RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHIC1Q5VXU3 224 aa12.82□□□□□ -0.36
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RNU6-78P-201ENST00000362897 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLPPR3Q6T4P5 718 aa10.5□□□□□ -0.73
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXD1Q16676 465 aa10.16□□□□□ -0.78
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADRA2BP18089 450 aa9.91□□□□□ -0.82
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP6R1Q9UPN7 881 aa9.88□□□□□ -0.83
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
RNU6-78P-201ENST00000362897 MSH5O43196 834 aa9.34□□□□□ -0.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.26□□□□□ -0.93
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNA4P22459 653 aa9.23□□□□□ -0.93
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RNU6-78P-201ENST00000362897 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa8.97□□□□□ -0.97
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RNU6-78P-201ENST00000362897 DMRT2Q9Y5R5 561 aa8.8□□□□□ -1
RNU6-78P-201ENST00000362897 EHMT2Q96KQ7 1210 aa8.78□□□□□ -1
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RNU6-78P-201ENST00000362897 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNAJC5BQ9UF47 199 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU6-78P-201ENST00000362897 CSRNP3Q8WYN3 585 aa8.55□□□□□ -1.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZBTB22O15209 634 aa8.48□□□□□ -1.05
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXD4L1Q9NU39 408 aa8.46□□□□□ -1.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 DCAF8L1A6NGE4 600 aa8.44□□□□□ -1.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC4A2P04920 1241 aa8.38□□□□□ -1.07
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RNU6-78P-201ENST00000362897 POTEDQ86YR6 584 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATXN8OSP0DMR3 200 aa8.15□□□□□ -1.1
RNU6-78P-201ENST00000362897 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
RNU6-78P-201ENST00000362897 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
RNU6-78P-201ENST00000362897 APLP2Q06481 763 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF39Q9H2S5 420 aa8.01□□□□□ -1.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
RNU6-78P-201ENST00000362897 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
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RNU6-78P-201ENST00000362897 TRHP20396 242 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
RNU6-78P-201ENST00000362897 FKBP8Q14318 412 aa7.76□□□□□ -1.17
RNU6-78P-201ENST00000362897 POLA2Q14181 598 aa7.75□□□□□ -1.17
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABCB7O75027 752 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBLN2P98095 1184 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU6-78P-201ENST00000362897 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RNU6-78P-201ENST00000362897 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
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RNU6-78P-201ENST00000362897 OSCARQ8IYS5 282 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 PROM2Q8N271 834 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPDYE2BA6NHP3 402 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPDYE6P0CI01 402 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPDYE2Q495Y8 402 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBXO3Q9UK99 471 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 SSUH2Q9Y2M2 353 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-78P-201ENST00000362897 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 VASPP50552 380 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
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RNU6-78P-201ENST00000362897 STAG3Q9UJ98 1225 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 AKT1S1Q96B36 256 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-78P-201ENST00000362897 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLCD3Q8N3E9 789 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLEKHG5O94827 1062 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 MIER1Q8N108 512 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLHL34Q8N239 644 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLEC11AQ9Y240 323 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPOCK2Q92563 424 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RNU6-78P-201ENST00000362897 PITPNM1O00562 1244 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRR29P0C7W0 189 aa7.11□□□□□ -1.27
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RNU6-78P-201ENST00000362897 PKD2Q13563 968 aa7.04□□□□□ -1.28
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RNU6-78P-201ENST00000362897 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
RNU6-78P-201ENST00000362897 DCAF8L2P0C7V8 631 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-78P-201ENST00000362897 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RNU6-78P-201ENST00000362897 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP6.97□□□□□ -1.29
RNU6-78P-201ENST00000362897 NUBP1P53384 320 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-78P-201ENST00000362897 GSE1Q14687 1217 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHADLQ6NUI6 762 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHRDL2Q6WN34 429 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM212AQ96EL1 285 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM41Q8WV44 630 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RNU6-78P-201ENST00000362897 DCAF8Q5TAQ9 597 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-78P-201ENST00000362897 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
RNU6-78P-201ENST00000362897 RASEFQ8IZ41 740 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-78P-201ENST00000362897 RGL2O15211 777 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC24A1O60721 1099 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-78P-201ENST00000362897 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
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