RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000170667.7

Shq1-204, Transcript of Protein SHQ1 homolog, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Shq1, Length 1,990 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1-204ENSMUST00000170667 NischQ80TM9 1593 aa36.44■■■■□ 3.42
Shq1-204ENSMUST00000170667 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa36.28■■■■□ 3.4
Shq1-204ENSMUST00000170667 Abcc9P70170 1546 aa35.4■■■■□ 3.26
Shq1-204ENSMUST00000170667 Abcc8B2RUS7 1588 aa34.85■■■■□ 3.17
Shq1-204ENSMUST00000170667 ScribQ80U72 1612 aa32.85■■■□□ 2.85
Shq1-204ENSMUST00000170667 Rhox8Q6VSS7 320 aa32.84■■■□□ 2.85
Shq1-204ENSMUST00000170667 Dcaf1Q80TR8 1506 aa32.4■■■□□ 2.78
Shq1-204ENSMUST00000170667 Kdm5dQ62240 1548 aa32.07■■■□□ 2.72
Shq1-204ENSMUST00000170667 NacadQ5SWP3 1504 aa31.91■■■□□ 2.7
Shq1-204ENSMUST00000170667 Rtl1Q7M732 1744 aa31.87■■■□□ 2.69
Shq1-204ENSMUST00000170667 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa31.87■■■□□ 2.69
Shq1-204ENSMUST00000170667 Ccdc180J3QNE4 1664 aa31.56■■■□□ 2.64
Shq1-204ENSMUST00000170667 Baz1aO88379 1555 aa31.5■■■□□ 2.63
Shq1-204ENSMUST00000170667 Sycp2Q9CUU3 1500 aa31.25■■■□□ 2.59
Shq1-204ENSMUST00000170667 Crybg2B7ZCC2 1516 aa31.1■■■□□ 2.57
Shq1-204ENSMUST00000170667 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
Shq1-204ENSMUST00000170667 Smarca2Q6DIC0 1577 aa30.73■■■□□ 2.51
Shq1-204ENSMUST00000170667 BicraF8VPZ9 1578 aa30.65■■■□□ 2.5
Shq1-204ENSMUST00000170667 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa30.55■■■□□ 2.48
Shq1-204ENSMUST00000170667 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa30.16■■■□□ 2.42
Shq1-204ENSMUST00000170667 Trim41Q5NCC3 630 aa30.03■■■□□ 2.4
Shq1-204ENSMUST00000170667 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
Shq1-204ENSMUST00000170667 Synj1Q8CHC4 1574 aa29.77■■■□□ 2.36
Shq1-204ENSMUST00000170667 HrcG5E8J6 738 aa29.74■■■□□ 2.35
Shq1-204ENSMUST00000170667 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
Shq1-204ENSMUST00000170667 CftrP26361 1476 aa29.66■■■□□ 2.34
Shq1-204ENSMUST00000170667 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa29.55■■■□□ 2.32
Shq1-204ENSMUST00000170667 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
Shq1-204ENSMUST00000170667 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
Shq1-204ENSMUST00000170667 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa29.4■■■□□ 2.3
Shq1-204ENSMUST00000170667 Golga3P55937 1487 aa29.38■■■□□ 2.29
Shq1-204ENSMUST00000170667 Cngb1E1AZ71 1325 aa29.29■■■□□ 2.28
Shq1-204ENSMUST00000170667 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
Shq1-204ENSMUST00000170667 Top2bQ64511 1612 aa29.18■■■□□ 2.26
Shq1-204ENSMUST00000170667 Cep164Q5DU05 1446 aa29.15■■■□□ 2.26
Shq1-204ENSMUST00000170667 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
Shq1-204ENSMUST00000170667 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa29.02■■■□□ 2.24
Shq1-204ENSMUST00000170667 Chic1Q8CBW7 227 aa29.01■■■□□ 2.23
Shq1-204ENSMUST00000170667 Wdr62Q3U3T8 1523 aa28.94■■■□□ 2.22
Shq1-204ENSMUST00000170667 Frmpd1A2AKB4 1549 aa28.92■■■□□ 2.22
Shq1-204ENSMUST00000170667 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa28.88■■■□□ 2.21
Shq1-204ENSMUST00000170667 Ercc6F8VPZ5 1481 aa28.84■■■□□ 2.21
Shq1-204ENSMUST00000170667 Fmn1Q05860 1466 aa28.74■■■□□ 2.19
Shq1-204ENSMUST00000170667 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
Shq1-204ENSMUST00000170667 Unc13aQ4KUS2 1712 aa28.61■■■□□ 2.17
Shq1-204ENSMUST00000170667 TnnQ80Z71 1560 aa28.55■■■□□ 2.16
Shq1-204ENSMUST00000170667 Gab3Q8BSM5 595 aa28.53■■■□□ 2.16
Shq1-204ENSMUST00000170667 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
Shq1-204ENSMUST00000170667 Lamc3Q9R0B6 1581 aa28.46■■■□□ 2.15
Shq1-204ENSMUST00000170667 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
Shq1-204ENSMUST00000170667 Kif15Q6P9L6 1387 aa28.33■■■□□ 2.13
Shq1-204ENSMUST00000170667 Fam135aQ6NS59 1506 aa28.31■■■□□ 2.12
Shq1-204ENSMUST00000170667 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa28.23■■■□□ 2.11
Shq1-204ENSMUST00000170667 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
Shq1-204ENSMUST00000170667 Camsap1A2AHC3 1581 aa28.13■■■□□ 2.09
Shq1-204ENSMUST00000170667 Ubl4bQ9CQ84 188 aa28.11■■■□□ 2.09
Shq1-204ENSMUST00000170667 Cux2P70298 1426 aa28■■■□□ 2.07
Shq1-204ENSMUST00000170667 Ccdc18Q640L5 1455 aa27.99■■■□□ 2.07
Shq1-204ENSMUST00000170667 Cep162Q6ZQ06 1403 aa27.99■■■□□ 2.07
Shq1-204ENSMUST00000170667 Il27Q8K3I6 234 aa27.99■■■□□ 2.07
Shq1-204ENSMUST00000170667 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa27.94■■■□□ 2.06
Shq1-204ENSMUST00000170667 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
Shq1-204ENSMUST00000170667 PtprkP35822 1457 aa27.91■■■□□ 2.06
Shq1-204ENSMUST00000170667 NrkQ9R0G8 1455 aa27.87■■■□□ 2.05
Shq1-204ENSMUST00000170667 Grin2bQ01097 1482 aa27.87■■■□□ 2.05
Shq1-204ENSMUST00000170667 Npm2Q80W85 207 aa27.86■■■□□ 2.05
Shq1-204ENSMUST00000170667 Shroom4Q1W617 1475 aa27.83■■■□□ 2.05
Shq1-204ENSMUST00000170667 Baz1bQ9Z277 1479 aa27.83■■■□□ 2.05
Shq1-204ENSMUST00000170667 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
Shq1-204ENSMUST00000170667 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
Shq1-204ENSMUST00000170667 Arhgap35Q91YM2 1499 aa27.73■■■□□ 2.03
Shq1-204ENSMUST00000170667 Myt1lP97500 1187 aa27.69■■■□□ 2.02
Shq1-204ENSMUST00000170667 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
Shq1-204ENSMUST00000170667 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa27.67■■■□□ 2.02
Shq1-204ENSMUST00000170667 Mrc2Q64449 1479 aa27.66■■■□□ 2.02
Shq1-204ENSMUST00000170667 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
Shq1-204ENSMUST00000170667 Map3k1P53349 1493 aa27.58■■■□□ 2.01
Shq1-204ENSMUST00000170667 Efcab5A0JP43 1406 aa27.57■■■□□ 2
Shq1-204ENSMUST00000170667 Duox2A2AQ99 1517 aa27.55■■■□□ 2
Shq1-204ENSMUST00000170667 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa27.53■■■□□ 2
Shq1-204ENSMUST00000170667 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
Shq1-204ENSMUST00000170667 Kif21aQ9QXL2 1672 aa27.5■■□□□ 1.99
Shq1-204ENSMUST00000170667 Clip1Q922J3 1391 aa27.39■■□□□ 1.98
Shq1-204ENSMUST00000170667 Zeb1Q64318 1117 aa27.39■■□□□ 1.98
Shq1-204ENSMUST00000170667 Samd9lQ69Z37 1561 aa27.39■■□□□ 1.98
Shq1-204ENSMUST00000170667 Crocc2F6XLV1 1638 aa27.38■■□□□ 1.97
Shq1-204ENSMUST00000170667 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
Shq1-204ENSMUST00000170667 Eea1Q8BL66 1411 aa27.28■■□□□ 1.96
Shq1-204ENSMUST00000170667 SynmQ70IV5 1561 aa27.27■■□□□ 1.96
Shq1-204ENSMUST00000170667 Arap1Q4LDD4 1452 aa27.24■■□□□ 1.95
Shq1-204ENSMUST00000170667 Carmil1Q6EDY6 1374 aa27.24■■□□□ 1.95
Shq1-204ENSMUST00000170667 Rad54l2Q99NG0 1466 aa27.2■■□□□ 1.95
Shq1-204ENSMUST00000170667 Ankrd26Q811D2 1581 aa27.2■■□□□ 1.95
Shq1-204ENSMUST00000170667 Setd5Q5XJV7 1441 aa27.2■■□□□ 1.94
Shq1-204ENSMUST00000170667 Plb1Q3TTY0 1478 aa27.18■■□□□ 1.94
Shq1-204ENSMUST00000170667 Erich3F6QRE9 1637 aa27.16■■□□□ 1.94
Shq1-204ENSMUST00000170667 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.93
Shq1-204ENSMUST00000170667 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa27.13■■□□□ 1.93
Shq1-204ENSMUST00000170667 Cux1P53564 1515 aa27.12■■□□□ 1.93
Shq1-204ENSMUST00000170667 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 126.4 ms