RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109408.9

Ttpal-202, Transcript of Alpha-tocopherol transfer protein-like, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttpal, Length 1,999 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa38.54■■■■□ 3.76
Ttpal-202ENSMUST00000109408 NischQ80TM9 1593 aa38.38■■■■□ 3.73
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Abcc9P70170 1546 aa37.17■■■■□ 3.54
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Abcc8B2RUS7 1588 aa36.93■■■■□ 3.5
Ttpal-202ENSMUST00000109408 ScribQ80U72 1612 aa35.34■■■■□ 3.25
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Kdm5dQ62240 1548 aa34.27■■■■□ 3.08
Ttpal-202ENSMUST00000109408 NacadQ5SWP3 1504 aa34.18■■■■□ 3.06
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Dcaf1Q80TR8 1506 aa34.02■■■■□ 3.04
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Rhox8Q6VSS7 320 aa33.85■■■■□ 3.01
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Sycp2Q9CUU3 1500 aa33.52■■■□□ 2.96
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa33.5■■■□□ 2.95
Ttpal-202ENSMUST00000109408 BicraF8VPZ9 1578 aa33.04■■■□□ 2.88
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Baz1aO88379 1555 aa33.03■■■□□ 2.88
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Ccdc180J3QNE4 1664 aa32.94■■■□□ 2.86
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Crybg2B7ZCC2 1516 aa32.7■■■□□ 2.83
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Smarca2Q6DIC0 1577 aa32.15■■■□□ 2.74
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Rtl1Q7M732 1744 aa32.08■■■□□ 2.73
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa31.93■■■□□ 2.7
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.67
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.66
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa31.65■■■□□ 2.66
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa31.47■■■□□ 2.63
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa31.45■■■□□ 2.62
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP31.42■■■□□ 2.62
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Synj1Q8CHC4 1574 aa31.26■■■□□ 2.59
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Ercc6F8VPZ5 1481 aa31.22■■■□□ 2.59
Ttpal-202ENSMUST00000109408 CftrP26361 1476 aa31.22■■■□□ 2.59
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa31.11■■■□□ 2.57
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Frmpd1A2AKB4 1549 aa31.09■■■□□ 2.57
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Wdr62Q3U3T8 1523 aa31.09■■■□□ 2.57
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa31.01■■■□□ 2.55
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Trim41Q5NCC3 630 aa30.98■■■□□ 2.55
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Fam135aQ6NS59 1506 aa30.8■■■□□ 2.52
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Unc13aQ4KUS2 1712 aa30.73■■■□□ 2.51
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Ubl4bQ9CQ84 188 aa30.5■■■□□ 2.47
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Golga3P55937 1487 aa30.39■■■□□ 2.46
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Cngb1E1AZ71 1325 aa30.38■■■□□ 2.45
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Top2bQ64511 1612 aa30.29■■■□□ 2.44
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Baz1bQ9Z277 1479 aa30.21■■■□□ 2.43
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Kif15Q6P9L6 1387 aa30.18■■■□□ 2.42
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Lamc3Q9R0B6 1581 aa30.13■■■□□ 2.41
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Mrc2Q64449 1479 aa30.11■■■□□ 2.41
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Cux2P70298 1426 aa30.04■■■□□ 2.4
Ttpal-202ENSMUST00000109408 TnnQ80Z71 1560 aa29.97■■■□□ 2.39
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Fmn1Q05860 1466 aa29.89■■■□□ 2.38
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa29.86■■■□□ 2.37
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Chic1Q8CBW7 227 aa29.77■■■□□ 2.36
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Il27Q8K3I6 234 aa29.76■■■□□ 2.35
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Kif21aQ9QXL2 1672 aa29.69■■■□□ 2.34
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Camsap1A2AHC3 1581 aa29.69■■■□□ 2.34
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Ccdc18Q640L5 1455 aa29.64■■■□□ 2.34
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Cep164Q5DU05 1446 aa29.62■■■□□ 2.33
Ttpal-202ENSMUST00000109408 HrcG5E8J6 738 aa29.55■■■□□ 2.32
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa29.47■■■□□ 2.31
Ttpal-202ENSMUST00000109408 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Grin2bQ01097 1482 aa29.34■■■□□ 2.29
Ttpal-202ENSMUST00000109408 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Crocc2F6XLV1 1638 aa29.27■■■□□ 2.28
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Plb1Q3TTY0 1478 aa29.25■■■□□ 2.27
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Duox2A2AQ99 1517 aa29.24■■■□□ 2.27
Ttpal-202ENSMUST00000109408 PtprkP35822 1457 aa29.16■■■□□ 2.26
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Gab3Q8BSM5 595 aa29.15■■■□□ 2.26
Ttpal-202ENSMUST00000109408 NrkQ9R0G8 1455 aa29.11■■■□□ 2.25
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Efcab5A0JP43 1406 aa29.06■■■□□ 2.24
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Samd9lQ69Z37 1561 aa29.05■■■□□ 2.24
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Shroom4Q1W617 1475 aa29.05■■■□□ 2.24
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Ift140E9PY46 1464 aa28.91■■■□□ 2.22
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Rad54l2Q99NG0 1466 aa28.9■■■□□ 2.22
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Disp1Q3TDN0 1521 aa28.9■■■□□ 2.22
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Npm2Q80W85 207 aa28.9■■■□□ 2.22
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa28.87■■■□□ 2.21
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Setd1bQ8CFT2 1985 aa28.81■■■□□ 2.2
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Zeb1Q64318 1117 aa28.77■■■□□ 2.2
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Magi3Q9EQJ9 1476 aa28.74■■■□□ 2.19
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Rusc2Q80U22 1514 aa28.72■■■□□ 2.19
Ttpal-202ENSMUST00000109408 SynmQ70IV5 1561 aa28.72■■■□□ 2.19
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa28.7■■■□□ 2.18
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Grin2aP35436 1464 aa28.69■■■□□ 2.18
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Arhgap35Q91YM2 1499 aa28.68■■■□□ 2.18
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Cep162Q6ZQ06 1403 aa28.67■■■□□ 2.18
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Pla2r1Q62028 1487 aa28.64■■■□□ 2.18
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa28.57■■■□□ 2.16
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Myt1lP97500 1187 aa28.53■■■□□ 2.16
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Map3k1P53349 1493 aa28.5■■■□□ 2.15
Ttpal-202ENSMUST00000109408 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
Ttpal-202ENSMUST00000109408 Carmil1Q6EDY6 1374 aa28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 87.3 ms