RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000213553.1

Gm30570-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm30570, Length 2,651 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm30570-201ENSMUST00000213553 NischQ80TM9 1593 aa11.84□□□□□ -0.51
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa11.65□□□□□ -0.55
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Abcc9P70170 1546 aa11.52□□□□□ -0.57
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Abcc8B2RUS7 1588 aa11.27□□□□□ -0.6
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Rhox8Q6VSS7 320 aa11.01□□□□□ -0.65
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa10.98□□□□□ -0.65
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Rtl1Q7M732 1744 aa10.78□□□□□ -0.68
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Ccdc180J3QNE4 1664 aa10.71□□□□□ -0.69
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Pcgf6Q99NA9 353 aa10.63□□□□□ -0.71
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
Gm30570-201ENSMUST00000213553 ScribQ80U72 1612 aa10.51□□□□□ -0.73
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Dcaf1Q80TR8 1506 aa10.48□□□□□ -0.73
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa10.36□□□□□ -0.75
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Chic1Q8CBW7 227 aa10.29□□□□□ -0.76
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Kdm5dQ62240 1548 aa10.29□□□□□ -0.76
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Neurod1Q60867 357 aa10.28□□□□□ -0.76
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Baz1aO88379 1555 aa10.25□□□□□ -0.77
Gm30570-201ENSMUST00000213553 HrcG5E8J6 738 aa10.21□□□□□ -0.78
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Trim41Q5NCC3 630 aa10.21□□□□□ -0.78
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa10.19□□□□□ -0.78
Gm30570-201ENSMUST00000213553 NacadQ5SWP3 1504 aa10.15□□□□□ -0.78
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Zeb1Q64318 1117 aa10.14□□□□□ -0.79
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Crybg2B7ZCC2 1516 aa10.05□□□□□ -0.8
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Smarca2Q6DIC0 1577 aa10.05□□□□□ -0.8
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Cngb1E1AZ71 1325 aa10.02□□□□□ -0.81
Gm30570-201ENSMUST00000213553 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa10.01□□□□□ -0.81
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Csrnp3P59055 597 aa9.98□□□□□ -0.81
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Sycp2Q9CUU3 1500 aa9.97□□□□□ -0.81
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Sall2Q9QX96 1004 aa9.96□□□□□ -0.82
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Anks4bQ8K3X6 423 aa9.87□□□□□ -0.83
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Cep164Q5DU05 1446 aa9.87□□□□□ -0.83
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa9.85□□□□□ -0.83
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Mier1Q5UAK0 511 aa9.85□□□□□ -0.83
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Gab3Q8BSM5 595 aa9.84□□□□□ -0.83
Gm30570-201ENSMUST00000213553 NefmP08553 848 aa9.83□□□□□ -0.84
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Gm38655A0A286YDK6 273 aa9.82□□□□□ -0.84
Gm30570-201ENSMUST00000213553 CenpbP27790 599 aa9.82□□□□□ -0.84
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Wdr66E9Q743 1299 aa9.81□□□□□ -0.84
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa9.8□□□□□ -0.84
Gm30570-201ENSMUST00000213553 BicraF8VPZ9 1578 aa9.79□□□□□ -0.84
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa9.74□□□□□ -0.85
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Synj1Q8CHC4 1574 aa9.73□□□□□ -0.85
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Aplp2Q06335 707 aa9.71□□□□□ -0.86
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Golga3P55937 1487 aa9.7□□□□□ -0.86
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Myt1Q8CFC2 1127 aa9.69□□□□□ -0.86
Gm30570-201ENSMUST00000213553 CftrP26361 1476 aa9.66□□□□□ -0.86
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Plppr3Q7TPB0 716 aa9.64□□□□□ -0.87
Gm30570-201ENSMUST00000213553 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Top2bQ64511 1612 aa9.62□□□□□ -0.87
Gm30570-201ENSMUST00000213553 UbtfP25976 765 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Gm30570-201ENSMUST00000213553 ClspnQ80YR7 1315 aa9.59□□□□□ -0.87
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa9.55□□□□□ -0.88
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Bcl11aQ9QYE3 773 aa9.53□□□□□ -0.88
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa9.53□□□□□ -0.88
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Fam71e1A1L3C1 212 aa9.52□□□□□ -0.89
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa9.51□□□□□ -0.89
Gm30570-201ENSMUST00000213553 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Phf23Q8BSN5 401 aa9.5□□□□□ -0.89
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa9.46□□□□□ -0.9
Gm30570-201ENSMUST00000213553 TonslQ6NZL6 1363 aa9.45□□□□□ -0.9
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Kcna4Q61423 654 aa9.42□□□□□ -0.9
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa9.41□□□□□ -0.9
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Fmn1Q05860 1466 aa9.41□□□□□ -0.9
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa9.38□□□□□ -0.91
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa9.38□□□□□ -0.91
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Myt1lP97500 1187 aa9.37□□□□□ -0.91
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Cep162Q6ZQ06 1403 aa9.36□□□□□ -0.91
Gm30570-201ENSMUST00000213553 PrkcshO08795 521 aa9.35□□□□□ -0.91
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Tnnt3Q9QZ47 272 aa9.31□□□□□ -0.92
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
Gm30570-201ENSMUST00000213553 TnnQ80Z71 1560 aa9.3□□□□□ -0.92
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa9.29□□□□□ -0.92
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Eid3Q3V124 375 aa9.28□□□□□ -0.92
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Ube2uB1AUC4 352 aa9.27□□□□□ -0.93
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Anp32aO35381 247 aa9.24□□□□□ -0.93
Gm30570-201ENSMUST00000213553 PtprkP35822 1457 aa9.24□□□□□ -0.93
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Frmpd1A2AKB4 1549 aa9.23□□□□□ -0.93
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Arhgap35Q91YM2 1499 aa9.21□□□□□ -0.93
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Wdr62Q3U3T8 1523 aa9.2□□□□□ -0.94
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa9.19□□□□□ -0.94
Gm30570-201ENSMUST00000213553 NrkQ9R0G8 1455 aa9.18□□□□□ -0.94
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Npm2Q80W85 207 aa9.18□□□□□ -0.94
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Clip1Q922J3 1391 aa9.18□□□□□ -0.94
Gm30570-201ENSMUST00000213553 Lamc3Q9R0B6 1581 aa9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 7.7 ms