RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354625.6

RPS6KL1-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPS6KL1, Length 5,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-201ENST00000354625 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.89■■□□□ 1.89
RPS6KL1-201ENST00000354625 NISCHQ9Y2I1 1504 aa25.89■■□□□ 1.73
RPS6KL1-201ENST00000354625 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
RPS6KL1-201ENST00000354625 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.25■■□□□ 1.63
RPS6KL1-201ENST00000354625 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.78■■□□□ 1.56
RPS6KL1-201ENST00000354625 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
RPS6KL1-201ENST00000354625 APLP2Q06481 763 aa24.1■■□□□ 1.45
RPS6KL1-201ENST00000354625 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.98■■□□□ 1.43
RPS6KL1-201ENST00000354625 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
RPS6KL1-201ENST00000354625 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
RPS6KL1-201ENST00000354625 TRIM41Q8WV44 630 aa23.72■■□□□ 1.39
RPS6KL1-201ENST00000354625 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
RPS6KL1-201ENST00000354625 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
RPS6KL1-201ENST00000354625 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
RPS6KL1-201ENST00000354625 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
RPS6KL1-201ENST00000354625 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
RPS6KL1-201ENST00000354625 MYT1Q01538 1121 aa23.32■■□□□ 1.32
RPS6KL1-201ENST00000354625 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
RPS6KL1-201ENST00000354625 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
RPS6KL1-201ENST00000354625 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.99■■□□□ 1.27
RPS6KL1-201ENST00000354625 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
RPS6KL1-201ENST00000354625 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.91■■□□□ 1.26
RPS6KL1-201ENST00000354625 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.89■■□□□ 1.26
RPS6KL1-201ENST00000354625 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
RPS6KL1-201ENST00000354625 HRCP23327 699 aa22.86■■□□□ 1.25
RPS6KL1-201ENST00000354625 NEFLP07196 543 aa22.68■■□□□ 1.22
RPS6KL1-201ENST00000354625 ITGAEP38570 1179 aa22.68■■□□□ 1.22
RPS6KL1-201ENST00000354625 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
RPS6KL1-201ENST00000354625 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
RPS6KL1-201ENST00000354625 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.35■■□□□ 1.17
RPS6KL1-201ENST00000354625 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.3■■□□□ 1.16
RPS6KL1-201ENST00000354625 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
RPS6KL1-201ENST00000354625 ABCC9O60706 1549 aa22.27■■□□□ 1.15
RPS6KL1-201ENST00000354625 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
RPS6KL1-201ENST00000354625 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RPS6KL1-201ENST00000354625 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RPS6KL1-201ENST00000354625 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.91■■□□□ 1.1
RPS6KL1-201ENST00000354625 NEUROD1Q13562 356 aa21.89■■□□□ 1.09
RPS6KL1-201ENST00000354625 TRIM52Q96A61 297 aa21.89■■□□□ 1.09
RPS6KL1-201ENST00000354625 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
RPS6KL1-201ENST00000354625 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
RPS6KL1-201ENST00000354625 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.74■■□□□ 1.07
RPS6KL1-201ENST00000354625 FBLN2P98095 1184 aa21.67■■□□□ 1.06
RPS6KL1-201ENST00000354625 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
RPS6KL1-201ENST00000354625 P3H3Q8IVL6 736 aa21.66■■□□□ 1.06
RPS6KL1-201ENST00000354625 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
RPS6KL1-201ENST00000354625 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
RPS6KL1-201ENST00000354625 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
RPS6KL1-201ENST00000354625 BCANQ96GW7 911 aa21.59■■□□□ 1.05
RPS6KL1-201ENST00000354625 ANP32CO43423 234 aa21.58■■□□□ 1.05
RPS6KL1-201ENST00000354625 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.57■■□□□ 1.04
RPS6KL1-201ENST00000354625 ARID3CA6NKF2 412 aa21.56■■□□□ 1.04
RPS6KL1-201ENST00000354625 SCRIBQ14160 1630 aa21.42■■□□□ 1.02
RPS6KL1-201ENST00000354625 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
RPS6KL1-201ENST00000354625 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
RPS6KL1-201ENST00000354625 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
RPS6KL1-201ENST00000354625 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
RPS6KL1-201ENST00000354625 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.2■□□□□ 0.99
RPS6KL1-201ENST00000354625 TONSLQ96HA7 1378 aa21.14■□□□□ 0.97
RPS6KL1-201ENST00000354625 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
RPS6KL1-201ENST00000354625 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
RPS6KL1-201ENST00000354625 BCL11AQ9H165 835 aa21.09■□□□□ 0.97
RPS6KL1-201ENST00000354625 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
RPS6KL1-201ENST00000354625 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.06■□□□□ 0.96
RPS6KL1-201ENST00000354625 SLC24A1O60721 1099 aa21.03■□□□□ 0.96
RPS6KL1-201ENST00000354625 NEFMP07197 916 aa21.02■□□□□ 0.96
RPS6KL1-201ENST00000354625 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21■□□□□ 0.95
RPS6KL1-201ENST00000354625 FKBP8Q14318 412 aa21■□□□□ 0.95
RPS6KL1-201ENST00000354625 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
RPS6KL1-201ENST00000354625 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.96■□□□□ 0.95
RPS6KL1-201ENST00000354625 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
RPS6KL1-201ENST00000354625 CLIP1P30622 1438 aa20.92■□□□□ 0.94
RPS6KL1-201ENST00000354625 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
RPS6KL1-201ENST00000354625 MYO15BQ96JP2 1530 aa20.89■□□□□ 0.94
RPS6KL1-201ENST00000354625 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.89■□□□□ 0.94
RPS6KL1-201ENST00000354625 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.89■□□□□ 0.93
RPS6KL1-201ENST00000354625 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
RPS6KL1-201ENST00000354625 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.88■□□□□ 0.93
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RPS6KL1-201ENST00000354625 TSPY4P0CV99 314 aa20.83■□□□□ 0.93
RPS6KL1-201ENST00000354625 TSPY10P0CW01 314 aa20.83■□□□□ 0.93
RPS6KL1-201ENST00000354625 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
RPS6KL1-201ENST00000354625 MIER1Q8N108 512 aa20.82■□□□□ 0.92
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RPS6KL1-201ENST00000354625 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.81■□□□□ 0.92
RPS6KL1-201ENST00000354625 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.81■□□□□ 0.92
RPS6KL1-201ENST00000354625 TMC1Q8TDI8 760 aa20.8■□□□□ 0.92
RPS6KL1-201ENST00000354625 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
RPS6KL1-201ENST00000354625 CEP162Q5TB80 1403 aa20.76■□□□□ 0.91
RPS6KL1-201ENST00000354625 MRS2Q9HD23 443 aa20.76■□□□□ 0.91
RPS6KL1-201ENST00000354625 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.75■□□□□ 0.91
RPS6KL1-201ENST00000354625 EEA1Q15075 1411 aa20.71■□□□□ 0.91
RPS6KL1-201ENST00000354625 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.71■□□□□ 0.91
RPS6KL1-201ENST00000354625 GOLGA3Q08378 1498 aa20.7■□□□□ 0.9
RPS6KL1-201ENST00000354625 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.69■□□□□ 0.9
RPS6KL1-201ENST00000354625 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.67■□□□□ 0.9
RPS6KL1-201ENST00000354625 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa20.66■□□□□ 0.9
RPS6KL1-201ENST00000354625 NBR1Q14596 966 aa20.66■□□□□ 0.9
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