RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000064190.12

Rai1-201, Transcript of Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rai1, Length 7,348 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1-201ENSMUST00000064190 Rhox8Q6VSS7 320 aa27.91■■■□□ 2.06
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Rai1-201ENSMUST00000064190 Cngb1E1AZ71 1325 aa25.72■■□□□ 1.71
Rai1-201ENSMUST00000064190 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
Rai1-201ENSMUST00000064190 Wdr66E9Q743 1299 aa25.54■■□□□ 1.68
Rai1-201ENSMUST00000064190 Amer1Q7TS75 1132 aa25.45■■□□□ 1.66
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ube2uB1AUC4 352 aa25.43■■□□□ 1.66
Rai1-201ENSMUST00000064190 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
Rai1-201ENSMUST00000064190 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa25.31■■□□□ 1.64
Rai1-201ENSMUST00000064190 Zeb1Q64318 1117 aa25.07■■□□□ 1.6
Rai1-201ENSMUST00000064190 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
Rai1-201ENSMUST00000064190 Gab3Q8BSM5 595 aa24.5■■□□□ 1.51
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa24.48■■□□□ 1.51
Rai1-201ENSMUST00000064190 Slc24a1Q91WD8 1130 aa24.45■■□□□ 1.5
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa24.44■■□□□ 1.5
Rai1-201ENSMUST00000064190 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa24.37■■□□□ 1.49
Rai1-201ENSMUST00000064190 Npm2Q80W85 207 aa24.36■■□□□ 1.49
Rai1-201ENSMUST00000064190 Myt1lP97500 1187 aa24.29■■□□□ 1.48
Rai1-201ENSMUST00000064190 CenpbP27790 599 aa24.17■■□□□ 1.46
Rai1-201ENSMUST00000064190 4933416C03RikQ3V063 378 aa23.95■■□□□ 1.42
Rai1-201ENSMUST00000064190 UbtfP25976 765 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
Rai1-201ENSMUST00000064190 Stra8P70278 393 aa23.64■■□□□ 1.38
Rai1-201ENSMUST00000064190 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
Rai1-201ENSMUST00000064190 Trim41Q5NCC3 630 aa23.51■■□□□ 1.35
Rai1-201ENSMUST00000064190 Neurod1Q60867 357 aa23.43■■□□□ 1.34
Rai1-201ENSMUST00000064190 Os9Q8K2C7 672 aa23.32■■□□□ 1.32
Rai1-201ENSMUST00000064190 NeflP08551 543 aa23.3■■□□□ 1.32
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa23.27■■□□□ 1.32
Rai1-201ENSMUST00000064190 NrdcQ8BHG1 1161 aa23.25■■□□□ 1.31
Rai1-201ENSMUST00000064190 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
Rai1-201ENSMUST00000064190 NefmP08553 848 aa23.12■■□□□ 1.29
Rai1-201ENSMUST00000064190 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa23.05■■□□□ 1.28
Rai1-201ENSMUST00000064190 Il27Q8K3I6 234 aa23.04■■□□□ 1.28
Rai1-201ENSMUST00000064190 Myt1Q8CFC2 1127 aa23.03■■□□□ 1.28
Rai1-201ENSMUST00000064190 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
Rai1-201ENSMUST00000064190 HrcG5E8J6 738 aa23.01■■□□□ 1.27
Rai1-201ENSMUST00000064190 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
Rai1-201ENSMUST00000064190 NclP09405 707 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
Rai1-201ENSMUST00000064190 Chic1Q8CBW7 227 aa22.95■■□□□ 1.26
Rai1-201ENSMUST00000064190 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa22.79■■□□□ 1.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Tnnt3Q9QZ47 272 aa22.74■■□□□ 1.23
Rai1-201ENSMUST00000064190 DaxxO35613 739 aa22.7■■□□□ 1.22
Rai1-201ENSMUST00000064190 ArxO35085 564 aa22.69■■□□□ 1.22
Rai1-201ENSMUST00000064190 CatipB9EKE5 520 aa22.6■■□□□ 1.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Zbtb4Q5F293 982 aa22.58■■□□□ 1.2
Rai1-201ENSMUST00000064190 Pcgf6Q99NA9 353 aa22.58■■□□□ 1.2
Rai1-201ENSMUST00000064190 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa22.54■■□□□ 1.2
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
Rai1-201ENSMUST00000064190 Polr3glQ8R0C0 218 aa22.52■■□□□ 1.2
Rai1-201ENSMUST00000064190 Gm13697A2AK42 830 aa22.47■■□□□ 1.19
Rai1-201ENSMUST00000064190 Lmod3E9QA62 571 aa22.39■■□□□ 1.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Atp1b4Q99ME6 356 aa22.39■■□□□ 1.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa22.36■■□□□ 1.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Rtl5Q5DTT4 599 aa22.31■■□□□ 1.16
Rai1-201ENSMUST00000064190 NischQ80TM9 1593 aa22.3■■□□□ 1.16
Rai1-201ENSMUST00000064190 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
Rai1-201ENSMUST00000064190 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
Rai1-201ENSMUST00000064190 TonslQ6NZL6 1363 aa22.28■■□□□ 1.16
Rai1-201ENSMUST00000064190 Nlrp6Q91WS2 869 aa22.26■■□□□ 1.15
Rai1-201ENSMUST00000064190 Plppr3Q7TPB0 716 aa22.24■■□□□ 1.15
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ccdc180J3QNE4 1664 aa22.23■■□□□ 1.15
Rai1-201ENSMUST00000064190 Erich6D3Z6S9 713 aa22.22■■□□□ 1.15
Rai1-201ENSMUST00000064190 Csrnp3P59055 597 aa22.19■■□□□ 1.14
Rai1-201ENSMUST00000064190 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa22.17■■□□□ 1.14
Rai1-201ENSMUST00000064190 Gm38655A0A286YDK6 273 aa22.17■■□□□ 1.14
Rai1-201ENSMUST00000064190 Gm13695A2AK44 830 aa22.07■■□□□ 1.12
Rai1-201ENSMUST00000064190 Vsig10D3YX43 558 aa22.05■■□□□ 1.12
Rai1-201ENSMUST00000064190 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
Rai1-201ENSMUST00000064190 Lmod2Q3UHZ5 550 aa22.02■■□□□ 1.12
Rai1-201ENSMUST00000064190 Anp32aO35381 247 aa22■■□□□ 1.11
Rai1-201ENSMUST00000064190 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
Rai1-201ENSMUST00000064190 Rtl1Q7M732 1744 aa21.9■■□□□ 1.1
Rai1-201ENSMUST00000064190 Mier1Q5UAK0 511 aa21.85■■□□□ 1.09
Rai1-201ENSMUST00000064190 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
Rai1-201ENSMUST00000064190 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
Rai1-201ENSMUST00000064190 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa21.74■■□□□ 1.07
Rai1-201ENSMUST00000064190 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa21.71■■□□□ 1.07
Rai1-201ENSMUST00000064190 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
Rai1-201ENSMUST00000064190 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa21.63■■□□□ 1.05
Rai1-201ENSMUST00000064190 Irx6Q9ER75 438 aa21.6■■□□□ 1.05
Rai1-201ENSMUST00000064190 Trim26Q99PN3 545 aa21.56■■□□□ 1.04
Rai1-201ENSMUST00000064190 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
Rai1-201ENSMUST00000064190 Znf326O88291 580 aa21.54■■□□□ 1.04
Rai1-201ENSMUST00000064190 Eid3Q3V124 375 aa21.53■■□□□ 1.04
Rai1-201ENSMUST00000064190 ClspnQ80YR7 1315 aa21.53■■□□□ 1.04
Rai1-201ENSMUST00000064190 Fgd1P52734 960 aa21.49■■□□□ 1.03
Rai1-201ENSMUST00000064190 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
Rai1-201ENSMUST00000064190 Trim44Q9QXA7 346 aa21.48■■□□□ 1.03
Rai1-201ENSMUST00000064190 Abcc9P70170 1546 aa21.47■■□□□ 1.03
Rai1-201ENSMUST00000064190 Clstn1Q9EPL2 979 aa21.44■■□□□ 1.02
Rai1-201ENSMUST00000064190 Calr4Q3TQS0 420 aa21.37■■□□□ 1.01
Rai1-201ENSMUST00000064190 PtmaP26350 111 aa21.34■■□□□ 1.01
Rai1-201ENSMUST00000064190 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
Rai1-201ENSMUST00000064190 P3h3Q8CG70 732 aa21.31■■□□□ 1
Rai1-201ENSMUST00000064190 Znf316Q6PGE4 1016 aa21.29■■□□□ 1
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