RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101395.2

Hoxa4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa4, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa61.38■■■■■ 7.42
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dcaf1Q80TR8 1506 aa54.7■■■■■ 6.35
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 NacadQ5SWP3 1504 aa54.27■■■■■ 6.28
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kdm5dQ62240 1548 aa54.25■■■■■ 6.27
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rhox8Q6VSS7 320 aa54.25■■■■■ 6.27
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa53.44■■■■■ 6.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccdc180J3QNE4 1664 aa53.13■■■■■ 6.1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sycp2Q9CUU3 1500 aa53.11■■■■■ 6.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Baz1aO88379 1555 aa52.86■■■■■ 6.05
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Crybg2B7ZCC2 1516 aa52.59■■■■■ 6.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rtl1Q7M732 1744 aa52.06■■■■■ 5.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 BicraF8VPZ9 1578 aa52.03■■■■■ 5.92
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa50.48■■■■■ 5.67
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Synj1Q8CHC4 1574 aa49.77■■■■■ 5.56
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa49.7■■■■■ 5.55
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Wdr62Q3U3T8 1523 aa49.21■■■■■ 5.47
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Frmpd1A2AKB4 1549 aa49.12■■■■■ 5.45
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Top2bQ64511 1612 aa48.6■■■■■ 5.37
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa48.58■■■■■ 5.37
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fam135aQ6NS59 1506 aa48.58■■■■■ 5.37
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 HrcG5E8J6 738 aa48.55■■■■■ 5.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cngb1E1AZ71 1325 aa48.53■■■■■ 5.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Unc13aQ4KUS2 1712 aa48.37■■■■■ 5.33
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Baz1bQ9Z277 1479 aa48.29■■■■■ 5.32
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa48.28■■■■■ 5.32
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fmn1Q05860 1466 aa48.07■■■■■ 5.29
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lamc3Q9R0B6 1581 aa48.02■■■■■ 5.28
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ubl4bQ9CQ84 188 aa48■■■■■ 5.28
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 TnnQ80Z71 1560 aa47.92■■■■■ 5.26
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kif15Q6P9L6 1387 aa47.87■■■■■ 5.25
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa47.84■■■■■ 5.25
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cep164Q5DU05 1446 aa47.75■■■■■ 5.24
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Chic1Q8CBW7 227 aa47.65■■■■■ 5.22
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cux2P70298 1426 aa47.51■■■■■ 5.2
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mrc2Q64449 1479 aa47.46■■■■■ 5.19
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP47.4■■■■■ 5.18
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccdc18Q640L5 1455 aa47.35■■■■■ 5.17
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Camsap1A2AHC3 1581 aa47.29■■■■■ 5.16
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Il27Q8K3I6 234 aa46.98■■■■■ 5.11
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Grin2bQ01097 1482 aa46.82■■■■■ 5.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 NrkQ9R0G8 1455 aa46.76■■■■■ 5.08
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kif21aQ9QXL2 1672 aa46.71■■■■■ 5.07
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gab3Q8BSM5 595 aa46.69■■■■■ 5.07
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP46.63■■■■■ 5.06
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa46.6■■■■■ 5.05
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Shroom4Q1W617 1475 aa46.55■■■■■ 5.04
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Efcab5A0JP43 1406 aa46.54■■■■■ 5.04
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Duox2A2AQ99 1517 aa46.48■■■■■ 5.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PtprkP35822 1457 aa46.41■■■■■ 5.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Crocc2F6XLV1 1638 aa46.4■■■■■ 5.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Npm2Q80W85 207 aa46.31■■■■■ 5
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cep162Q6ZQ06 1403 aa46.23■■■■■ 4.99
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa46.2■■■■■ 4.99
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Plb1Q3TTY0 1478 aa46.14■■■■■ 4.98
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP46.13■■■■■ 4.97
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP46.12■■■■■ 4.97
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Map3k1P53349 1493 aa46.04■■■■■ 4.96
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa46■■■■■ 4.96
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ift140E9PY46 1464 aa45.95■■■■■ 4.95
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 SynmQ70IV5 1561 aa45.84■■■■■ 4.93
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP45.64■■■■■ 4.9
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP45.58■■■■■ 4.89
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa45.47■■■■■ 4.87
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