RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
PTPRC-202ENST00000367364 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.27■■■■□ 3.08
PTPRC-202ENST00000367364 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
PTPRC-202ENST00000367364 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
PTPRC-202ENST00000367364 FOXD1Q16676 465 aa29.02■■■□□ 2.24
PTPRC-202ENST00000367364 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.2■■□□□ 1.94
PTPRC-202ENST00000367364 MSH5O43196 834 aa27.19■■□□□ 1.94
PTPRC-202ENST00000367364 POTEDQ86YR6 584 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRC-202ENST00000367364 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
PTPRC-202ENST00000367364 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.95■■□□□ 1.9
PTPRC-202ENST00000367364 ADRA2BP18089 450 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRC-202ENST00000367364 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PTPRC-202ENST00000367364 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.6■■□□□ 1.53
PTPRC-202ENST00000367364 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PTPRC-202ENST00000367364 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRC-202ENST00000367364 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
PTPRC-202ENST00000367364 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRC-202ENST00000367364 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPRC-202ENST00000367364 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRC-202ENST00000367364 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PTPRC-202ENST00000367364 RNF39Q9H2S5 420 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRC-202ENST00000367364 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRC-202ENST00000367364 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRC-202ENST00000367364 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRC-202ENST00000367364 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRC-202ENST00000367364 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
PTPRC-202ENST00000367364 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRC-202ENST00000367364 KCNA4P22459 653 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRC-202ENST00000367364 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PTPRC-202ENST00000367364 CAPN15O75808 1086 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRC-202ENST00000367364 DSG3P32926 999 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRC-202ENST00000367364 SLC4A2P04920 1241 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRC-202ENST00000367364 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
PTPRC-202ENST00000367364 APLP2Q06481 763 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRC-202ENST00000367364 ABCB7O75027 752 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
PTPRC-202ENST00000367364 POTEHQ6S545 545 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRC-202ENST00000367364 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PTPRC-202ENST00000367364 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
PTPRC-202ENST00000367364 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
PTPRC-202ENST00000367364 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
PTPRC-202ENST00000367364 POLA2Q14181 598 aa20.63■□□□□ 0.89
PTPRC-202ENST00000367364 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PTPRC-202ENST00000367364 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRC-202ENST00000367364 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRC-202ENST00000367364 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRC-202ENST00000367364 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRC-202ENST00000367364 ZBTB22O15209 634 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRC-202ENST00000367364 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PTPRC-202ENST00000367364 AKT1S1Q96B36 256 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRC-202ENST00000367364 OSCARQ8IYS5 282 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRC-202ENST00000367364 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
PTPRC-202ENST00000367364 ATXN8OSP0DMR3 200 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRC-202ENST00000367364 PIP4P2Q8N4L2 257 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRC-202ENST00000367364 PITPNM1O00562 1244 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRC-202ENST00000367364 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
PTPRC-202ENST00000367364 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP19.62■□□□□ 0.73
PTPRC-202ENST00000367364 SPDYE2BA6NHP3 402 aa19.52■□□□□ 0.72
PTPRC-202ENST00000367364 SPDYE6P0CI01 402 aa19.52■□□□□ 0.72
PTPRC-202ENST00000367364 FBLN2P98095 1184 aa19.52■□□□□ 0.72
PTPRC-202ENST00000367364 SPDYE2Q495Y8 402 aa19.52■□□□□ 0.72
PTPRC-202ENST00000367364 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
PTPRC-202ENST00000367364 HAX1O00165 279 aa19.44■□□□□ 0.7
PTPRC-202ENST00000367364 EVX2Q03828 476 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRC-202ENST00000367364 SSUH2Q9Y2M2 353 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
PTPRC-202ENST00000367364 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
PTPRC-202ENST00000367364 CLEC11AQ9Y240 323 aa19.23■□□□□ 0.67
PTPRC-202ENST00000367364 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
PTPRC-202ENST00000367364 C19orf67A6NJJ6 358 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRC-202ENST00000367364 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.97■□□□□ 0.63
PTPRC-202ENST00000367364 CHADLQ6NUI6 762 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRC-202ENST00000367364 CSRNP3Q8WYN3 585 aa18.91■□□□□ 0.62
PTPRC-202ENST00000367364 PRR29P0C7W0 189 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRC-202ENST00000367364 GABBR2O75899 941 aa18.79■□□□□ 0.6
PTPRC-202ENST00000367364 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
PTPRC-202ENST00000367364 CD44P16070 742 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
PTPRC-202ENST00000367364 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRC-202ENST00000367364 LHX8Q68G74 356 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRC-202ENST00000367364 POTEIP0CG38 1075 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRC-202ENST00000367364 CREBZFQ9NS37 354 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRC-202ENST00000367364 SPDYE4A6NLX3 237 aa18.33■□□□□ 0.52
PTPRC-202ENST00000367364 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRC-202ENST00000367364 CLCN6P51797 869 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRC-202ENST00000367364 ZRANB1Q9UGI0 708 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRC-202ENST00000367364 DCBLD2Q96PD2 775 aa18.15■□□□□ 0.5
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PTPRC-202ENST00000367364 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
PTPRC-202ENST00000367364 PHF12Q96QT6 1004 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRC-202ENST00000367364 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
PTPRC-202ENST00000367364 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP17.95■□□□□ 0.46
PTPRC-202ENST00000367364 PROM2Q8N271 834 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRC-202ENST00000367364 POTEB2H3BUK9 544 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRC-202ENST00000367364 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
PTPRC-202ENST00000367364 OTUD5Q96G74 571 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRC-202ENST00000367364 MS4A3Q96HJ5 214 aa17.77■□□□□ 0.44
PTPRC-202ENST00000367364 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
PTPRC-202ENST00000367364 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
PTPRC-202ENST00000367364 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
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