RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000139005.1

Hoxd3os1-202, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd3os1, Length 1,701 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa27.49■■□□□ 1.99
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 NischQ80TM9 1593 aa27.02■■□□□ 1.92
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Abcc8B2RUS7 1588 aa26.17■■□□□ 1.78
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Abcc9P70170 1546 aa26.16■■□□□ 1.78
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 ScribQ80U72 1612 aa25.42■■□□□ 1.66
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Kdm5dQ62240 1548 aa24.49■■□□□ 1.51
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 NacadQ5SWP3 1504 aa24.43■■□□□ 1.5
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Dcaf1Q80TR8 1506 aa24.01■■□□□ 1.43
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Sycp2Q9CUU3 1500 aa24.01■■□□□ 1.43
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 BicraF8VPZ9 1578 aa23.78■■□□□ 1.4
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa23.59■■□□□ 1.37
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa23.3■■□□□ 1.32
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Baz1aO88379 1555 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Rhox8Q6VSS7 320 aa23.16■■□□□ 1.3
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ccdc180J3QNE4 1664 aa23.15■■□□□ 1.3
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Crybg2B7ZCC2 1516 aa22.99■■□□□ 1.27
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa22.94■■□□□ 1.26
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa22.6■■□□□ 1.21
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Smarca2Q6DIC0 1577 aa22.56■■□□□ 1.2
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa22.54■■□□□ 1.2
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ercc6F8VPZ5 1481 aa22.53■■□□□ 1.2
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa22.52■■□□□ 1.19
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Fam135aQ6NS59 1506 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Wdr62Q3U3T8 1523 aa22.33■■□□□ 1.16
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Frmpd1A2AKB4 1549 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Chic1Q8CBW7 227 aa22.21■■□□□ 1.15
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Unc13aQ4KUS2 1712 aa22.15■■□□□ 1.14
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Rtl1Q7M732 1744 aa22.14■■□□□ 1.13
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa22.08■■□□□ 1.12
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Synj1Q8CHC4 1574 aa21.97■■□□□ 1.11
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa21.96■■□□□ 1.11
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 CftrP26361 1476 aa21.93■■□□□ 1.1
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Baz1bQ9Z277 1479 aa21.92■■□□□ 1.1
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ubl4bQ9CQ84 188 aa21.89■■□□□ 1.09
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Mrc2Q64449 1479 aa21.83■■□□□ 1.08
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa21.72■■□□□ 1.07
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Cux2P70298 1426 aa21.43■■□□□ 1.02
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Kif21aQ9QXL2 1672 aa21.42■■□□□ 1.02
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Kif15Q6P9L6 1387 aa21.4■■□□□ 1.02
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Lamc3Q9R0B6 1581 aa21.34■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Trim41Q5NCC3 630 aa21.27■■□□□ 1
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 TnnQ80Z71 1560 aa21.11■□□□□ 0.97
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Top2bQ64511 1612 aa21.1■□□□□ 0.97
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Dnajc5P60904 198 aa21.07■□□□□ 0.96
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Cep164Q5DU05 1446 aa21.06■□□□□ 0.96
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Golga3P55937 1487 aa21.01■□□□□ 0.95
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Camsap1A2AHC3 1581 aa20.98■□□□□ 0.95
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Il27Q8K3I6 234 aa20.96■□□□□ 0.95
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Plb1Q3TTY0 1478 aa20.95■□□□□ 0.94
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ccdc18Q640L5 1455 aa20.94■□□□□ 0.94
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Cngb1E1AZ71 1325 aa20.93■□□□□ 0.94
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Crocc2F6XLV1 1638 aa20.92■□□□□ 0.94
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Shroom2A2ALU4 1481 aa20.83■□□□□ 0.93
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Fmn1Q05860 1466 aa20.79■□□□□ 0.92
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Rusc2Q80U22 1514 aa20.73■□□□□ 0.91
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ift140E9PY46 1464 aa20.69■□□□□ 0.9
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Duox2A2AQ99 1517 aa20.68■□□□□ 0.9
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Setd1bQ8CFT2 1985 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Grin2bQ01097 1482 aa20.63■□□□□ 0.89
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Samd9lQ69Z37 1561 aa20.62■□□□□ 0.89
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Col17a1Q07563 1470 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Disp1Q3TDN0 1521 aa20.58■□□□□ 0.89
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Pcgf6Q99NA9 353 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Rad54l2Q99NG0 1466 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Efcab5A0JP43 1406 aa20.41■□□□□ 0.86
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa20.39■□□□□ 0.85
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Magi3Q9EQJ9 1476 aa20.39■□□□□ 0.85
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Grin2aP35436 1464 aa20.36■□□□□ 0.85
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 NrkQ9R0G8 1455 aa20.32■□□□□ 0.84
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 PtprkP35822 1457 aa20.32■□□□□ 0.84
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Shroom4Q1W617 1475 aa20.28■□□□□ 0.84
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Pla2r1Q62028 1487 aa20.25■□□□□ 0.83
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Gpatch8A2A6A1 1505 aa20.23■□□□□ 0.83
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 SynmQ70IV5 1561 aa20.23■□□□□ 0.83
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Fgd6Q69ZL1 1399 aa20.2■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.6 ms