RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268124.9

POLG-201, Transcript of DNA polymerase gamma, catalytic subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene POLG, Length 4,500 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLG-201ENST00000268124 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.68■■□□□ 1.86
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POLG-201ENST00000268124 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
POLG-201ENST00000268124 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.35■■□□□ 1.49
POLG-201ENST00000268124 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.14■■□□□ 1.3
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POLG-201ENST00000268124 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
POLG-201ENST00000268124 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.73■■□□□ 1.23
POLG-201ENST00000268124 HRCP23327 699 aa22.56■■□□□ 1.2
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POLG-201ENST00000268124 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.51■■□□□ 1.19
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POLG-201ENST00000268124 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
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POLG-201ENST00000268124 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.23■■□□□ 1.15
POLG-201ENST00000268124 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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POLG-201ENST00000268124 ABCC9O60706 1549 aa22.05■■□□□ 1.12
POLG-201ENST00000268124 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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POLG-201ENST00000268124 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.78■■□□□ 1.08
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POLG-201ENST00000268124 SCRIBQ14160 1630 aa21.66■■□□□ 1.06
POLG-201ENST00000268124 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
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POLG-201ENST00000268124 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.47■■□□□ 1.03
POLG-201ENST00000268124 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
POLG-201ENST00000268124 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
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POLG-201ENST00000268124 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
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POLG-201ENST00000268124 ITGAEP38570 1179 aa21.1■□□□□ 0.97
POLG-201ENST00000268124 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.09■□□□□ 0.97
POLG-201ENST00000268124 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.06■□□□□ 0.96
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POLG-201ENST00000268124 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
POLG-201ENST00000268124 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
POLG-201ENST00000268124 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
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POLG-201ENST00000268124 EEA1Q15075 1411 aa20.63■□□□□ 0.89
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POLG-201ENST00000268124 CEP162Q5TB80 1403 aa20.58■□□□□ 0.88
POLG-201ENST00000268124 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
POLG-201ENST00000268124 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
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POLG-201ENST00000268124 WIZO95785 1651 aa20.45■□□□□ 0.86
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POLG-201ENST00000268124 BCANQ96GW7 911 aa20.42■□□□□ 0.86
POLG-201ENST00000268124 SOGA1O94964 1423 aa20.41■□□□□ 0.86
POLG-201ENST00000268124 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.36■□□□□ 0.85
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POLG-201ENST00000268124 ABCC8Q09428 1581 aa20.34■□□□□ 0.85
POLG-201ENST00000268124 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
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POLG-201ENST00000268124 TRIM52Q96A61 297 aa20.28■□□□□ 0.84
POLG-201ENST00000268124 KIF27Q86VH2 1401 aa20.21■□□□□ 0.83
POLG-201ENST00000268124 SMARCA4P51532 1647 aa20.2■□□□□ 0.82
POLG-201ENST00000268124 ANP32CO43423 234 aa20.2■□□□□ 0.82
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POLG-201ENST00000268124 SMARCA2P51531 1590 aa20.17■□□□□ 0.82
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POLG-201ENST00000268124 ARID3CA6NKF2 412 aa20.12■□□□□ 0.81
POLG-201ENST00000268124 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
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POLG-201ENST00000268124 FKBP8Q14318 412 aa20.05■□□□□ 0.8
POLG-201ENST00000268124 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.04■□□□□ 0.8
POLG-201ENST00000268124 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.02■□□□□ 0.8
POLG-201ENST00000268124 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.02■□□□□ 0.8
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POLG-201ENST00000268124 TONSLQ96HA7 1378 aa19.97■□□□□ 0.79
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POLG-201ENST00000268124 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
POLG-201ENST00000268124 CHIC2Q9UKJ5 165 aa19.88■□□□□ 0.77
POLG-201ENST00000268124 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP19.85■□□□□ 0.77
POLG-201ENST00000268124 CCNB3Q8WWL7 1395 aa19.83■□□□□ 0.77
POLG-201ENST00000268124 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.83■□□□□ 0.76
POLG-201ENST00000268124 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.8■□□□□ 0.76
POLG-201ENST00000268124 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
POLG-201ENST00000268124 FAM9BQ8IZU0 186 aa19.74■□□□□ 0.75
POLG-201ENST00000268124 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
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