RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376227.3

CCDC22-201, Transcript of coiled-coil domain containing 22, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC22, Length 2,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22-201ENST00000376227 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.05■■■□□ 2.56
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CCDC22-201ENST00000376227 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
CCDC22-201ENST00000376227 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.2■■□□□ 1.3
CCDC22-201ENST00000376227 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.17■■□□□ 1.3
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CCDC22-201ENST00000376227 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
CCDC22-201ENST00000376227 KIF21BO75037 1637 aa22.98■■□□□ 1.27
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CCDC22-201ENST00000376227 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CCDC22-201ENST00000376227 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.73■■□□□ 1.23
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CCDC22-201ENST00000376227 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.03■■□□□ 1.12
CCDC22-201ENST00000376227 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.01■■□□□ 1.11
CCDC22-201ENST00000376227 ITGAEP38570 1179 aa21.98■■□□□ 1.11
CCDC22-201ENST00000376227 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.97■■□□□ 1.11
CCDC22-201ENST00000376227 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.97■■□□□ 1.11
CCDC22-201ENST00000376227 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.92■■□□□ 1.1
CCDC22-201ENST00000376227 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.88■■□□□ 1.09
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