ENST00000394725 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.18■■■■■ 4.34
SIAH1-203ENST00000394725 ADAMTS12P58397 1594 aa42.17■■■■■ 4.34
SIAH1-203ENST00000394725 SAMD9Q5K651 1589 aa42.17■■■■■ 4.34
SIAH1-203ENST00000394725 FMN1Q68DA7 1419 aa42.15■■■■■ 4.34
SIAH1-203ENST00000394725 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.06■■■■■ 4.32
SIAH1-203ENST00000394725 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.04■■■■■ 4.32
SIAH1-203ENST00000394725 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.03■■■■■ 4.32
SIAH1-203ENST00000394725 ITGAEP38570 1179 aa41.99■■■■■ 4.31
SIAH1-203ENST00000394725 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
SIAH1-203ENST00000394725 IQGAP2Q13576 1575 aa41.95■■■■■ 4.31
SIAH1-203ENST00000394725 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
SIAH1-203ENST00000394725 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.82■■■■■ 4.29
SIAH1-203ENST00000394725 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
SIAH1-203ENST00000394725 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.76■■■■■ 4.28
SIAH1-203ENST00000394725 GRIN2AQ12879 1464 aa41.74■■■■■ 4.27
SIAH1-203ENST00000394725 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.71■■■■■ 4.27
SIAH1-203ENST00000394725 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.7■■■■■ 4.27
SIAH1-203ENST00000394725 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
SIAH1-203ENST00000394725 CLSPNQ9HAW4 1339 aa41.65■■■■■ 4.26
SIAH1-203ENST00000394725 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.62■■■■■ 4.25
SIAH1-203ENST00000394725 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
SIAH1-203ENST00000394725 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.57■■■■■ 4.25
SIAH1-203ENST00000394725 SYNJ2O15056 1496 aa41.57■■■■■ 4.25
SIAH1-203ENST00000394725 HECW1Q76N89 1606 aa41.57■■■■■ 4.25
SIAH1-203ENST00000394725 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.56■■■■■ 4.24
SIAH1-203ENST00000394725 FBLN2P98095 1184 aa41.55■■■■■ 4.24
SIAH1-203ENST00000394725 DISP1Q96F81 1524 aa41.55■■■■■ 4.24
SIAH1-203ENST00000394725 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.54■■■■■ 4.24
SIAH1-203ENST00000394725 NCOA2Q15596 1464 aa41.54■■■■■ 4.24
SIAH1-203ENST00000394725 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.54■■■■■ 4.24
SIAH1-203ENST00000394725 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.54■■■■■ 4.24
SIAH1-203ENST00000394725 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.53■■■■■ 4.24
SIAH1-203ENST00000394725 KIAA0556O60303 1618 aa41.51■■■■■ 4.24
SIAH1-203ENST00000394725 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
SIAH1-203ENST00000394725 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
SIAH1-203ENST00000394725 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.48■■■■■ 4.23
SIAH1-203ENST00000394725 CEP170Q5SW79 1584 aa41.48■■■■■ 4.23
SIAH1-203ENST00000394725 ARID3CA6NKF2 412 aa41.45■■■■■ 4.23
SIAH1-203ENST00000394725 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
SIAH1-203ENST00000394725 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.43■■■■■ 4.22
SIAH1-203ENST00000394725 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
SIAH1-203ENST00000394725 ARHGEF11O15085 1522 aa41.36■■■■■ 4.21
SIAH1-203ENST00000394725 NUP160Q12769 1436 aa41.33■■■■■ 4.21
SIAH1-203ENST00000394725 MAPKBP1O60336 1514 aa41.27■■■■■ 4.2
SIAH1-203ENST00000394725 PTPRKQ15262 1439 aa41.27■■■■■ 4.2
SIAH1-203ENST00000394725 JPH4Q96JJ6 628 aa41.24■■■■■ 4.19
SIAH1-203ENST00000394725 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.24■■■■■ 4.19
SIAH1-203ENST00000394725 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.23■■■■■ 4.19
SIAH1-203ENST00000394725 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.23■■■■■ 4.19
SIAH1-203ENST00000394725 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.14■■■■■ 4.18
SIAH1-203ENST00000394725 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.11■■■■■ 4.17
SIAH1-203ENST00000394725 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
SIAH1-203ENST00000394725 HFM1A2PYH4 1435 aa41.1■■■■■ 4.17
SIAH1-203ENST00000394725 MIA2Q96PC5 1412 aa41.03■■■■■ 4.16
SIAH1-203ENST00000394725 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
SIAH1-203ENST00000394725 NAIPQ13075 1403 aa41.01■■■■■ 4.16
SIAH1-203ENST00000394725 SIN3AQ96ST3 1273 aa40.98■■■■■ 4.15
SIAH1-203ENST00000394725 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.96■■■■■ 4.15
SIAH1-203ENST00000394725 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
SIAH1-203ENST00000394725 NEUROD1Q13562 356 aa40.93■■■■■ 4.14
SIAH1-203ENST00000394725 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.91■■■■■ 4.14
SIAH1-203ENST00000394725 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
SIAH1-203ENST00000394725 CHD1O14646 1710 aa40.86■■■■■ 4.13
SIAH1-203ENST00000394725 UACAQ9BZF9 1416 aa40.86■■■■■ 4.13
SIAH1-203ENST00000394725 ABCA8O94911 1581 aa40.82■■■■■ 4.13
SIAH1-203ENST00000394725 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
SIAH1-203ENST00000394725 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.74■■■■■ 4.11
SIAH1-203ENST00000394725 AKNAQ7Z591 1439 aa40.74■■■■■ 4.11
SIAH1-203ENST00000394725 KIF14Q15058 1648 aa40.73■■■■■ 4.11
SIAH1-203ENST00000394725 DAPK1P53355 1430 aa40.72■■■■■ 4.11
SIAH1-203ENST00000394725 ATP10BO94823 1461 aa40.71■■■■■ 4.11
SIAH1-203ENST00000394725 PTPRGP23470 1445 aa40.7■■■■■ 4.11
SIAH1-203ENST00000394725 MIER1Q8N108 512 aa40.69■■■■■ 4.1
SIAH1-203ENST00000394725 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.68■■■■■ 4.1
SIAH1-203ENST00000394725 ABCC5O15440 1437 aa40.68■■■■■ 4.1
SIAH1-203ENST00000394725 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa40.67■■■■■ 4.1
SIAH1-203ENST00000394725 KDM6BO15054 1643 aa40.67■■■■■ 4.1
SIAH1-203ENST00000394725 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
SIAH1-203ENST00000394725 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
SIAH1-203ENST00000394725 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.66■■■■■ 4.1
SIAH1-203ENST00000394725 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms