RNA–Protein interactions for RNA: YJL192C

SOP4, Transcript of ER-membrane protein, yeast

Gene SOP4, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOP4	YJL192C	THI13	Q07748	340 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	TY2B-C	P25384	1770 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	PAN1	P32521	1480 aa		5	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	SRB8	P25648	1427 aa		5	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	SLS1	P42900	643 aa		5	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	AVT1	P47082	602 aa		5	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	YCS4	Q06156	1176 aa		5	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	PPX1	P38698	397 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	NEM1	P38757	446 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	DAK2	P43550	591 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	CIT3	P43635	486 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	YGR045C	P53229	120 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	DAL4	Q04895	635 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	TY2B-B	Q12491	1770 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	IPL1	P38991	367 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	PEX13	P80667	386 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	YBT1	P32386	1661 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	TSC11	P40061	1430 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	GCN2	P15442	1659 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	ALT1	P52893	592 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	RCM1	P53972	490 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	AVO1	Q08236	1176 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	SPT7	P35177	1332 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SOP4	YJL192C	NUP159	P40477	1460 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	MSH3	P25336	1018 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	NFS1	P25374	497 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	LRG1	P35688	1017 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	YKL077W	P36081	392 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	FAA3	P39002	694 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	RSM26	P47141	266 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	ULP1	Q02724	621 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	NSI1	Q12457	570 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	TY1B-H	O13535	1793 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	TY1B-LR3	P0C2I6	1755 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	TY1B-PR2	P0C2J0	1756 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	VPS35	P34110	944 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	SHU2	P38957	223 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	XKS1	P42826	600 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	YVC1	Q12324	675 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	SQT1	P35184	431 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	YAR028W	P39548	234 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	YNR063W	P53749	607 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	HSP78	P33416	811 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	SEG2	P34250	1132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	PEX28	P38848	579 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	TPP1	Q03796	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	RNQ1	P25367	405 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	NNK1	P36003	928 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	IRC24	P40580	263 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	SSY1	Q03770	852 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	DNF1	P32660	1571 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOP4	YJL192C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SOP4	YJL192C	SEC20	P28791	383 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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