RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297598.4

PDP1-201, Transcript of pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDP1, Length 4,272 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1-201ENST00000297598 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.5■■□□□ 1.99
PDP1-201ENST00000297598 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.34■■□□□ 1.81
PDP1-201ENST00000297598 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
PDP1-201ENST00000297598 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.16■■□□□ 1.78
PDP1-201ENST00000297598 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.29■■□□□ 1.64
PDP1-201ENST00000297598 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.15■■□□□ 1.62
PDP1-201ENST00000297598 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
PDP1-201ENST00000297598 HRCP23327 699 aa24.62■■□□□ 1.53
PDP1-201ENST00000297598 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
PDP1-201ENST00000297598 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.45■■□□□ 1.5
PDP1-201ENST00000297598 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.44■■□□□ 1.5
PDP1-201ENST00000297598 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
PDP1-201ENST00000297598 TRIM41Q8WV44 630 aa24.1■■□□□ 1.45
PDP1-201ENST00000297598 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
PDP1-201ENST00000297598 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.42
PDP1-201ENST00000297598 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
PDP1-201ENST00000297598 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
PDP1-201ENST00000297598 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PDP1-201ENST00000297598 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PDP1-201ENST00000297598 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PDP1-201ENST00000297598 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PDP1-201ENST00000297598 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.52■■□□□ 1.36
PDP1-201ENST00000297598 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
PDP1-201ENST00000297598 APLP2Q06481 763 aa23.39■■□□□ 1.33
PDP1-201ENST00000297598 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
PDP1-201ENST00000297598 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
PDP1-201ENST00000297598 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.11■■□□□ 1.29
PDP1-201ENST00000297598 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PDP1-201ENST00000297598 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
PDP1-201ENST00000297598 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.98■■□□□ 1.27
PDP1-201ENST00000297598 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
PDP1-201ENST00000297598 NEUROD1Q13562 356 aa22.84■■□□□ 1.25
PDP1-201ENST00000297598 ITGAEP38570 1179 aa22.8■■□□□ 1.24
PDP1-201ENST00000297598 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PDP1-201ENST00000297598 MYT1Q01538 1121 aa22.65■■□□□ 1.22
PDP1-201ENST00000297598 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PDP1-201ENST00000297598 ABCC9O60706 1549 aa22.48■■□□□ 1.19
PDP1-201ENST00000297598 BCANQ96GW7 911 aa22.44■■□□□ 1.18
PDP1-201ENST00000297598 NEFLP07196 543 aa22.44■■□□□ 1.18
PDP1-201ENST00000297598 SCRIBQ14160 1630 aa22.38■■□□□ 1.17
PDP1-201ENST00000297598 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
PDP1-201ENST00000297598 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.37■■□□□ 1.17
PDP1-201ENST00000297598 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.35■■□□□ 1.17
PDP1-201ENST00000297598 MIER1Q8N108 512 aa22.34■■□□□ 1.17
PDP1-201ENST00000297598 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PDP1-201ENST00000297598 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.31■■□□□ 1.16
PDP1-201ENST00000297598 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PDP1-201ENST00000297598 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PDP1-201ENST00000297598 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.99■■□□□ 1.11
PDP1-201ENST00000297598 CEP162Q5TB80 1403 aa21.93■■□□□ 1.1
PDP1-201ENST00000297598 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.91■■□□□ 1.1
PDP1-201ENST00000297598 FKBP8Q14318 412 aa21.9■■□□□ 1.1
PDP1-201ENST00000297598 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.9■■□□□ 1.1
PDP1-201ENST00000297598 P3H3Q8IVL6 736 aa21.89■■□□□ 1.09
PDP1-201ENST00000297598 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PDP1-201ENST00000297598 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PDP1-201ENST00000297598 TRIM52Q96A61 297 aa21.81■■□□□ 1.08
PDP1-201ENST00000297598 ANP32CO43423 234 aa21.78■■□□□ 1.08
PDP1-201ENST00000297598 SOGA1O94964 1423 aa21.74■■□□□ 1.07
PDP1-201ENST00000297598 CLIP1P30622 1438 aa21.7■■□□□ 1.06
PDP1-201ENST00000297598 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.65■■□□□ 1.06
PDP1-201ENST00000297598 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PDP1-201ENST00000297598 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PDP1-201ENST00000297598 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.61■■□□□ 1.05
PDP1-201ENST00000297598 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.59■■□□□ 1.05
PDP1-201ENST00000297598 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
PDP1-201ENST00000297598 ABCC8Q09428 1581 aa21.57■■□□□ 1.04
PDP1-201ENST00000297598 ARID3CA6NKF2 412 aa21.56■■□□□ 1.04
PDP1-201ENST00000297598 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
PDP1-201ENST00000297598 GOLGA3Q08378 1498 aa21.52■■□□□ 1.04
PDP1-201ENST00000297598 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PDP1-201ENST00000297598 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.48■■□□□ 1.03
PDP1-201ENST00000297598 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.46■■□□□ 1.03
PDP1-201ENST00000297598 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
PDP1-201ENST00000297598 KCNH8Q96L42 1107 aa21.42■■□□□ 1.02
PDP1-201ENST00000297598 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.41■■□□□ 1.02
PDP1-201ENST00000297598 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.41■■□□□ 1.02
PDP1-201ENST00000297598 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.41■■□□□ 1.02
PDP1-201ENST00000297598 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PDP1-201ENST00000297598 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.38■■□□□ 1.01
PDP1-201ENST00000297598 WIZO95785 1651 aa21.37■■□□□ 1.01
PDP1-201ENST00000297598 EEA1Q15075 1411 aa21.37■■□□□ 1.01
PDP1-201ENST00000297598 TONSLQ96HA7 1378 aa21.36■■□□□ 1.01
PDP1-201ENST00000297598 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.34■■□□□ 1.01
PDP1-201ENST00000297598 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PDP1-201ENST00000297598 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.3■■□□□ 1
PDP1-201ENST00000297598 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.28■■□□□ 1
PDP1-201ENST00000297598 NBR1Q14596 966 aa21.26■□□□□ 0.99
PDP1-201ENST00000297598 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
PDP1-201ENST00000297598 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
PDP1-201ENST00000297598 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
PDP1-201ENST00000297598 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
PDP1-201ENST00000297598 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.19■□□□□ 0.98
PDP1-201ENST00000297598 NACADO15069 1562 aa21.16■□□□□ 0.98
PDP1-201ENST00000297598 MRS2Q9HD23 443 aa21.15■□□□□ 0.98
PDP1-201ENST00000297598 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
PDP1-201ENST00000297598 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.15■□□□□ 0.98
PDP1-201ENST00000297598 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.11■□□□□ 0.97
PDP1-201ENST00000297598 BCL11AQ9H165 835 aa21.08■□□□□ 0.96
PDP1-201ENST00000297598 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
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