RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020718.9

Smtn-201, Transcript of Smoothelin, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Smtn, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smtn-201ENSMUST00000020718 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa33.42■■■□□ 2.94
Smtn-201ENSMUST00000020718 NischQ80TM9 1593 aa33.38■■■□□ 2.93
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Smtn-201ENSMUST00000020718 Abcc8B2RUS7 1588 aa31.96■■■□□ 2.71
Smtn-201ENSMUST00000020718 ScribQ80U72 1612 aa30.21■■■□□ 2.43
Smtn-201ENSMUST00000020718 Rhox8Q6VSS7 320 aa29.81■■■□□ 2.36
Smtn-201ENSMUST00000020718 Dcaf1Q80TR8 1506 aa29.79■■■□□ 2.36
Smtn-201ENSMUST00000020718 Kdm5dQ62240 1548 aa29.46■■■□□ 2.31
Smtn-201ENSMUST00000020718 NacadQ5SWP3 1504 aa29.42■■■□□ 2.3
Smtn-201ENSMUST00000020718 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa29.2■■■□□ 2.26
Smtn-201ENSMUST00000020718 Ccdc180J3QNE4 1664 aa29.08■■■□□ 2.25
Smtn-201ENSMUST00000020718 Rtl1Q7M732 1744 aa28.99■■■□□ 2.23
Smtn-201ENSMUST00000020718 Baz1aO88379 1555 aa28.86■■■□□ 2.21
Smtn-201ENSMUST00000020718 Sycp2Q9CUU3 1500 aa28.78■■■□□ 2.2
Smtn-201ENSMUST00000020718 Crybg2B7ZCC2 1516 aa28.61■■■□□ 2.17
Smtn-201ENSMUST00000020718 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
Smtn-201ENSMUST00000020718 BicraF8VPZ9 1578 aa28.19■■■□□ 2.1
Smtn-201ENSMUST00000020718 Smarca2Q6DIC0 1577 aa28.13■■■□□ 2.09
Smtn-201ENSMUST00000020718 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa27.7■■■□□ 2.03
Smtn-201ENSMUST00000020718 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa27.54■■■□□ 2
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Smtn-201ENSMUST00000020718 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
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Smtn-201ENSMUST00000020718 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
Smtn-201ENSMUST00000020718 Synj1Q8CHC4 1574 aa27.2■■□□□ 1.94
Smtn-201ENSMUST00000020718 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
Smtn-201ENSMUST00000020718 CftrP26361 1476 aa27.15■■□□□ 1.94
Smtn-201ENSMUST00000020718 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa27.14■■□□□ 1.94
Smtn-201ENSMUST00000020718 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa27.07■■□□□ 1.92
Smtn-201ENSMUST00000020718 HrcG5E8J6 738 aa26.87■■□□□ 1.89
Smtn-201ENSMUST00000020718 Golga3P55937 1487 aa26.79■■□□□ 1.88
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Smtn-201ENSMUST00000020718 Ercc6F8VPZ5 1481 aa26.69■■□□□ 1.86
Smtn-201ENSMUST00000020718 Wdr62Q3U3T8 1523 aa26.67■■□□□ 1.86
Smtn-201ENSMUST00000020718 Top2bQ64511 1612 aa26.65■■□□□ 1.86
Smtn-201ENSMUST00000020718 Cngb1E1AZ71 1325 aa26.62■■□□□ 1.85
Smtn-201ENSMUST00000020718 Frmpd1A2AKB4 1549 aa26.61■■□□□ 1.85
Smtn-201ENSMUST00000020718 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
Smtn-201ENSMUST00000020718 Cep164Q5DU05 1446 aa26.4■■□□□ 1.82
Smtn-201ENSMUST00000020718 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa26.35■■□□□ 1.81
Smtn-201ENSMUST00000020718 Unc13aQ4KUS2 1712 aa26.34■■□□□ 1.81
Smtn-201ENSMUST00000020718 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
Smtn-201ENSMUST00000020718 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa26.3■■□□□ 1.8
Smtn-201ENSMUST00000020718 Fmn1Q05860 1466 aa26.29■■□□□ 1.8
Smtn-201ENSMUST00000020718 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
Smtn-201ENSMUST00000020718 Fam135aQ6NS59 1506 aa26.21■■□□□ 1.79
Smtn-201ENSMUST00000020718 Chic1Q8CBW7 227 aa26.2■■□□□ 1.79
Smtn-201ENSMUST00000020718 TnnQ80Z71 1560 aa26.17■■□□□ 1.78
Smtn-201ENSMUST00000020718 Lamc3Q9R0B6 1581 aa26.15■■□□□ 1.78
Smtn-201ENSMUST00000020718 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
Smtn-201ENSMUST00000020718 Kif15Q6P9L6 1387 aa26■■□□□ 1.75
Smtn-201ENSMUST00000020718 Baz1bQ9Z277 1479 aa25.98■■□□□ 1.75
Smtn-201ENSMUST00000020718 Ubl4bQ9CQ84 188 aa25.91■■□□□ 1.74
Smtn-201ENSMUST00000020718 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa25.8■■□□□ 1.72
Smtn-201ENSMUST00000020718 Camsap1A2AHC3 1581 aa25.79■■□□□ 1.72
Smtn-201ENSMUST00000020718 Ccdc18Q640L5 1455 aa25.76■■□□□ 1.71
Smtn-201ENSMUST00000020718 Cux2P70298 1426 aa25.75■■□□□ 1.71
Smtn-201ENSMUST00000020718 Gab3Q8BSM5 595 aa25.75■■□□□ 1.71
Smtn-201ENSMUST00000020718 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa25.63■■□□□ 1.69
Smtn-201ENSMUST00000020718 Mrc2Q64449 1479 aa25.6■■□□□ 1.69
Smtn-201ENSMUST00000020718 Il27Q8K3I6 234 aa25.57■■□□□ 1.68
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Smtn-201ENSMUST00000020718 Grin2bQ01097 1482 aa25.52■■□□□ 1.68
Smtn-201ENSMUST00000020718 NrkQ9R0G8 1455 aa25.52■■□□□ 1.68
Smtn-201ENSMUST00000020718 Shroom4Q1W617 1475 aa25.45■■□□□ 1.66
Smtn-201ENSMUST00000020718 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
Smtn-201ENSMUST00000020718 Cep162Q6ZQ06 1403 aa25.41■■□□□ 1.66
Smtn-201ENSMUST00000020718 Npm2Q80W85 207 aa25.39■■□□□ 1.65
Smtn-201ENSMUST00000020718 PtprkP35822 1457 aa25.38■■□□□ 1.65
Smtn-201ENSMUST00000020718 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
Smtn-201ENSMUST00000020718 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
Smtn-201ENSMUST00000020718 Kif21aQ9QXL2 1672 aa25.35■■□□□ 1.65
Smtn-201ENSMUST00000020718 Efcab5A0JP43 1406 aa25.31■■□□□ 1.64
Smtn-201ENSMUST00000020718 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
Smtn-201ENSMUST00000020718 Duox2A2AQ99 1517 aa25.28■■□□□ 1.64
Smtn-201ENSMUST00000020718 Arhgap35Q91YM2 1499 aa25.23■■□□□ 1.63
Smtn-201ENSMUST00000020718 Crocc2F6XLV1 1638 aa25.22■■□□□ 1.63
Smtn-201ENSMUST00000020718 Map3k1P53349 1493 aa25.21■■□□□ 1.63
Smtn-201ENSMUST00000020718 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa25.15■■□□□ 1.62
Smtn-201ENSMUST00000020718 Myt1lP97500 1187 aa25.1■■□□□ 1.61
Smtn-201ENSMUST00000020718 Samd9lQ69Z37 1561 aa25.1■■□□□ 1.61
Smtn-201ENSMUST00000020718 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
Smtn-201ENSMUST00000020718 Zeb1Q64318 1117 aa25.04■■□□□ 1.6
Smtn-201ENSMUST00000020718 SynmQ70IV5 1561 aa25.02■■□□□ 1.6
Smtn-201ENSMUST00000020718 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
Smtn-201ENSMUST00000020718 Clip1Q922J3 1391 aa24.99■■□□□ 1.59
Smtn-201ENSMUST00000020718 Plb1Q3TTY0 1478 aa24.99■■□□□ 1.59
Smtn-201ENSMUST00000020718 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa24.98■■□□□ 1.59
Smtn-201ENSMUST00000020718 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
Smtn-201ENSMUST00000020718 Carmil1Q6EDY6 1374 aa24.92■■□□□ 1.58
Smtn-201ENSMUST00000020718 Rad54l2Q99NG0 1466 aa24.88■■□□□ 1.57
Smtn-201ENSMUST00000020718 Ift140E9PY46 1464 aa24.87■■□□□ 1.57
Smtn-201ENSMUST00000020718 Eea1Q8BL66 1411 aa24.84■■□□□ 1.57
Smtn-201ENSMUST00000020718 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
Smtn-201ENSMUST00000020718 Disp1Q3TDN0 1521 aa24.82■■□□□ 1.56
Smtn-201ENSMUST00000020718 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
Smtn-201ENSMUST00000020718 Magi3Q9EQJ9 1476 aa24.8■■□□□ 1.56
Smtn-201ENSMUST00000020718 Erich3F6QRE9 1637 aa24.79■■□□□ 1.56
Smtn-201ENSMUST00000020718 Pla2r1Q62028 1487 aa24.78■■□□□ 1.56
Smtn-201ENSMUST00000020718 Grin2aP35436 1464 aa24.77■■□□□ 1.56
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