RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384006.1

RNU6-641P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 641, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-641P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-641P-201ENST00000384006 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
RNU6-641P-201ENST00000384006 CHIC1Q5VXU3 224 aa16.6■□□□□ 0.25
RNU6-641P-201ENST00000384006 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RNU6-641P-201ENST00000384006 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
RNU6-641P-201ENST00000384006 PLPPR3Q6T4P5 718 aa13.53□□□□□ -0.24
RNU6-641P-201ENST00000384006 FOXD1Q16676 465 aa13.22□□□□□ -0.29
RNU6-641P-201ENST00000384006 PPP6R1Q9UPN7 881 aa12.77□□□□□ -0.37
RNU6-641P-201ENST00000384006 ADRA2BP18089 450 aa12.75□□□□□ -0.37
RNU6-641P-201ENST00000384006 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
RNU6-641P-201ENST00000384006 MSH5O43196 834 aa12.22□□□□□ -0.45
RNU6-641P-201ENST00000384006 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa11.9□□□□□ -0.5
RNU6-641P-201ENST00000384006 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 KCNA4P22459 653 aa11.73□□□□□ -0.53
RNU6-641P-201ENST00000384006 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
RNU6-641P-201ENST00000384006 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa11.58□□□□□ -0.56
RNU6-641P-201ENST00000384006 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
RNU6-641P-201ENST00000384006 NPM3O75607 178 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
RNU6-641P-201ENST00000384006 DMRT2Q9Y5R5 561 aa11.46□□□□□ -0.57
RNU6-641P-201ENST00000384006 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
RNU6-641P-201ENST00000384006 DNAJC5BQ9UF47 199 aa11.29□□□□□ -0.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
RNU6-641P-201ENST00000384006 EHMT2Q96KQ7 1210 aa10.93□□□□□ -0.66
RNU6-641P-201ENST00000384006 POTEDQ86YR6 584 aa10.86□□□□□ -0.67
RNU6-641P-201ENST00000384006 CSRNP3Q8WYN3 585 aa10.83□□□□□ -0.68
RNU6-641P-201ENST00000384006 FOXD4L1Q9NU39 408 aa10.83□□□□□ -0.68
RNU6-641P-201ENST00000384006 DCAF8L1A6NGE4 600 aa10.81□□□□□ -0.68
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZBTB22O15209 634 aa10.8□□□□□ -0.68
RNU6-641P-201ENST00000384006 SLC4A2P04920 1241 aa10.79□□□□□ -0.68
RNU6-641P-201ENST00000384006 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP10.66□□□□□ -0.7
RNU6-641P-201ENST00000384006 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
RNU6-641P-201ENST00000384006 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
RNU6-641P-201ENST00000384006 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
RNU6-641P-201ENST00000384006 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
RNU6-641P-201ENST00000384006 ATXN8OSP0DMR3 200 aa10.49□□□□□ -0.73
RNU6-641P-201ENST00000384006 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
RNU6-641P-201ENST00000384006 RNF39Q9H2S5 420 aa10.46□□□□□ -0.73
RNU6-641P-201ENST00000384006 APLP2Q06481 763 aa10.38□□□□□ -0.75
RNU6-641P-201ENST00000384006 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
RNU6-641P-201ENST00000384006 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
RNU6-641P-201ENST00000384006 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RNU6-641P-201ENST00000384006 CAPN15O75808 1086 aa10.11□□□□□ -0.79
RNU6-641P-201ENST00000384006 TRHP20396 242 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
RNU6-641P-201ENST00000384006 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
RNU6-641P-201ENST00000384006 DSG3P32926 999 aa9.97□□□□□ -0.81
RNU6-641P-201ENST00000384006 POLA2Q14181 598 aa9.95□□□□□ -0.82
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RNU6-641P-201ENST00000384006 ABCB7O75027 752 aa9.9□□□□□ -0.82
RNU6-641P-201ENST00000384006 FBLN2P98095 1184 aa9.87□□□□□ -0.83
RNU6-641P-201ENST00000384006 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
RNU6-641P-201ENST00000384006 FKBP8Q14318 412 aa9.76□□□□□ -0.85
RNU6-641P-201ENST00000384006 SPDYE4A6NLX3 237 aa9.68□□□□□ -0.86
RNU6-641P-201ENST00000384006 OSCARQ8IYS5 282 aa9.64□□□□□ -0.87
RNU6-641P-201ENST00000384006 SPDYE2BA6NHP3 402 aa9.63□□□□□ -0.87
RNU6-641P-201ENST00000384006 SPDYE6P0CI01 402 aa9.63□□□□□ -0.87
RNU6-641P-201ENST00000384006 SPDYE2Q495Y8 402 aa9.63□□□□□ -0.87
RNU6-641P-201ENST00000384006 PROM2Q8N271 834 aa9.63□□□□□ -0.87
RNU6-641P-201ENST00000384006 SSUH2Q9Y2M2 353 aa9.59□□□□□ -0.87
RNU6-641P-201ENST00000384006 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RNU6-641P-201ENST00000384006 FBXO3Q9UK99 471 aa9.46□□□□□ -0.9
RNU6-641P-201ENST00000384006 AKT1S1Q96B36 256 aa9.44□□□□□ -0.9
RNU6-641P-201ENST00000384006 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP9.41□□□□□ -0.9
RNU6-641P-201ENST00000384006 STAG3Q9UJ98 1225 aa9.35□□□□□ -0.91
RNU6-641P-201ENST00000384006 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
RNU6-641P-201ENST00000384006 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
RNU6-641P-201ENST00000384006 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
RNU6-641P-201ENST00000384006 PITPNM1O00562 1244 aa9.2□□□□□ -0.94
RNU6-641P-201ENST00000384006 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
RNU6-641P-201ENST00000384006 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
RNU6-641P-201ENST00000384006 CLEC11AQ9Y240 323 aa9.15□□□□□ -0.94
RNU6-641P-201ENST00000384006 PLEKHG5O94827 1062 aa9.13□□□□□ -0.95
RNU6-641P-201ENST00000384006 PRR29P0C7W0 189 aa9.13□□□□□ -0.95
RNU6-641P-201ENST00000384006 PLCD3Q8N3E9 789 aa9.12□□□□□ -0.95
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
RNU6-641P-201ENST00000384006 MIER1Q8N108 512 aa9.11□□□□□ -0.95
RNU6-641P-201ENST00000384006 CREBZFQ9NS37 354 aa9.08□□□□□ -0.96
RNU6-641P-201ENST00000384006 SPOCK2Q92563 424 aa9.06□□□□□ -0.96
RNU6-641P-201ENST00000384006 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
RNU6-641P-201ENST00000384006 CHRDL2Q6WN34 429 aa9.05□□□□□ -0.96
RNU6-641P-201ENST00000384006 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.04□□□□□ -0.96
RNU6-641P-201ENST00000384006 KLHL34Q8N239 644 aa9.04□□□□□ -0.96
RNU6-641P-201ENST00000384006 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
RNU6-641P-201ENST00000384006 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU6-641P-201ENST00000384006 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP8.94□□□□□ -0.98
RNU6-641P-201ENST00000384006 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
RNU6-641P-201ENST00000384006 NUBP1P53384 320 aa8.94□□□□□ -0.98
RNU6-641P-201ENST00000384006 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
RNU6-641P-201ENST00000384006 PKD2Q13563 968 aa8.91□□□□□ -0.98
RNU6-641P-201ENST00000384006 CHADLQ6NUI6 762 aa8.91□□□□□ -0.98
RNU6-641P-201ENST00000384006 GSE1Q14687 1217 aa8.89□□□□□ -0.99
RNU6-641P-201ENST00000384006 TRIM41Q8WV44 630 aa8.89□□□□□ -0.99
RNU6-641P-201ENST00000384006 FAM212AQ96EL1 285 aa8.87□□□□□ -0.99
RNU6-641P-201ENST00000384006 RASEFQ8IZ41 740 aa8.85□□□□□ -0.99
RNU6-641P-201ENST00000384006 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
RNU6-641P-201ENST00000384006 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
RNU6-641P-201ENST00000384006 DCAF8Q5TAQ9 597 aa8.79□□□□□ -1
RNU6-641P-201ENST00000384006 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
RNU6-641P-201ENST00000384006 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.9 ms