RNA–Protein interactions for RNA: YMR196W

YMR196W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR196W, Length 3,267 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR196WYMR196W RPS9BP05755 195 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W NPR3P38742 1146 aa5.27□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W RPT6Q01939 405 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W ATG20Q07528 640 aa5.27□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W PCL8Q08966 492 aa5.27□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W SRP54P20424 541 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W GET3Q12154 354 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data5.27□□□□□ -1.57not detected
YMR196WYMR196W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W MCM4P30665 933 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W RSC8P43609 557 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W ALG2P43636 503 aa5.26□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W TAN1P53072 289 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W SKG3Q06315 1026 aa5.26□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W VPS5Q92331 675 aa5.26□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W TRS33Q99394 268 aa5.26□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W GPA1P08539 472 aa5.26□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W SRM1P21827 482 aa5.26□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W PRE8P23639 250 aa5.26□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W CHS3P29465 1165 aa5.26□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W VPS8P39702 1274 aa5.26□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W YPT11P48559 417 aa5.26□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W VID30P53076 958 aa5.26□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W CRF1Q04930 467 aa5.26□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W YDL121CQ07541 149 aa5.26□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W MET6P05694 767 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W URA1P28272 314 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W TOM20P35180 183 aa5.26□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W BLI1P35727 113 aa5.26□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W YER130CP39959 443 aa5.26□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W SSL2Q00578 843 aa5.26□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W MSM1P22438 575 aa5.25□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data5.25□□□□□ -1.57not detected
YMR196WYMR196W YGL138CP53122 345 aa5.25□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W HXK1P04806 485 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W KIN1P13185 1064 aa5.25□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W ACE2P21192 770 aa5.25□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W NOC2P39744 710 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W TRM44Q02648 567 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W YPR172WQ06608 200 aa5.25□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W PTC5Q12511 572 aa5.25□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W TUS1Q06412 1307 aa5.24□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W ATE1P16639 503 aa5.24□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W RGP1P16664 663 aa5.24□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W RPL8BP29453 256 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W LTV1P34078 463 aa5.24□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W DSE3Q08729 430 aa5.24□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data5.24□□□□□ -1.57not detected
YMR196WYMR196W MSH3P25336 1018 aa5.24□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W ADP1P25371 1049 aa5.24□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W OCA5P38738 679 aa5.24□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W CUE3P53137 624 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W FPK1P53739 893 aa5.24□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W FOL1P53848 824 aa5.24□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W VPS30Q02948 557 aa5.24□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W HSP42Q12329 375 aa5.24□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W NUC1P08466 329 aa5.24□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W MCM3P24279 971 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W SIC1P38634 284 aa5.24□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W SQS1P53866 767 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W YAF9P53930 226 aa5.24□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W MDM1Q01846 1127 aa5.24□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W VMA4P22203 233 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W SRP40P32583 406 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W GLC3P32775 704 aa5.23□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W MFT1P33441 392 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W BYE1P36106 594 aa5.23□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W MRPL10P36520 322 aa5.23□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W TOM71P38825 639 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W FYV10P40492 516 aa5.23□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W YGR117CP53270 476 aa5.23□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W NAF1P53919 492 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W TMA64Q04600 565 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W SGD1Q06132 899 aa5.23□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W CEX1Q12453 761 aa5.23□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W RAD53P22216 821 aa5.23□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W YKT6P36015 200 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W KEL1P38853 1164 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W LYS14P40971 790 aa5.23□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W GIS4Q04233 774 aa5.23□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W VMS1Q04311 632 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W CIT1P00890 479 aa5.22□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W MCM2P29469 868 aa5.22□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W DEP1P31385 405 aa5.22□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W FET4P40988 552 aa5.22□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W HOS2P53096 452 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W AAD16Q02895 342 aa5.22□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W CSC1Q06538 782 aa5.22□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W PUS1Q12211 544 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data5.22□□□□□ -1.57not detected
YMR196WYMR196W YLR278CQ05854 1341 aa5.22□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa5.22□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W TUB2P02557 457 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W PMA1P05030 918 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W RPL22AP05749 121 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W HPR1P17629 752 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
YMR196WYMR196W RPL5P26321 297 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 73.9 ms