RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107773.2

Tmod1-201, Transcript of Tropomodulin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Tmod1, Length 3,158 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1-201ENSMUST00000107773 NischQ80TM9 1593 aa32.62■■■□□ 2.81
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Rhox8Q6VSS7 320 aa31.66■■■□□ 2.66
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Abcc9P70170 1546 aa31.6■■■□□ 2.65
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa31.29■■■□□ 2.6
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Rtl1Q7M732 1744 aa31.17■■■□□ 2.58
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa30.98■■■□□ 2.55
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Ccdc180J3QNE4 1664 aa30.93■■■□□ 2.54
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Abcc8B2RUS7 1588 aa30.66■■■□□ 2.5
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Pcgf6Q99NA9 353 aa29.7■■■□□ 2.34
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Dcaf1Q80TR8 1506 aa29.44■■■□□ 2.3
Tmod1-201ENSMUST00000107773 HrcG5E8J6 738 aa29.44■■■□□ 2.3
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa29.27■■■□□ 2.28
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Trim41Q5NCC3 630 aa28.91■■■□□ 2.22
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa28.68■■■□□ 2.18
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Neurod1Q60867 357 aa28.63■■■□□ 2.17
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Zeb1Q64318 1117 aa28.46■■■□□ 2.15
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Cep164Q5DU05 1446 aa28.32■■■□□ 2.12
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Baz1aO88379 1555 aa28.27■■■□□ 2.12
Tmod1-201ENSMUST00000107773 ScribQ80U72 1612 aa28.2■■■□□ 2.11
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Cngb1E1AZ71 1325 aa28.17■■■□□ 2.1
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Gab3Q8BSM5 595 aa28.12■■■□□ 2.09
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Sall2Q9QX96 1004 aa28.03■■■□□ 2.08
Tmod1-201ENSMUST00000107773 NefmP08553 848 aa28.01■■■□□ 2.07
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Mier1Q5UAK0 511 aa27.99■■■□□ 2.07
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Kdm5dQ62240 1548 aa27.92■■■□□ 2.06
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Chic1Q8CBW7 227 aa27.91■■■□□ 2.06
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
Tmod1-201ENSMUST00000107773 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa27.78■■■□□ 2.04
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Csrnp3P59055 597 aa27.74■■■□□ 2.03
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Anks4bQ8K3X6 423 aa27.7■■■□□ 2.02
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Smarca2Q6DIC0 1577 aa27.68■■■□□ 2.02
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Wdr66E9Q743 1299 aa27.62■■■□□ 2.01
Tmod1-201ENSMUST00000107773 NacadQ5SWP3 1504 aa27.48■■□□□ 1.99
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa27.48■■□□□ 1.99
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa27.4■■□□□ 1.98
Tmod1-201ENSMUST00000107773 UbtfP25976 765 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Crybg2B7ZCC2 1516 aa27.31■■□□□ 1.96
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Golga3P55937 1487 aa27.2■■□□□ 1.94
Tmod1-201ENSMUST00000107773 ClspnQ80YR7 1315 aa27.18■■□□□ 1.94
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Gm38655A0A286YDK6 273 aa27.18■■□□□ 1.94
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
Tmod1-201ENSMUST00000107773 CenpbP27790 599 aa27.17■■□□□ 1.94
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Aplp2Q06335 707 aa27.17■■□□□ 1.94
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa27.02■■□□□ 1.92
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Myt1Q8CFC2 1127 aa26.94■■□□□ 1.9
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Synj1Q8CHC4 1574 aa26.92■■□□□ 1.9
Tmod1-201ENSMUST00000107773 TonslQ6NZL6 1363 aa26.9■■□□□ 1.9
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Myt1lP97500 1187 aa26.87■■□□□ 1.89
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Sycp2Q9CUU3 1500 aa26.86■■□□□ 1.89
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa26.63■■□□□ 1.85
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Top2bQ64511 1612 aa26.63■■□□□ 1.85
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa26.6■■□□□ 1.85
Tmod1-201ENSMUST00000107773 CftrP26361 1476 aa26.6■■□□□ 1.85
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa26.57■■□□□ 1.84
Tmod1-201ENSMUST00000107773 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa26.5■■□□□ 1.83
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Cep162Q6ZQ06 1403 aa26.5■■□□□ 1.83
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Npm2Q80W85 207 aa26.49■■□□□ 1.83
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Fam71e1A1L3C1 212 aa26.46■■□□□ 1.83
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa26.41■■□□□ 1.82
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Clip1Q922J3 1391 aa26.4■■□□□ 1.82
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Eid3Q3V124 375 aa26.39■■□□□ 1.81
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa26.32■■□□□ 1.8
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa26.31■■□□□ 1.8
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Tnnt3Q9QZ47 272 aa26.3■■□□□ 1.8
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
Tmod1-201ENSMUST00000107773 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Fmn1Q05860 1466 aa26.26■■□□□ 1.79
Tmod1-201ENSMUST00000107773 BicraF8VPZ9 1578 aa26.21■■□□□ 1.79
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Bcl11aQ9QYE3 773 aa26.13■■□□□ 1.77
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Anp32aO35381 247 aa25.95■■□□□ 1.74
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Znf710Q3U288 666 aa25.91■■□□□ 1.74
Tmod1-201ENSMUST00000107773 NclP09405 707 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Rpap1Q80TE0 1409 aa25.88■■□□□ 1.73
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Kdm5bQ80Y84 1544 aa25.87■■□□□ 1.73
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Arap1Q4LDD4 1452 aa25.86■■□□□ 1.73
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Stra8P70278 393 aa25.84■■□□□ 1.73
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Eea1Q8BL66 1411 aa25.82■■□□□ 1.72
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Arhgap35Q91YM2 1499 aa25.78■■□□□ 1.72
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Setd5Q5XJV7 1441 aa25.75■■□□□ 1.71
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Baz1bQ9Z277 1479 aa25.75■■□□□ 1.71
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Calr4Q3TQS0 420 aa25.75■■□□□ 1.71
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa25.74■■□□□ 1.71
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Slc24a1Q91WD8 1130 aa25.72■■□□□ 1.71
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Ccdc18Q640L5 1455 aa25.69■■□□□ 1.7
Tmod1-201ENSMUST00000107773 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.8 ms