RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 DCAF8L2P0C7V8 631 aa9.91□□□□□ -0.82
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LMO3-201ENST00000261169 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
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LMO3-201ENST00000261169 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LMO3-201ENST00000261169 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
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LMO3-201ENST00000261169 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa7.94□□□□□ -1.14
LMO3-201ENST00000261169 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa7.94□□□□□ -1.14
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LMO3-201ENST00000261169 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa7.88□□□□□ -1.15
LMO3-201ENST00000261169 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
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LMO3-201ENST00000261169 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
LMO3-201ENST00000261169 MYT1Q01538 1121 aa7.8□□□□□ -1.16
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LMO3-201ENST00000261169 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
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LMO3-201ENST00000261169 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
LMO3-201ENST00000261169 CHIC2Q9UKJ5 165 aa7.77□□□□□ -1.17
LMO3-201ENST00000261169 CLSPNQ9HAW4 1339 aa7.75□□□□□ -1.17
LMO3-201ENST00000261169 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.72□□□□□ -1.17
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LMO3-201ENST00000261169 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
LMO3-201ENST00000261169 FKBP8Q14318 412 aa7.68□□□□□ -1.18
LMO3-201ENST00000261169 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
LMO3-201ENST00000261169 FAM9BQ8IZU0 186 aa7.68□□□□□ -1.18
LMO3-201ENST00000261169 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
LMO3-201ENST00000261169 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP7.66□□□□□ -1.18
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LMO3-201ENST00000261169 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP7.65□□□□□ -1.18
LMO3-201ENST00000261169 PLPPR3Q6T4P5 718 aa7.65□□□□□ -1.19
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LMO3-201ENST00000261169 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa7.64□□□□□ -1.19
LMO3-201ENST00000261169 TONSLQ96HA7 1378 aa7.64□□□□□ -1.19
LMO3-201ENST00000261169 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa7.64□□□□□ -1.19
LMO3-201ENST00000261169 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
LMO3-201ENST00000261169 SLC24A1O60721 1099 aa7.63□□□□□ -1.19
LMO3-201ENST00000261169 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
LMO3-201ENST00000261169 CLIP1P30622 1438 aa7.62□□□□□ -1.19
LMO3-201ENST00000261169 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
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LMO3-201ENST00000261169 DNAJC5BQ9UF47 199 aa7.6□□□□□ -1.19
LMO3-201ENST00000261169 CEP162Q5TB80 1403 aa7.59□□□□□ -1.19
LMO3-201ENST00000261169 SIN3AQ96ST3 1273 aa7.58□□□□□ -1.2
LMO3-201ENST00000261169 MTUS2Q5JR59 1369 aa7.58□□□□□ -1.2
LMO3-201ENST00000261169 CANXP27824 592 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
LMO3-201ENST00000261169 KCNH8Q96L42 1107 aa7.56□□□□□ -1.2
LMO3-201ENST00000261169 RGL3Q3MIN7 710 aa7.56□□□□□ -1.2
LMO3-201ENST00000261169 MRS2Q9HD23 443 aa7.56□□□□□ -1.2
LMO3-201ENST00000261169 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LMO3-201ENST00000261169 TMC1Q8TDI8 760 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-201ENST00000261169 SOGA1O94964 1423 aa7.54□□□□□ -1.2
LMO3-201ENST00000261169 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
LMO3-201ENST00000261169 TSPY4P0CV99 314 aa7.53□□□□□ -1.2
LMO3-201ENST00000261169 TSPY10P0CW01 314 aa7.53□□□□□ -1.2
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