RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 CHIC1Q5VXU3 224 aa14.29□□□□□ -0.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 POTEDQ86YR6 584 aa13.85□□□□□ -0.19
RNU6-227P-201ENST00000362865 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
RNU6-227P-201ENST00000362865 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 FOXD1Q16676 465 aa12.58□□□□□ -0.4
RNU6-227P-201ENST00000362865 MSH5O43196 834 aa12.1□□□□□ -0.47
RNU6-227P-201ENST00000362865 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
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RNU6-227P-201ENST00000362865 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPP6R1Q9UPN7 881 aa10.92□□□□□ -0.66
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADRA2BP18089 450 aa10.79□□□□□ -0.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 POTEHQ6S545 545 aa10.59□□□□□ -0.71
RNU6-227P-201ENST00000362865 DMRT2Q9Y5R5 561 aa10.36□□□□□ -0.75
RNU6-227P-201ENST00000362865 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
RNU6-227P-201ENST00000362865 RNF39Q9H2S5 420 aa10.28□□□□□ -0.76
RNU6-227P-201ENST00000362865 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RNU6-227P-201ENST00000362865 DCAF8L1A6NGE4 600 aa9.97□□□□□ -0.81
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.9□□□□□ -0.82
RNU6-227P-201ENST00000362865 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 KCNA4P22459 653 aa9.72□□□□□ -0.85
RNU6-227P-201ENST00000362865 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RNU6-227P-201ENST00000362865 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa9.61□□□□□ -0.87
RNU6-227P-201ENST00000362865 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RNU6-227P-201ENST00000362865 NPM3O75607 178 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RNU6-227P-201ENST00000362865 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
RNU6-227P-201ENST00000362865 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 DNAJC5BQ9UF47 199 aa9.36□□□□□ -0.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 DSG3P32926 999 aa9.26□□□□□ -0.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.2□□□□□ -0.94
RNU6-227P-201ENST00000362865 CHRDL2Q6WN34 429 aa9.09□□□□□ -0.95
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP9.03□□□□□ -0.96
RNU6-227P-201ENST00000362865 EHMT2Q96KQ7 1210 aa9.02□□□□□ -0.97
RNU6-227P-201ENST00000362865 CAPN15O75808 1086 aa9□□□□□ -0.97
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC4A2P04920 1241 aa9□□□□□ -0.97
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZBTB22O15209 634 aa8.96□□□□□ -0.98
RNU6-227P-201ENST00000362865 CSRNP3Q8WYN3 585 aa8.92□□□□□ -0.98
RNU6-227P-201ENST00000362865 FOXD4L1Q9NU39 408 aa8.91□□□□□ -0.98
RNU6-227P-201ENST00000362865 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
RNU6-227P-201ENST00000362865 LHX8Q68G74 356 aa8.79□□□□□ -1
RNU6-227P-201ENST00000362865 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
RNU6-227P-201ENST00000362865 HAX1O00165 279 aa8.76□□□□□ -1.01
RNU6-227P-201ENST00000362865 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
RNU6-227P-201ENST00000362865 ABCB7O75027 752 aa8.74□□□□□ -1.01
RNU6-227P-201ENST00000362865 EVX2Q03828 476 aa8.69□□□□□ -1.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8.66□□□□□ -1.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRHP20396 242 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATXN8OSP0DMR3 200 aa8.59□□□□□ -1.03
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RNU6-227P-201ENST00000362865 APLP2Q06481 763 aa8.54□□□□□ -1.04
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RNU6-227P-201ENST00000362865 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8.41□□□□□ -1.06
RNU6-227P-201ENST00000362865 POTEMA6NI47 508 aa8.36□□□□□ -1.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 GABBR2O75899 941 aa8.35□□□□□ -1.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 AKT1S1Q96B36 256 aa8.35□□□□□ -1.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 POLA2Q14181 598 aa8.34□□□□□ -1.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RNU6-227P-201ENST00000362865 POTEGQ6S5H5 508 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU6-227P-201ENST00000362865 PITPNM1O00562 1244 aa8.27□□□□□ -1.09
RNU6-227P-201ENST00000362865 POTEIP0CG38 1075 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-227P-201ENST00000362865 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
RNU6-227P-201ENST00000362865 C19orf67A6NJJ6 358 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
RNU6-227P-201ENST00000362865 FBLN2P98095 1184 aa8.16□□□□□ -1.1
RNU6-227P-201ENST00000362865 PCDH10Q9P2E7 1040 aa8.16□□□□□ -1.1
RNU6-227P-201ENST00000362865 OTUD5Q96G74 571 aa8.1□□□□□ -1.11
RNU6-227P-201ENST00000362865 OSCARQ8IYS5 282 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 FKBP8Q14318 412 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPDYE4A6NLX3 237 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPDYE2BA6NHP3 402 aa7.97□□□□□ -1.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPDYE6P0CI01 402 aa7.97□□□□□ -1.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPDYE2Q495Y8 402 aa7.97□□□□□ -1.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 POTEB2H3BUK9 544 aa7.95□□□□□ -1.14
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
RNU6-227P-201ENST00000362865 SSUH2Q9Y2M2 353 aa7.93□□□□□ -1.14
RNU6-227P-201ENST00000362865 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
RNU6-227P-201ENST00000362865 PROM2Q8N271 834 aa7.89□□□□□ -1.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP7.86□□□□□ -1.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 DCBLD2Q96PD2 775 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU6-227P-201ENST00000362865 CHADLQ6NUI6 762 aa7.73□□□□□ -1.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 FBXO3Q9UK99 471 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 STAG3Q9UJ98 1225 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 CLEC11AQ9Y240 323 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 CD44P16070 742 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 CLCN6P51797 869 aa7.68□□□□□ -1.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 MMRN1Q13201 1228 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 POTEJP0CG39 1038 aa7.65□□□□□ -1.18
RNU6-227P-201ENST00000362865 VASPP50552 380 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRR29P0C7W0 189 aa7.63□□□□□ -1.19
RNU6-227P-201ENST00000362865 MIER1Q8N108 512 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-227P-201ENST00000362865 CREBZFQ9NS37 354 aa7.57□□□□□ -1.2
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