RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000209280.1

Stambp-ps1-201, mousemouse

BASIC

Gene Stambp-ps1, Length 1,208 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa29.49■■■□□ 2.31
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 NischQ80TM9 1593 aa28.96■■■□□ 2.23
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Abcc9P70170 1546 aa28.07■■■□□ 2.08
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Abcc8B2RUS7 1588 aa28.04■■■□□ 2.08
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 ScribQ80U72 1612 aa27.18■■□□□ 1.94
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 NacadQ5SWP3 1504 aa26.21■■□□□ 1.79
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Kdm5dQ62240 1548 aa26.21■■□□□ 1.79
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Dcaf1Q80TR8 1506 aa25.79■■□□□ 1.72
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Sycp2Q9CUU3 1500 aa25.73■■□□□ 1.71
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 BicraF8VPZ9 1578 aa25.43■■□□□ 1.66
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa25.27■■□□□ 1.64
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Chic1Q8CBW7 227 aa25.24■■□□□ 1.63
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Ccdc180J3QNE4 1664 aa24.91■■□□□ 1.58
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Baz1aO88379 1555 aa24.88■■□□□ 1.57
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa24.78■■□□□ 1.56
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Crybg2B7ZCC2 1516 aa24.76■■□□□ 1.55
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Rhox8Q6VSS7 320 aa24.75■■□□□ 1.55
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa24.64■■□□□ 1.54
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Smarca2Q6DIC0 1577 aa24.16■■□□□ 1.46
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Ercc6F8VPZ5 1481 aa24.16■■□□□ 1.46
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa24.16■■□□□ 1.46
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa24.11■■□□□ 1.45
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa24.08■■□□□ 1.45
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Fam135aQ6NS59 1506 aa24■■□□□ 1.43
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Wdr62Q3U3T8 1523 aa23.93■■□□□ 1.42
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Frmpd1A2AKB4 1549 aa23.86■■□□□ 1.41
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Rtl1Q7M732 1744 aa23.73■■□□□ 1.39
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Baz1bQ9Z277 1479 aa23.68■■□□□ 1.38
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Unc13aQ4KUS2 1712 aa23.64■■□□□ 1.37
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa23.55■■□□□ 1.36
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 CftrP26361 1476 aa23.52■■□□□ 1.36
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Synj1Q8CHC4 1574 aa23.49■■□□□ 1.35
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Ubl4bQ9CQ84 188 aa23.41■■□□□ 1.34
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Mrc2Q64449 1479 aa23.4■■□□□ 1.34
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa23.19■■□□□ 1.3
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa22.95■■□□□ 1.26
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Cux2P70298 1426 aa22.94■■□□□ 1.26
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Kif15Q6P9L6 1387 aa22.92■■□□□ 1.26
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Kif21aQ9QXL2 1672 aa22.9■■□□□ 1.26
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Lamc3Q9R0B6 1581 aa22.89■■□□□ 1.25
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Trim41Q5NCC3 630 aa22.81■■□□□ 1.24
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Phf23Q8BSN5 401 aa22.71■■□□□ 1.23
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 TnnQ80Z71 1560 aa22.63■■□□□ 1.21
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Top2bQ64511 1612 aa22.62■■□□□ 1.21
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Cep164Q5DU05 1446 aa22.59■■□□□ 1.21
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Golga3P55937 1487 aa22.54■■□□□ 1.2
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Dnajc5P60904 198 aa22.51■■□□□ 1.19
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Ccdc18Q640L5 1455 aa22.5■■□□□ 1.19
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Camsap1A2AHC3 1581 aa22.47■■□□□ 1.19
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Crocc2F6XLV1 1638 aa22.41■■□□□ 1.18
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Plb1Q3TTY0 1478 aa22.41■■□□□ 1.18
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Cngb1E1AZ71 1325 aa22.36■■□□□ 1.17
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Shroom2A2ALU4 1481 aa22.36■■□□□ 1.17
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Il27Q8K3I6 234 aa22.36■■□□□ 1.17
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Fmn1Q05860 1466 aa22.33■■□□□ 1.16
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Rusc2Q80U22 1514 aa22.22■■□□□ 1.15
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Ift140E9PY46 1464 aa22.22■■□□□ 1.15
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Duox2A2AQ99 1517 aa22.16■■□□□ 1.14
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Grin2bQ01097 1482 aa22.13■■□□□ 1.13
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Samd9lQ69Z37 1561 aa22.06■■□□□ 1.12
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Col17a1Q07563 1470 aa22.04■■□□□ 1.12
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Disp1Q3TDN0 1521 aa22.04■■□□□ 1.12
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Setd1bQ8CFT2 1985 aa22.03■■□□□ 1.12
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Efcab5A0JP43 1406 aa21.93■■□□□ 1.1
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa21.91■■□□□ 1.1
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Plppr3Q7TPB0 716 aa21.9■■□□□ 1.1
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa21.89■■□□□ 1.1
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Rad54l2Q99NG0 1466 aa21.84■■□□□ 1.09
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 NrkQ9R0G8 1455 aa21.83■■□□□ 1.09
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Grin2aP35436 1464 aa21.83■■□□□ 1.08
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Magi3Q9EQJ9 1476 aa21.83■■□□□ 1.08
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Gpatch8A2A6A1 1505 aa21.77■■□□□ 1.08
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Gab3Q8BSM5 595 aa21.75■■□□□ 1.07
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Shroom4Q1W617 1475 aa21.74■■□□□ 1.07
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 PtprkP35822 1457 aa21.71■■□□□ 1.07
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Pla2r1Q62028 1487 aa21.69■■□□□ 1.06
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 SynmQ70IV5 1561 aa21.69■■□□□ 1.06
Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 Fgd6Q69ZL1 1399 aa21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 60.6 ms