RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000178545.1

Tmem200c-201, Transcript of Transmembrane protein 200C, mousemouse

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene Tmem200c, Length 3,213 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 NischQ80TM9 1593 aa29.02■■■□□ 2.24
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Rhox8Q6VSS7 320 aa28.12■■■□□ 2.09
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Abcc9P70170 1546 aa27.94■■■□□ 2.06
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa27.74■■■□□ 2.03
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Abcc8B2RUS7 1588 aa27.39■■□□□ 1.98
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa26.16■■□□□ 1.78
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Rtl1Q7M732 1744 aa26.11■■□□□ 1.77
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Ccdc180J3QNE4 1664 aa26.01■■□□□ 1.75
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 ScribQ80U72 1612 aa25.55■■□□□ 1.68
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa25.46■■□□□ 1.67
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Trim41Q5NCC3 630 aa25.24■■□□□ 1.63
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Kdm5dQ62240 1548 aa25.17■■□□□ 1.62
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Dcaf1Q80TR8 1506 aa25.17■■□□□ 1.62
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 HrcG5E8J6 738 aa25.07■■□□□ 1.6
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Baz1aO88379 1555 aa24.98■■□□□ 1.59
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa24.94■■□□□ 1.58
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Gab3Q8BSM5 595 aa24.91■■□□□ 1.58
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Cngb1E1AZ71 1325 aa24.9■■□□□ 1.58
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 NacadQ5SWP3 1504 aa24.76■■□□□ 1.55
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Chic1Q8CBW7 227 aa24.65■■□□□ 1.54
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Smarca2Q6DIC0 1577 aa24.39■■□□□ 1.5
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Pcgf6Q99NA9 353 aa24.37■■□□□ 1.49
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa24.31■■□□□ 1.48
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Cep164Q5DU05 1446 aa24.31■■□□□ 1.48
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Sycp2Q9CUU3 1500 aa24.25■■□□□ 1.47
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa24.17■■□□□ 1.46
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Zeb1Q64318 1117 aa24.17■■□□□ 1.46
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Crybg2B7ZCC2 1516 aa24.04■■□□□ 1.44
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Synj1Q8CHC4 1574 aa23.93■■□□□ 1.42
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Myt1lP97500 1187 aa23.92■■□□□ 1.42
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Mier1Q5UAK0 511 aa23.92■■□□□ 1.42
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Golga3P55937 1487 aa23.87■■□□□ 1.41
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 UbtfP25976 765 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 BicraF8VPZ9 1578 aa23.82■■□□□ 1.4
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa23.72■■□□□ 1.39
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 CftrP26361 1476 aa23.69■■□□□ 1.38
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Npm2Q80W85 207 aa23.59■■□□□ 1.37
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Sall2Q9QX96 1004 aa23.5■■□□□ 1.35
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Il27Q8K3I6 234 aa23.47■■□□□ 1.35
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa23.46■■□□□ 1.35
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Neurod1Q60867 357 aa23.45■■□□□ 1.34
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Wdr66E9Q743 1299 aa23.45■■□□□ 1.34
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa23.44■■□□□ 1.34
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 NefmP08553 848 aa23.41■■□□□ 1.34
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa23.37■■□□□ 1.33
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Top2bQ64511 1612 aa23.29■■□□□ 1.32
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa23.29■■□□□ 1.32
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa23.23■■□□□ 1.31
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Cep162Q6ZQ06 1403 aa23.14■■□□□ 1.29
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Fmn1Q05860 1466 aa23.08■■□□□ 1.28
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Clip1Q922J3 1391 aa23.07■■□□□ 1.28
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Eid3Q3V124 375 aa23.05■■□□□ 1.28
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa23.02■■□□□ 1.28
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 TonslQ6NZL6 1363 aa22.86■■□□□ 1.25
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 PtprkP35822 1457 aa22.85■■□□□ 1.25
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa22.85■■□□□ 1.25
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Lmod2Q3UHZ5 550 aa22.82■■□□□ 1.24
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Kif15Q6P9L6 1387 aa22.8■■□□□ 1.24
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Csrnp3P59055 597 aa22.78■■□□□ 1.24
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Gm38655A0A286YDK6 273 aa22.74■■□□□ 1.23
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 ClspnQ80YR7 1315 aa22.69■■□□□ 1.22
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Setd5Q5XJV7 1441 aa22.66■■□□□ 1.22
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Arhgap35Q91YM2 1499 aa22.65■■□□□ 1.22
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Frmpd1A2AKB4 1549 aa22.65■■□□□ 1.22
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Arap1Q4LDD4 1452 aa22.58■■□□□ 1.21
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Eea1Q8BL66 1411 aa22.54■■□□□ 1.2
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 BlmO88700 1416 aa22.51■■□□□ 1.19
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Anks4bQ8K3X6 423 aa22.51■■□□□ 1.19
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa22.5■■□□□ 1.19
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa22.48■■□□□ 1.19
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Ubl4bQ9CQ84 188 aa22.48■■□□□ 1.19
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Wdr62Q3U3T8 1523 aa22.43■■□□□ 1.18
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Ube2uB1AUC4 352 aa22.42■■□□□ 1.18
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Baz1bQ9Z277 1479 aa22.39■■□□□ 1.17
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 TnnQ80Z71 1560 aa22.39■■□□□ 1.17
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Ercc6F8VPZ5 1481 aa22.38■■□□□ 1.17
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Shroom4Q1W617 1475 aa22.34■■□□□ 1.17
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 NrkQ9R0G8 1455 aa22.33■■□□□ 1.17
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 NclP09405 707 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Camsap1A2AHC3 1581 aa22.3■■□□□ 1.16
Tmem200c-201ENSMUST00000178545 Cux2P70298 1426 aa22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 275.5 ms