RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000037646.8

Prdm4-201, Transcript of PR domain zinc finger protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Prdm4, Length 3,877 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Rhox8Q6VSS7 320 aa27.11■■□□□ 1.93
Prdm4-201ENSMUST00000037646 NischQ80TM9 1593 aa26.75■■□□□ 1.87
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Abcc9P70170 1546 aa25.59■■□□□ 1.69
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa25.02■■□□□ 1.6
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Abcc8B2RUS7 1588 aa25■■□□□ 1.59
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa24.93■■□□□ 1.58
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa24.93■■□□□ 1.58
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Ccdc180J3QNE4 1664 aa24.78■■□□□ 1.56
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Rtl1Q7M732 1744 aa24.72■■□□□ 1.55
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Trim41Q5NCC3 630 aa24.28■■□□□ 1.48
Prdm4-201ENSMUST00000037646 HrcG5E8J6 738 aa24.13■■□□□ 1.45
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Gab3Q8BSM5 595 aa23.97■■□□□ 1.43
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Pcgf6Q99NA9 353 aa23.94■■□□□ 1.42
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Cngb1E1AZ71 1325 aa23.89■■□□□ 1.42
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Zeb1Q64318 1117 aa23.77■■□□□ 1.4
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Prdm4-201ENSMUST00000037646 Dcaf1Q80TR8 1506 aa23.51■■□□□ 1.35
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa23.48■■□□□ 1.35
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Wdr66E9Q743 1299 aa23.23■■□□□ 1.31
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Chic1Q8CBW7 227 aa23.2■■□□□ 1.3
Prdm4-201ENSMUST00000037646 UbtfP25976 765 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
Prdm4-201ENSMUST00000037646 NefmP08553 848 aa23.09■■□□□ 1.29
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Myt1lP97500 1187 aa23.08■■□□□ 1.29
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Mier1Q5UAK0 511 aa23.08■■□□□ 1.28
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Cep164Q5DU05 1446 aa23.06■■□□□ 1.28
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Baz1aO88379 1555 aa23.05■■□□□ 1.28
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Neurod1Q60867 357 aa22.98■■□□□ 1.27
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa22.95■■□□□ 1.26
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Kdm5dQ62240 1548 aa22.92■■□□□ 1.26
Prdm4-201ENSMUST00000037646 ScribQ80U72 1612 aa22.89■■□□□ 1.25
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Npm2Q80W85 207 aa22.83■■□□□ 1.24
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Sall2Q9QX96 1004 aa22.81■■□□□ 1.24
Prdm4-201ENSMUST00000037646 NacadQ5SWP3 1504 aa22.74■■□□□ 1.23
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa22.5■■□□□ 1.19
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa22.4■■□□□ 1.18
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Csrnp3P59055 597 aa22.38■■□□□ 1.17
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Smarca2Q6DIC0 1577 aa22.37■■□□□ 1.17
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Golga3P55937 1487 aa22.37■■□□□ 1.17
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa22.36■■□□□ 1.17
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Il27Q8K3I6 234 aa22.33■■□□□ 1.16
Prdm4-201ENSMUST00000037646 TonslQ6NZL6 1363 aa22.31■■□□□ 1.16
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa22.26■■□□□ 1.15
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Gm38655A0A286YDK6 273 aa22.24■■□□□ 1.15
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Anks4bQ8K3X6 423 aa22.24■■□□□ 1.15
Prdm4-201ENSMUST00000037646 ClspnQ80YR7 1315 aa22.22■■□□□ 1.15
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Eid3Q3V124 375 aa22.16■■□□□ 1.14
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Crybg2B7ZCC2 1516 aa22.15■■□□□ 1.14
Prdm4-201ENSMUST00000037646 CenpbP27790 599 aa22.14■■□□□ 1.13
Prdm4-201ENSMUST00000037646 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa22.14■■□□□ 1.13
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Sycp2Q9CUU3 1500 aa22.11■■□□□ 1.13
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa22.05■■□□□ 1.12
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Ube2uB1AUC4 352 aa22.05■■□□□ 1.12
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Clip1Q922J3 1391 aa22.05■■□□□ 1.12
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Synj1Q8CHC4 1574 aa21.99■■□□□ 1.11
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
Prdm4-201ENSMUST00000037646 CftrP26361 1476 aa21.88■■□□□ 1.09
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Slc24a1Q91WD8 1130 aa21.88■■□□□ 1.09
Prdm4-201ENSMUST00000037646 NclP09405 707 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Lmod2Q3UHZ5 550 aa21.83■■□□□ 1.08
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Cep162Q6ZQ06 1403 aa21.76■■□□□ 1.07
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Aplp2Q06335 707 aa21.74■■□□□ 1.07
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa21.67■■□□□ 1.06
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Tnnt3Q9QZ47 272 aa21.58■■□□□ 1.05
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Fmn1Q05860 1466 aa21.58■■□□□ 1.05
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Setd5Q5XJV7 1441 aa21.55■■□□□ 1.04
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Stra8P70278 393 aa21.53■■□□□ 1.04
Prdm4-201ENSMUST00000037646 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa21.52■■□□□ 1.03
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
Prdm4-201ENSMUST00000037646 BlmO88700 1416 aa21.49■■□□□ 1.03
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa21.43■■□□□ 1.02
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Eea1Q8BL66 1411 aa21.43■■□□□ 1.02
Prdm4-201ENSMUST00000037646 BicraF8VPZ9 1578 aa21.39■■□□□ 1.01
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Myt1Q8CFC2 1127 aa21.37■■□□□ 1.01
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Top2bQ64511 1612 aa21.35■■□□□ 1.01
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Fam71e1A1L3C1 212 aa21.34■■□□□ 1.01
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Kif15Q6P9L6 1387 aa21.33■■□□□ 1.01
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Chic2Q9D9G3 165 aa21.29■■□□□ 1
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Anp32aO35381 247 aa21.18■□□□□ 0.98
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa21.15■□□□□ 0.98
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Calr4Q3TQS0 420 aa21.14■□□□□ 0.98
Prdm4-201ENSMUST00000037646 NrdcQ8BHG1 1161 aa21.14■□□□□ 0.97
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
Prdm4-201ENSMUST00000037646 Ubl4bQ9CQ84 188 aa21.09■□□□□ 0.97
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