RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025393.13

Smad4-201, Transcript of Mothers against decapentaplegic homolog 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Smad4, Length 3,384 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad4-201ENSMUST00000025393 NischQ80TM9 1593 aa37.59■■■■□ 3.61
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Abcc8B2RUS7 1588 aa35.58■■■■□ 3.29
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Pcgf6Q99NA9 353 aa32.95■■■□□ 2.87
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Kdm5dQ62240 1548 aa32.65■■■□□ 2.82
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Sycp2Q9CUU3 1500 aa31.54■■■□□ 2.64
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Crybg2B7ZCC2 1516 aa31.47■■■□□ 2.63
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Wdr66E9Q743 1299 aa31.01■■■□□ 2.55
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Csrnp3P59055 597 aa30.93■■■□□ 2.54
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Synj1Q8CHC4 1574 aa30.92■■■□□ 2.54
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Smad4-201ENSMUST00000025393 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa30.85■■■□□ 2.53
Smad4-201ENSMUST00000025393 Golga3P55937 1487 aa30.84■■■□□ 2.53
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Gm38655A0A286YDK6 273 aa30.63■■■□□ 2.49
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Smad4-201ENSMUST00000025393 ClspnQ80YR7 1315 aa29.94■■■□□ 2.38
Smad4-201ENSMUST00000025393 Fmn1Q05860 1466 aa29.9■■■□□ 2.38
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Il27Q8K3I6 234 aa29.8■■■□□ 2.36
Smad4-201ENSMUST00000025393 Cep162Q6ZQ06 1403 aa29.79■■■□□ 2.36
Smad4-201ENSMUST00000025393 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
Smad4-201ENSMUST00000025393 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa29.75■■■□□ 2.35
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Myt1Q8CFC2 1127 aa29.67■■■□□ 2.34
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Smad4-201ENSMUST00000025393 Lmod2Q3UHZ5 550 aa28.95■■■□□ 2.22
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